More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0257 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_3402  ABC transporter related protein  66.07 
 
 		 522 aa  686    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.146962 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1104  ABC transporter related  68.97 
 
 		 519 aa  702    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296869  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0384  ABC transporter related  66.34 
 
 		 509 aa  668    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0257  ABC transporter related protein  100 
 
 		 516 aa  1045    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.391608  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1181  ABC transporter related  67.59 
 
 		 520 aa  696    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000288216 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27960  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  62.38 
 
 		 512 aa  625  1e-178  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.887259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0503  ABC transporter related  61.16 
 
 		 508 aa  618  1e-176  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.689531  normal  0.17522 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2514  ABC transporter related protein  62.13 
 
 		 518 aa  617  1e-175  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2945  ABC transporter related  61.75 
 
 		 541 aa  613  9.999999999999999e-175  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.854224 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1865  ABC transporter related  59.68 
 
 		 508 aa  609  1e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.251568  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2519  ABC transporter related protein  61.34 
 
 		 515 aa  608  1e-173  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.760037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0405  ABC transporter related protein  61.39 
 
 		 514 aa  598  1e-170  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.251912  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0239  ABC transporter related protein  60.36 
 
 		 512 aa  597  1e-169  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.301252  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29470  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  60 
 
 		 513 aa  592  1e-168  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2997  ABC transporter related  59.52 
 
 		 519 aa  591  1e-167  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.746869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0839  ABC transporter related  57.68 
 
 		 515 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500489  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2890  ABC transporter related protein  59.38 
 
 		 516 aa  583  1.0000000000000001e-165  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0580102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4718  ABC transporter related  59.48 
 
 		 564 aa  582  1.0000000000000001e-165  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3660  ABC transporter related  56.8 
 
 		 512 aa  578  1e-164  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3073  ABC transporter related  58.92 
 
 		 511 aa  580  1e-164  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.697432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0614  ABC transporter related  58 
 
 		 511 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2686  ABC transporter related  57.4 
 
 		 516 aa  573  1.0000000000000001e-162  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1860  xylose ABC transporter ATPase  56.27 
 
 		 517 aa  567  1e-160  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.05268  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2913  ABC transporter related  56.63 
 
 		 512 aa  566  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.169153  normal  0.630322 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1046  ABC transporter related  56.7 
 
 		 521 aa  567  1e-160  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4474  ABC transporter related  56.83 
 
 		 511 aa  566  1e-160  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.882977  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0936  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  58.32 
 
 		 529 aa  565  1.0000000000000001e-159  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.411664  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0878  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  58.32 
 
 		 529 aa  565  1.0000000000000001e-159  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.459343  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3199  ABC transporter-related protein  56.66 
 
 		 507 aa  560  1e-158  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.28101 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2746  ABC transporter related  56.32 
 
 		 524 aa  559  1e-158  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.565066 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3174  ABC transporter related  56.43 
 
 		 512 aa  560  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1425  ABC transporter related  57.52 
 
 		 530 aa  560  1e-158  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.577416  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1986  ABC transporter related  55.49 
 
 		 511 aa  557  1e-157  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4109  ABC transporter related  55.51 
 
 		 512 aa  552  1e-156  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000359898 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3905  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  55.35 
 
 		 504 aa  548  1e-155  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.876803  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2253  ABC transporter-related protein  56.94 
 
 		 505 aa  551  1e-155  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000512006 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2138  L-arabinose transport ATP-binding protein araG  55.91 
 
 		 516 aa  542  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.960653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0738  ABC transporter related  55.02 
 
 		 505 aa  537  1e-151  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0757  ABC transporter related protein  55.1 
 
 		 525 aa  534  1e-150  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0933075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1586  ABC transporter related  52.58 
 
 		 513 aa  523  1e-147  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.192443  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2577  ABC transporter related  53.28 
 
 		 507 aa  511  1e-143  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.589076 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1667  ABC transporter related  50.3 
 
 		 507 aa  495  1e-139  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.2144  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2021  xylose transporter ATP-binding subunit  52.18 
 
 		 504 aa  491  1e-137  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0157  ABC transporter related  49.6 
 
 		 507 aa  484  1e-135  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0106  xylose transporter ATP-binding subunit  48.32 
 
 		 505 aa  471  1.0000000000000001e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0906  ABC sugar transporter, ATPase subunit  49.5 
 
 		 517 aa  468  9.999999999999999e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0350072 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0227  ABC transporter related  48.5 
 
 		 507 aa  464  1e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0143  D-xylose ABC transporter, ATPase subunit  48.2 
 
 		 513 aa  449  1e-125  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4063  xylose transporter ATP-binding subunit  48.2 
 
 		 513 aa  449  1e-125  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3955  xylose transporter ATP-binding subunit  48.2 
 
 		 513 aa  449  1e-125  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4943  xylose transporter ATP-binding subunit  48.4 
 
 		 513 aa  451  1e-125  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0106818 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3770  xylose transporter ATP-binding subunit  48.2 
 
 		 513 aa  449  1e-125  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3890  xylose transporter ATP-binding subunit  48.4 
 
 		 513 aa  450  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0147  xylose transporter ATP-binding subunit  48.2 
 
 		 513 aa  449  1e-125  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0154  xylose transporter ATP-binding subunit  48 
 
 		 513 aa  444  1e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3041  ABC transporter related protein  46.99 
 
 		 511 aa  439  9.999999999999999e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1634  xylose transporter ATP-binding subunit  47.71 
 
 		 514 aa  437  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.714407  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4153  xylose transporter ATP-binding subunit  46.71 
 
 		 513 aa  436  1e-121  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19490  ABC transporter related  45.28 
 
 		 509 aa  437  1e-121  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.524485  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0585  xylose transporter ATP-binding subunit  45.62 
 
 		 504 aa  436  1e-121  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4435  xylose transporter ATP-binding subunit  46.09 
 
 		 513 aa  433  1e-120  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4914  xylose transporter ATP-binding subunit  46.5 
 
 		 515 aa  433  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00466146  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3837  xylose transporter ATP-binding subunit  46.5 
 
 		 515 aa  433  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.623686  normal  0.377794 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4100  xylose transporter ATP-binding subunit  46.69 
 
 		 510 aa  434  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0058  xylose transporter ATP-binding subunit  46.69 
 
 		 510 aa  434  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0080  xylose transporter ATP-binding subunit  45.89 
 
 		 513 aa  429  1e-119  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1151  xylose transporter ATP-binding subunit  45.92 
 
 		 511 aa  426  1e-118  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.038182  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3415  xylose transporter ATP-binding subunit  46.05 
 
 		 511 aa  426  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.055967  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  45.7 
 
 		 513 aa  428  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  43.55 
 
 		 501 aa  426  1e-118  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  43.55 
 
 		 501 aa  425  1e-118  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  45.83 
 
 		 514 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  45.83 
 
 		 514 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  46.02 
 
 		 514 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  45.12 
 
 		 524 aa  420  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0100  xylose transporter ATP-binding subunit  46.39 
 
 		 513 aa  421  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0062  xylose transporter ATP-binding subunit  45.18 
 
 		 513 aa  420  1e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6503  xylose transporter ATP-binding subunit  45.8 
 
 		 519 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.399148  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6737  xylose transporter ATP-binding subunit  45.8 
 
 		 519 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.020966  normal  0.602476 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6326  xylose transporter ATP-binding subunit  46 
 
 		 519 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.22602  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  44.18 
 
 		 496 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1866  D-xylose ABC transporter, ATPase subunit  46.18 
 
 		 509 aa  417  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.486033 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  45.09 
 
 		 514 aa  412  1e-114  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6621  ABC transporter related protein  45.44 
 
 		 525 aa  414  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823555 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2340  xylose transporter ATP-binding subunit  45.68 
 
 		 525 aa  412  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.264239  normal  0.0150515 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  46.06 
 
 		 512 aa  414  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2620  xylose transporter ATP-binding subunit  46 
 
 		 519 aa  410  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  46.37 
 
 		 508 aa  410  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6631  xylose transporter ATP-binding subunit  46.09 
 
 		 519 aa  409  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4075  xylose transporter ATP-binding subunit  45.93 
 
 		 517 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.818661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  45.36 
 
 		 512 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  44.75 
 
 		 520 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4187  xylose transporter ATP-binding subunit  45.93 
 
 		 517 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.300713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6335  xylose transporter ATP-binding subunit  45.71 
 
 		 519 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6035  xylose transporter ATP-binding subunit  44.8 
 
 		 519 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0730737  normal  0.8225 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  45.36 
 
 		 512 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  45.26 
 
 		 513 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4210  xylose transporter ATP-binding subunit  44.8 
 
 		 519 aa  404  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0775  xylose transporter ATP-binding subunit  45 
 
 		 512 aa  402  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  45.28 
 
 		 513 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>