More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0405 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3660  ABC transporter related  60.47 
 
 
512 aa  645    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0239  ABC transporter related protein  71.65 
 
 
512 aa  743    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.301252  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4718  ABC transporter related  67.26 
 
 
564 aa  683    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1865  ABC transporter related  67.13 
 
 
508 aa  684    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.251568  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0839  ABC transporter related  62.45 
 
 
515 aa  639    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500489  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0503  ABC transporter related  72.05 
 
 
508 aa  743    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.689531  normal  0.17522 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1104  ABC transporter related  63.47 
 
 
519 aa  637    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296869  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0405  ABC transporter related protein  100 
 
 
514 aa  1038    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.251912  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2514  ABC transporter related protein  74.76 
 
 
518 aa  775    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2519  ABC transporter related protein  67.13 
 
 
515 aa  681    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.760037  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29470  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  70.9 
 
 
513 aa  745    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27960  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  74.02 
 
 
512 aa  763    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.887259  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2997  ABC transporter related  73.01 
 
 
519 aa  756    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.746869  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1181  ABC transporter related  62.48 
 
 
520 aa  637    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000288216 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2945  ABC transporter related  70.69 
 
 
541 aa  729    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.854224 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0384  ABC transporter related  63.17 
 
 
509 aa  625  1e-178  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4109  ABC transporter related  61.69 
 
 
512 aa  621  1e-176  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000359898 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1986  ABC transporter related  57.39 
 
 
511 aa  613  9.999999999999999e-175  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4474  ABC transporter related  60.68 
 
 
511 aa  612  9.999999999999999e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.882977  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3199  ABC transporter-related protein  61.65 
 
 
507 aa  609  1e-173  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.28101 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3402  ABC transporter related protein  60.6 
 
 
522 aa  610  1e-173  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.146962 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2913  ABC transporter related  60.48 
 
 
512 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.169153  normal  0.630322 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3174  ABC transporter related  59.68 
 
 
512 aa  600  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2890  ABC transporter related protein  59.92 
 
 
516 aa  600  1e-170  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0580102  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1046  ABC transporter related  61.2 
 
 
521 aa  596  1e-169  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3073  ABC transporter related  58.92 
 
 
511 aa  593  1e-168  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.697432  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2253  ABC transporter-related protein  60.76 
 
 
505 aa  593  1e-168  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000512006 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2686  ABC transporter related  57.54 
 
 
516 aa  594  1e-168  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2746  ABC transporter related  60.8 
 
 
524 aa  588  1e-166  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.565066 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0257  ABC transporter related protein  61.39 
 
 
516 aa  586  1e-166  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.391608  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3905  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  58.91 
 
 
504 aa  584  1.0000000000000001e-165  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.876803  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1860  xylose ABC transporter ATPase  59.92 
 
 
517 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.05268  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0936  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  58.95 
 
 
529 aa  580  1e-164  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.411664  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0878  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  58.95 
 
 
529 aa  580  1e-164  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.459343  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0614  ABC transporter related  60.76 
 
 
511 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1425  ABC transporter related  58.75 
 
 
530 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.577416  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0738  ABC transporter related  59.15 
 
 
505 aa  570  1e-161  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0757  ABC transporter related protein  58.7 
 
 
525 aa  568  1e-160  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0933075  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1586  ABC transporter related  56.04 
 
 
513 aa  565  1e-160  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.192443  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2138  L-arabinose transport ATP-binding protein araG  56.71 
 
 
516 aa  565  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.960653  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2577  ABC transporter related  55.27 
 
 
507 aa  545  1e-154  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.589076 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1667  ABC transporter related  51.59 
 
 
507 aa  525  1e-147  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.2144  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2021  xylose transporter ATP-binding subunit  53.86 
 
 
504 aa  516  1.0000000000000001e-145  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0106  xylose transporter ATP-binding subunit  50.1 
 
 
505 aa  504  1e-141  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0157  ABC transporter related  50.7 
 
 
507 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3415  xylose transporter ATP-binding subunit  49.8 
 
 
511 aa  472  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.055967  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19490  ABC transporter related  48.1 
 
 
509 aa  463  1e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.524485  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0227  ABC transporter related  48.61 
 
 
507 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1151  xylose transporter ATP-binding subunit  48.21 
 
 
511 aa  458  9.999999999999999e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.038182  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0143  D-xylose ABC transporter, ATPase subunit  47.6 
 
 
513 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3955  xylose transporter ATP-binding subunit  47.6 
 
 
513 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0147  xylose transporter ATP-binding subunit  47.6 
 
 
513 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4063  xylose transporter ATP-binding subunit  47.6 
 
 
513 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4943  xylose transporter ATP-binding subunit  47.8 
 
 
513 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0106818 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3890  xylose transporter ATP-binding subunit  47.8 
 
 
513 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3770  xylose transporter ATP-binding subunit  47.6 
 
 
513 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6621  ABC transporter related protein  47.25 
 
 
525 aa  447  1.0000000000000001e-124  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000823555 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1866  D-xylose ABC transporter, ATPase subunit  47.5 
 
 
509 aa  446  1.0000000000000001e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.486033 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3041  ABC transporter related protein  44.98 
 
 
511 aa  441  9.999999999999999e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0906  ABC sugar transporter, ATPase subunit  47.43 
 
 
517 aa  437  1e-121  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0350072 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  46.59 
 
 
512 aa  436  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0585  xylose transporter ATP-binding subunit  44.91 
 
 
504 aa  436  1e-121  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0154  xylose transporter ATP-binding subunit  46.71 
 
 
513 aa  436  1e-121  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  48.3 
 
 
514 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  48.3 
 
 
514 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  48.3 
 
 
514 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  46.29 
 
 
501 aa  434  1e-120  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  46.71 
 
 
520 aa  434  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4153  xylose transporter ATP-binding subunit  45.29 
 
 
513 aa  430  1e-119  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3837  xylose transporter ATP-binding subunit  45.76 
 
 
515 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.623686  normal  0.377794 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4914  xylose transporter ATP-binding subunit  45.76 
 
 
515 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00466146  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0080  xylose transporter ATP-binding subunit  46.32 
 
 
513 aa  428  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  46 
 
 
515 aa  428  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  46.02 
 
 
517 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4435  xylose transporter ATP-binding subunit  45.49 
 
 
513 aa  425  1e-118  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  47.22 
 
 
516 aa  425  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4100  xylose transporter ATP-binding subunit  44.91 
 
 
510 aa  426  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0058  xylose transporter ATP-binding subunit  44.91 
 
 
510 aa  426  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0775  xylose transporter ATP-binding subunit  45.63 
 
 
512 aa  423  1e-117  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2301  xylose transporter ATP-binding subunit  46.93 
 
 
518 aa  424  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.538906  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2279  ABC transporter related  46.71 
 
 
500 aa  424  1e-117  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.488082  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  46.51 
 
 
504 aa  423  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4187  xylose transporter ATP-binding subunit  46.53 
 
 
517 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.300713  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  44.98 
 
 
496 aa  424  1e-117  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4075  xylose transporter ATP-binding subunit  46.53 
 
 
517 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.818661  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1634  xylose transporter ATP-binding subunit  45.96 
 
 
514 aa  421  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.714407  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3004  D-xylose ABC transporter, ATP-binding protein  46.53 
 
 
528 aa  420  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.271477  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  44.73 
 
 
501 aa  419  1e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0062  xylose transporter ATP-binding subunit  45.29 
 
 
513 aa  417  9.999999999999999e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  45.14 
 
 
513 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2122  ABC transporter related  45.02 
 
 
511 aa  417  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4210  xylose transporter ATP-binding subunit  45.33 
 
 
519 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  44.73 
 
 
501 aa  418  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2340  xylose transporter ATP-binding subunit  44.75 
 
 
525 aa  414  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.264239  normal  0.0150515 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  45.6 
 
 
523 aa  412  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  45.83 
 
 
514 aa  414  1e-114  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2885  xylose transporter ATP-binding subunit  45.94 
 
 
518 aa  412  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.700201  normal  0.945677 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  45.69 
 
 
501 aa  412  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6503  xylose transporter ATP-binding subunit  46.12 
 
 
519 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.399148  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  45.01 
 
 
513 aa  413  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>