More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0775 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010678  Rpic_4914  xylose transporter ATP-binding subunit  61.66 
 
 
515 aa  641    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00466146  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1634  xylose transporter ATP-binding subunit  63.27 
 
 
514 aa  647    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.714407  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1151  xylose transporter ATP-binding subunit  64.33 
 
 
511 aa  672    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.038182  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3004  D-xylose ABC transporter, ATP-binding protein  64.82 
 
 
528 aa  665    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.271477  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2885  xylose transporter ATP-binding subunit  65.61 
 
 
518 aa  671    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.700201  normal  0.945677 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4075  xylose transporter ATP-binding subunit  64.06 
 
 
517 aa  668    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.818661  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2301  xylose transporter ATP-binding subunit  63.24 
 
 
518 aa  657    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.538906  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2340  xylose transporter ATP-binding subunit  62.77 
 
 
519 aa  642    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3415  xylose transporter ATP-binding subunit  64.72 
 
 
511 aa  681    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.055967  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2620  xylose transporter ATP-binding subunit  63.41 
 
 
519 aa  663    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6503  xylose transporter ATP-binding subunit  62.89 
 
 
519 aa  651    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.399148  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4210  xylose transporter ATP-binding subunit  63.37 
 
 
519 aa  649    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3837  xylose transporter ATP-binding subunit  61.66 
 
 
515 aa  641    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.623686  normal  0.377794 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6326  xylose transporter ATP-binding subunit  63.12 
 
 
519 aa  650    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.22602  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6035  xylose transporter ATP-binding subunit  62.89 
 
 
519 aa  652    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0730737  normal  0.8225 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6335  xylose transporter ATP-binding subunit  62.5 
 
 
519 aa  652    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6737  xylose transporter ATP-binding subunit  62.89 
 
 
519 aa  651    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.020966  normal  0.602476 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4187  xylose transporter ATP-binding subunit  64.06 
 
 
517 aa  668    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.300713  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2340  xylose transporter ATP-binding subunit  65.23 
 
 
525 aa  676    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.264239  normal  0.0150515 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6631  xylose transporter ATP-binding subunit  63.21 
 
 
519 aa  660    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0775  xylose transporter ATP-binding subunit  100 
 
 
512 aa  1038    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0157  ABC transporter related  55.73 
 
 
507 aa  567  1e-160  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1866  D-xylose ABC transporter, ATPase subunit  57.71 
 
 
509 aa  560  1e-158  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.486033 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4100  xylose transporter ATP-binding subunit  52.68 
 
 
510 aa  536  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0058  xylose transporter ATP-binding subunit  52.68 
 
 
510 aa  536  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0143  D-xylose ABC transporter, ATPase subunit  53.56 
 
 
513 aa  530  1e-149  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3955  xylose transporter ATP-binding subunit  53.36 
 
 
513 aa  529  1e-149  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0147  xylose transporter ATP-binding subunit  53.56 
 
 
513 aa  530  1e-149  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4943  xylose transporter ATP-binding subunit  53.56 
 
 
513 aa  530  1e-149  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0106818 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4063  xylose transporter ATP-binding subunit  53.56 
 
 
513 aa  530  1e-149  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0154  xylose transporter ATP-binding subunit  53.28 
 
 
513 aa  528  1e-149  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3890  xylose transporter ATP-binding subunit  53.56 
 
 
513 aa  531  1e-149  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3770  xylose transporter ATP-binding subunit  53.56 
 
 
513 aa  530  1e-149  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4435  xylose transporter ATP-binding subunit  51.29 
 
 
513 aa  525  1e-148  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0585  xylose transporter ATP-binding subunit  52.99 
 
 
504 aa  524  1e-147  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0062  xylose transporter ATP-binding subunit  52.57 
 
 
513 aa  524  1e-147  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4153  xylose transporter ATP-binding subunit  50.89 
 
 
513 aa  521  1e-146  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0080  xylose transporter ATP-binding subunit  52.59 
 
 
513 aa  519  1e-146  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0100  xylose transporter ATP-binding subunit  51.59 
 
 
513 aa  517  1.0000000000000001e-145  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3041  ABC transporter related protein  50.8 
 
 
511 aa  510  1e-143  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0106  xylose transporter ATP-binding subunit  49.01 
 
 
505 aa  503  1e-141  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2021  xylose transporter ATP-binding subunit  49.21 
 
 
504 aa  496  1e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19490  ABC transporter related  48.11 
 
 
509 aa  485  1e-136  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.524485  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6621  ABC transporter related protein  48.92 
 
 
525 aa  484  1e-135  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000823555 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3660  ABC transporter related  47.62 
 
 
512 aa  444  1e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27960  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  46.14 
 
 
512 aa  433  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.887259  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0503  ABC transporter related  45.33 
 
 
508 aa  427  1e-118  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.689531  normal  0.17522 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0239  ABC transporter related protein  46.14 
 
 
512 aa  425  1e-118  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.301252  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2514  ABC transporter related protein  46.2 
 
 
518 aa  426  1e-118  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1667  ABC transporter related  45.38 
 
 
507 aa  426  1e-118  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.2144  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1986  ABC transporter related  45.73 
 
 
511 aa  426  1e-118  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2746  ABC transporter related  47.42 
 
 
524 aa  427  1e-118  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.565066 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  43.65 
 
 
496 aa  427  1e-118  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2997  ABC transporter related  45.63 
 
 
519 aa  422  1e-117  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.746869  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  46.71 
 
 
497 aa  424  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3073  ABC transporter related  45.42 
 
 
511 aa  422  1e-117  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.697432  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0405  ABC transporter related protein  45.63 
 
 
514 aa  423  1e-117  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.251912  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  45.4 
 
 
494 aa  420  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  45.4 
 
 
494 aa  420  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  45.4 
 
 
494 aa  420  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  45.2 
 
 
494 aa  419  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4115  D-ribose transporter ATP binding protein  46.61 
 
 
501 aa  420  1e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.684938  normal  0.0182067 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4174  D-ribose transporter ATP binding protein  46.32 
 
 
501 aa  420  1e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283711  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2945  ABC transporter related  45.4 
 
 
541 aa  421  1e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.854224 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1586  ABC transporter related  45.77 
 
 
513 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.192443  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0735  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  45 
 
 
494 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  45 
 
 
494 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  44.84 
 
 
495 aa  416  9.999999999999999e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  45.54 
 
 
495 aa  417  9.999999999999999e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1181  ABC transporter related  45.4 
 
 
520 aa  415  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000288216 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  45.2 
 
 
494 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3402  ABC transporter related protein  46 
 
 
522 aa  415  9.999999999999999e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.146962 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1371  D-ribose transporter ATP binding protein  45.6 
 
 
504 aa  416  9.999999999999999e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0936  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.62 
 
 
529 aa  414  1e-114  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.411664  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4639  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  44.8 
 
 
494 aa  412  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.202571  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  45.33 
 
 
501 aa  414  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4215  D-ribose transporter ATP binding protein  45.62 
 
 
516 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.777457 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2122  ABC transporter related  43.96 
 
 
511 aa  412  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0341  D-ribose transporter ATP binding protein  43.81 
 
 
501 aa  412  1e-114  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  44.2 
 
 
496 aa  412  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0878  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.62 
 
 
529 aa  414  1e-114  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.459343  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03635  fused D-ribose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  45.24 
 
 
501 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.483932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4218  ABC transporter related protein  45.24 
 
 
501 aa  410  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  42.66 
 
 
494 aa  410  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000081797  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4265  D-ribose transporter ATP binding protein  45.24 
 
 
501 aa  410  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146477  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03580  hypothetical protein  45.24 
 
 
501 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550483  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4094  D-ribose transporter ATP binding protein  45.62 
 
 
516 aa  411  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4274  D-ribose transporter ATP binding protein  45.62 
 
 
516 aa  411  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3174  ABC transporter related  44.07 
 
 
512 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2577  ABC transporter related  45.97 
 
 
507 aa  410  1e-113  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.589076 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  44.62 
 
 
501 aa  410  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3965  D-ribose transporter ATP binding protein  45.24 
 
 
501 aa  410  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4165  D-ribose transporter ATP binding protein  45.62 
 
 
501 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.846402  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000341  ribose ABC transport system ATP-binding protein RbsA  44.16 
 
 
501 aa  410  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4245  D-ribose transporter ATP binding protein  45.24 
 
 
501 aa  410  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0036959 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4117  D-ribose transporter ATP binding protein  45.24 
 
 
501 aa  410  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.159229 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3199  ABC transporter-related protein  44.07 
 
 
507 aa  410  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.28101 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4109  D-ribose transporter ATP binding protein  45.62 
 
 
516 aa  411  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114584  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2913  ABC transporter related  43.87 
 
 
512 aa  412  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.169153  normal  0.630322 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4474  ABC transporter related  43.87 
 
 
511 aa  409  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.882977  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>