More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3905 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1046  ABC transporter related  71.06 
 
 		 521 aa  718    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0936  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  67 
 
 		 529 aa  679    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.411664  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3174  ABC transporter related  85.71 
 
 		 512 aa  900    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3199  ABC transporter-related protein  68.94 
 
 		 507 aa  676    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.28101 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3905  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  100 
 
 		 504 aa  1023    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.876803  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0839  ABC transporter related  68 
 
 		 515 aa  689    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500489  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2913  ABC transporter related  85.71 
 
 		 512 aa  900    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.169153  normal  0.630322 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3073  ABC transporter related  68.25 
 
 		 511 aa  712    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.697432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0614  ABC transporter related  69 
 
 		 511 aa  693    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2686  ABC transporter related  66.06 
 
 		 516 aa  670    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1425  ABC transporter related  66.67 
 
 		 530 aa  673    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.577416  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2253  ABC transporter-related protein  66.4 
 
 		 505 aa  661    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000512006 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0738  ABC transporter related  67.2 
 
 		 505 aa  657    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3660  ABC transporter related  66.33 
 
 		 512 aa  701    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2138  L-arabinose transport ATP-binding protein araG  64.4 
 
 		 516 aa  660    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.960653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0878  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  67 
 
 		 529 aa  679    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.459343  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4474  ABC transporter related  78.53 
 
 		 511 aa  823    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.882977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4109  ABC transporter related  67.72 
 
 		 512 aa  691    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000359898 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2746  ABC transporter related  63.87 
 
 		 524 aa  632  1e-180  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.565066 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1986  ABC transporter related  60.8 
 
 		 511 aa  621  1e-176  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1104  ABC transporter related  60.64 
 
 		 519 aa  615  1e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296869  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2890  ABC transporter related protein  62.6 
 
 		 516 aa  617  1e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0580102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1181  ABC transporter related  60.32 
 
 		 520 aa  610  1e-173  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000288216 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1586  ABC transporter related  60.71 
 
 		 513 aa  605  9.999999999999999e-173  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.192443  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0503  ABC transporter related  59.52 
 
 		 508 aa  601  1.0000000000000001e-171  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.689531  normal  0.17522 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2519  ABC transporter related protein  59.8 
 
 		 515 aa  602  1.0000000000000001e-171  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.760037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0239  ABC transporter related protein  59.84 
 
 		 512 aa  599  1e-170  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.301252  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1865  ABC transporter related  58.59 
 
 		 508 aa  588  1e-166  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.251568  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27960  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  57.97 
 
 		 512 aa  586  1e-166  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.887259  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2514  ABC transporter related protein  59.39 
 
 		 518 aa  585  1e-166  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0405  ABC transporter related protein  58.91 
 
 		 514 aa  584  1.0000000000000001e-165  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.251912  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4718  ABC transporter related  58.3 
 
 		 564 aa  579  1e-164  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2945  ABC transporter related  58.59 
 
 		 541 aa  580  1e-164  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.854224 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0384  ABC transporter related  58.38 
 
 		 509 aa  575  1.0000000000000001e-163  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2997  ABC transporter related  58.99 
 
 		 519 aa  573  1.0000000000000001e-162  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.746869  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3402  ABC transporter related protein  58.59 
 
 		 522 aa  570  1e-161  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.146962 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29470  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  57.43 
 
 		 513 aa  565  1e-160  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2577  ABC transporter related  57.98 
 
 		 507 aa  559  1e-158  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.589076 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1860  xylose ABC transporter ATPase  56.72 
 
 		 517 aa  548  1e-155  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.05268  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0757  ABC transporter related protein  54.74 
 
 		 525 aa  549  1e-155  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0933075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1667  ABC transporter related  54.84 
 
 		 507 aa  542  1e-153  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.2144  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0257  ABC transporter related protein  55.35 
 
 		 516 aa  537  1e-151  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.391608  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0227  ABC transporter related  52.43 
 
 		 507 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0106  xylose transporter ATP-binding subunit  49.19 
 
 		 505 aa  504  1e-141  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2021  xylose transporter ATP-binding subunit  51.21 
 
 		 504 aa  493  9.999999999999999e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0157  ABC transporter related  50.1 
 
 		 507 aa  486  1e-136  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3041  ABC transporter related protein  48.91 
 
 		 511 aa  479  1e-134  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19490  ABC transporter related  46.88 
 
 		 509 aa  459  9.999999999999999e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.524485  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0143  D-xylose ABC transporter, ATPase subunit  48.21 
 
 		 513 aa  456  1e-127  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4063  xylose transporter ATP-binding subunit  48.21 
 
 		 513 aa  456  1e-127  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0058  xylose transporter ATP-binding subunit  46.51 
 
 		 510 aa  457  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3770  xylose transporter ATP-binding subunit  48.21 
 
 		 513 aa  456  1e-127  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4100  xylose transporter ATP-binding subunit  46.51 
 
 		 510 aa  457  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3890  xylose transporter ATP-binding subunit  48.21 
 
 		 513 aa  456  1e-127  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4943  xylose transporter ATP-binding subunit  48.21 
 
 		 513 aa  457  1e-127  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0106818 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0147  xylose transporter ATP-binding subunit  48.21 
 
 		 513 aa  456  1e-127  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3955  xylose transporter ATP-binding subunit  48.02 
 
 		 513 aa  455  1.0000000000000001e-126  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6621  ABC transporter related protein  46.15 
 
 		 525 aa  454  1.0000000000000001e-126  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823555 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0154  xylose transporter ATP-binding subunit  47.5 
 
 		 513 aa  454  1.0000000000000001e-126  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4435  xylose transporter ATP-binding subunit  46.31 
 
 		 513 aa  451  1e-125  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0080  xylose transporter ATP-binding subunit  46.71 
 
 		 513 aa  451  1e-125  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4153  xylose transporter ATP-binding subunit  46.11 
 
 		 513 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0062  xylose transporter ATP-binding subunit  46.91 
 
 		 513 aa  448  1.0000000000000001e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0100  xylose transporter ATP-binding subunit  45.91 
 
 		 513 aa  436  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1866  D-xylose ABC transporter, ATPase subunit  45.42 
 
 		 509 aa  434  1e-120  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.486033 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0906  ABC sugar transporter, ATPase subunit  46.76 
 
 		 517 aa  431  1e-119  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0350072 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  45.27 
 
 		 501 aa  427  1e-118  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0585  xylose transporter ATP-binding subunit  45.4 
 
 		 504 aa  428  1e-118  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3415  xylose transporter ATP-binding subunit  45.89 
 
 		 511 aa  425  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.055967  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1634  xylose transporter ATP-binding subunit  44.82 
 
 		 514 aa  422  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.714407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2620  xylose transporter ATP-binding subunit  44.49 
 
 		 519 aa  422  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4914  xylose transporter ATP-binding subunit  44.78 
 
 		 515 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00466146  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3837  xylose transporter ATP-binding subunit  44.78 
 
 		 515 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.623686  normal  0.377794 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3004  D-xylose ABC transporter, ATP-binding protein  44.8 
 
 		 528 aa  422  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.271477  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2279  ABC transporter related  44.87 
 
 		 500 aa  421  1e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.488082  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2301  xylose transporter ATP-binding subunit  44 
 
 		 518 aa  418  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.538906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6631  xylose transporter ATP-binding subunit  44.49 
 
 		 519 aa  421  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  44.78 
 
 		 501 aa  421  1e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4075  xylose transporter ATP-binding subunit  45.11 
 
 		 517 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.818661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  44.94 
 
 		 514 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  44.94 
 
 		 514 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  44.78 
 
 		 501 aa  418  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  44.94 
 
 		 514 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4187  xylose transporter ATP-binding subunit  45.11 
 
 		 517 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.300713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2524  ABC transporter related  45.31 
 
 		 505 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  44.53 
 
 		 499 aa  412  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1151  xylose transporter ATP-binding subunit  44.06 
 
 		 511 aa  413  1e-114  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.038182  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  44.53 
 
 		 499 aa  412  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0341  D-ribose transporter ATP binding protein  44.44 
 
 		 501 aa  414  1e-114  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  43.43 
 
 		 515 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  43.81 
 
 		 514 aa  409  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4210  xylose transporter ATP-binding subunit  44.09 
 
 		 519 aa  411  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6326  xylose transporter ATP-binding subunit  44.84 
 
 		 519 aa  408  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.22602  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6503  xylose transporter ATP-binding subunit  44.84 
 
 		 519 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.399148  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  43.46 
 
 		 517 aa  411  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2122  ABC transporter related  44.06 
 
 		 511 aa  410  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6737  xylose transporter ATP-binding subunit  44.84 
 
 		 519 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.020966  normal  0.602476 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  43.64 
 
 		 520 aa  411  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  43.15 
 
 		 499 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06145  D-ribose transporter ATP binding protein  43.84 
 
 		 501 aa  405  1.0000000000000001e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>