More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0384 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_27960  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  67.06 
 
 		 512 aa  675    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.887259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0839  ABC transporter related  64.33 
 
 		 515 aa  642    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500489  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2514  ABC transporter related protein  66.73 
 
 		 518 aa  665    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2519  ABC transporter related protein  67.46 
 
 		 515 aa  674    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.760037  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3402  ABC transporter related protein  65.28 
 
 		 522 aa  645    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.146962 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1104  ABC transporter related  68.97 
 
 		 519 aa  703    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296869  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29470  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  63.99 
 
 		 513 aa  653    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0384  ABC transporter related  100 
 
 		 509 aa  1019    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0503  ABC transporter related  66.67 
 
 		 508 aa  672    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.689531  normal  0.17522 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0257  ABC transporter related protein  66.34 
 
 		 516 aa  654    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.391608  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1865  ABC transporter related  69.7 
 
 		 508 aa  697    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.251568  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1181  ABC transporter related  69.23 
 
 		 520 aa  711    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000288216 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4718  ABC transporter related  64.76 
 
 		 564 aa  649    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0239  ABC transporter related protein  66.14 
 
 		 512 aa  655    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.301252  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2945  ABC transporter related  64.89 
 
 		 541 aa  644    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.854224 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2997  ABC transporter related  62.7 
 
 		 519 aa  630  1e-179  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.746869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0405  ABC transporter related protein  63.17 
 
 		 514 aa  625  1e-178  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.251912  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3660  ABC transporter related  60.52 
 
 		 512 aa  621  1e-177  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0614  ABC transporter related  63 
 
 		 511 aa  615  1e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2890  ABC transporter related protein  63.56 
 
 		 516 aa  612  9.999999999999999e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0580102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2686  ABC transporter related  59.92 
 
 		 516 aa  614  9.999999999999999e-175  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1986  ABC transporter related  57.76 
 
 		 511 aa  597  1e-169  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1046  ABC transporter related  60.99 
 
 		 521 aa  596  1e-169  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1860  xylose ABC transporter ATPase  58.7 
 
 		 517 aa  589  1e-167  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.05268  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3073  ABC transporter related  59.04 
 
 		 511 aa  588  1e-167  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.697432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2746  ABC transporter related  60.2 
 
 		 524 aa  588  1e-167  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.565066 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3199  ABC transporter-related protein  61.4 
 
 		 507 aa  587  1e-166  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.28101 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4474  ABC transporter related  58.96 
 
 		 511 aa  585  1e-166  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.882977  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3174  ABC transporter related  58.37 
 
 		 512 aa  578  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2913  ABC transporter related  58.76 
 
 		 512 aa  581  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.169153  normal  0.630322 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3905  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  58.38 
 
 		 504 aa  575  1.0000000000000001e-163  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.876803  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4109  ABC transporter related  58.5 
 
 		 512 aa  574  1.0000000000000001e-162  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000359898 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2253  ABC transporter-related protein  59.96 
 
 		 505 aa  568  1e-161  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000512006 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2138  L-arabinose transport ATP-binding protein araG  58.23 
 
 		 516 aa  570  1e-161  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.960653  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0757  ABC transporter related protein  59.37 
 
 		 525 aa  571  1e-161  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0933075  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0936  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  58.57 
 
 		 529 aa  564  1.0000000000000001e-159  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.411664  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0738  ABC transporter related  59.04 
 
 		 505 aa  562  1.0000000000000001e-159  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0878  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  58.57 
 
 		 529 aa  564  1.0000000000000001e-159  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.459343  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1425  ABC transporter related  58 
 
 		 530 aa  559  1e-158  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.577416  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1586  ABC transporter related  55.38 
 
 		 513 aa  541  9.999999999999999e-153  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.192443  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1667  ABC transporter related  52.58 
 
 		 507 aa  528  1e-149  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.2144  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2577  ABC transporter related  54.78 
 
 		 507 aa  530  1e-149  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.589076 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2021  xylose transporter ATP-binding subunit  52.07 
 
 		 504 aa  499  1e-140  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0157  ABC transporter related  50.7 
 
 		 507 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0227  ABC transporter related  49.61 
 
 		 507 aa  486  1e-136  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0106  xylose transporter ATP-binding subunit  47.33 
 
 		 505 aa  467  9.999999999999999e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19490  ABC transporter related  47.73 
 
 		 509 aa  463  1e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.524485  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3415  xylose transporter ATP-binding subunit  48.12 
 
 		 511 aa  449  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.055967  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0906  ABC sugar transporter, ATPase subunit  49.9 
 
 		 517 aa  446  1.0000000000000001e-124  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0350072 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4943  xylose transporter ATP-binding subunit  47.09 
 
 		 513 aa  445  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0106818 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0143  D-xylose ABC transporter, ATPase subunit  47.09 
 
 		 513 aa  444  1e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3041  ABC transporter related protein  46.4 
 
 		 511 aa  443  1e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3770  xylose transporter ATP-binding subunit  47.09 
 
 		 513 aa  445  1e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3955  xylose transporter ATP-binding subunit  46.89 
 
 		 513 aa  444  1e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3890  xylose transporter ATP-binding subunit  47.09 
 
 		 513 aa  444  1e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0147  xylose transporter ATP-binding subunit  47.09 
 
 		 513 aa  444  1e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4063  xylose transporter ATP-binding subunit  47.09 
 
 		 513 aa  444  1e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1151  xylose transporter ATP-binding subunit  47.33 
 
 		 511 aa  441  9.999999999999999e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.038182  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6621  ABC transporter related protein  48.33 
 
 		 525 aa  441  9.999999999999999e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823555 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0058  xylose transporter ATP-binding subunit  45.29 
 
 		 510 aa  436  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4100  xylose transporter ATP-binding subunit  45.29 
 
 		 510 aa  436  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6326  xylose transporter ATP-binding subunit  47.95 
 
 		 519 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.22602  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0154  xylose transporter ATP-binding subunit  47.29 
 
 		 513 aa  438  1e-121  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1634  xylose transporter ATP-binding subunit  48.1 
 
 		 514 aa  433  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.714407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6503  xylose transporter ATP-binding subunit  47.75 
 
 		 519 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.399148  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0585  xylose transporter ATP-binding subunit  45.89 
 
 		 504 aa  434  1e-120  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6737  xylose transporter ATP-binding subunit  47.75 
 
 		 519 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.020966  normal  0.602476 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2340  xylose transporter ATP-binding subunit  46.52 
 
 		 525 aa  433  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.264239  normal  0.0150515 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3837  xylose transporter ATP-binding subunit  46.69 
 
 		 515 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.623686  normal  0.377794 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4153  xylose transporter ATP-binding subunit  45.69 
 
 		 513 aa  429  1e-119  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4914  xylose transporter ATP-binding subunit  46.69 
 
 		 515 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00466146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1866  D-xylose ABC transporter, ATPase subunit  46.61 
 
 		 509 aa  430  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.486033 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4075  xylose transporter ATP-binding subunit  46.92 
 
 		 517 aa  427  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.818661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2620  xylose transporter ATP-binding subunit  45.92 
 
 		 519 aa  427  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4187  xylose transporter ATP-binding subunit  46.92 
 
 		 517 aa  427  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.300713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4435  xylose transporter ATP-binding subunit  45.49 
 
 		 513 aa  426  1e-118  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6631  xylose transporter ATP-binding subunit  46.12 
 
 		 519 aa  427  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0080  xylose transporter ATP-binding subunit  46.09 
 
 		 513 aa  426  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6035  xylose transporter ATP-binding subunit  46.38 
 
 		 519 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0730737  normal  0.8225 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0062  xylose transporter ATP-binding subunit  46.09 
 
 		 513 aa  422  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2340  xylose transporter ATP-binding subunit  46.72 
 
 		 519 aa  419  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  46.65 
 
 		 514 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6335  xylose transporter ATP-binding subunit  45.6 
 
 		 519 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  46.65 
 
 		 514 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4210  xylose transporter ATP-binding subunit  46.52 
 
 		 519 aa  421  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2301  xylose transporter ATP-binding subunit  46.52 
 
 		 518 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.538906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  46.85 
 
 		 514 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0010  D-ribose transporter ATP binding protein  46.81 
 
 		 500 aa  416  9.999999999999999e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  45.88 
 
 		 512 aa  413  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  46.23 
 
 		 516 aa  414  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  44.29 
 
 		 501 aa  414  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0100  xylose transporter ATP-binding subunit  45.69 
 
 		 513 aa  412  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  44.86 
 
 		 515 aa  415  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3004  D-xylose ABC transporter, ATP-binding protein  45.53 
 
 		 528 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.271477  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2885  xylose transporter ATP-binding subunit  45.13 
 
 		 518 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.700201  normal  0.945677 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2122  ABC transporter related  44.58 
 
 		 511 aa  409  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000341  ribose ABC transport system ATP-binding protein RbsA  46.61 
 
 		 501 aa  409  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2279  ABC transporter related  46.41 
 
 		 500 aa  410  1e-113  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.488082  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  44.71 
 
 		 520 aa  411  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  44.29 
 
 		 513 aa  411  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>