More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3837 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6326  xylose transporter ATP-binding subunit  68.66 
 
 		 519 aa  716    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.22602  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1634  xylose transporter ATP-binding subunit  92.19 
 
 		 514 aa  970    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.714407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4914  xylose transporter ATP-binding subunit  100 
 
 		 515 aa  1047    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00466146  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1151  xylose transporter ATP-binding subunit  65.49 
 
 		 511 aa  688    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.038182  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3004  D-xylose ABC transporter, ATP-binding protein  66.8 
 
 		 528 aa  704    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.271477  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4075  xylose transporter ATP-binding subunit  68.26 
 
 		 517 aa  716    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.818661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2885  xylose transporter ATP-binding subunit  67.27 
 
 		 518 aa  708    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.700201  normal  0.945677 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4210  xylose transporter ATP-binding subunit  67.33 
 
 		 519 aa  709    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2301  xylose transporter ATP-binding subunit  66.07 
 
 		 518 aa  697    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.538906  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4187  xylose transporter ATP-binding subunit  68.26 
 
 		 517 aa  716    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.300713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2340  xylose transporter ATP-binding subunit  65.94 
 
 		 519 aa  687    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6631  xylose transporter ATP-binding subunit  69 
 
 		 519 aa  729    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2620  xylose transporter ATP-binding subunit  69.2 
 
 		 519 aa  729    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6503  xylose transporter ATP-binding subunit  68.66 
 
 		 519 aa  717    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.399148  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3415  xylose transporter ATP-binding subunit  66.08 
 
 		 511 aa  691    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.055967  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6035  xylose transporter ATP-binding subunit  68.06 
 
 		 519 aa  711    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0730737  normal  0.8225 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0775  xylose transporter ATP-binding subunit  61.66 
 
 		 512 aa  641    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6335  xylose transporter ATP-binding subunit  68.26 
 
 		 519 aa  711    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2340  xylose transporter ATP-binding subunit  70 
 
 		 525 aa  743    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.264239  normal  0.0150515 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3837  xylose transporter ATP-binding subunit  100 
 
 		 515 aa  1047    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.623686  normal  0.377794 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6737  xylose transporter ATP-binding subunit  68.66 
 
 		 519 aa  717    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.020966  normal  0.602476 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3955  xylose transporter ATP-binding subunit  55.95 
 
 		 513 aa  588  1e-167  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0147  xylose transporter ATP-binding subunit  55.75 
 
 		 513 aa  588  1e-167  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4063  xylose transporter ATP-binding subunit  55.75 
 
 		 513 aa  588  1e-167  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0154  xylose transporter ATP-binding subunit  56.35 
 
 		 513 aa  590  1e-167  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4943  xylose transporter ATP-binding subunit  55.95 
 
 		 513 aa  589  1e-167  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0106818 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0143  D-xylose ABC transporter, ATPase subunit  55.56 
 
 		 513 aa  587  1e-166  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3890  xylose transporter ATP-binding subunit  55.75 
 
 		 513 aa  586  1e-166  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3770  xylose transporter ATP-binding subunit  55.75 
 
 		 513 aa  588  1e-166  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0062  xylose transporter ATP-binding subunit  56.13 
 
 		 513 aa  584  1.0000000000000001e-165  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0157  ABC transporter related  54.49 
 
 		 507 aa  580  1e-164  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1866  D-xylose ABC transporter, ATPase subunit  56.97 
 
 		 509 aa  580  1e-164  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.486033 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0080  xylose transporter ATP-binding subunit  55.45 
 
 		 513 aa  575  1.0000000000000001e-163  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4435  xylose transporter ATP-binding subunit  53.97 
 
 		 513 aa  570  1e-161  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0100  xylose transporter ATP-binding subunit  54.65 
 
 		 513 aa  570  1e-161  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0058  xylose transporter ATP-binding subunit  52.47 
 
 		 510 aa  566  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4100  xylose transporter ATP-binding subunit  52.47 
 
 		 510 aa  566  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4153  xylose transporter ATP-binding subunit  53.57 
 
 		 513 aa  567  1e-160  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0585  xylose transporter ATP-binding subunit  52.89 
 
 		 504 aa  560  1e-158  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3041  ABC transporter related protein  51.39 
 
 		 511 aa  536  1e-151  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2021  xylose transporter ATP-binding subunit  51.7 
 
 		 504 aa  534  1e-150  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0106  xylose transporter ATP-binding subunit  49.7 
 
 		 505 aa  523  1e-147  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19490  ABC transporter related  50.5 
 
 		 509 aa  515  1.0000000000000001e-145  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.524485  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6621  ABC transporter related protein  49.21 
 
 		 525 aa  470  1.0000000000000001e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823555 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2577  ABC transporter related  48.92 
 
 		 507 aa  448  1.0000000000000001e-124  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.589076 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2122  ABC transporter related  46.31 
 
 		 511 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2686  ABC transporter related  47.34 
 
 		 516 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  45.74 
 
 		 495 aa  442  1e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3660  ABC transporter related  48.01 
 
 		 512 aa  444  1e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0010  D-ribose transporter ATP binding protein  46.05 
 
 		 500 aa  442  1e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1865  ABC transporter related  46.36 
 
 		 508 aa  441  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.251568  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1986  ABC transporter related  45.87 
 
 		 511 aa  436  1e-121  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0839  ABC transporter related  46.34 
 
 		 515 aa  436  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500489  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0227  ABC transporter related  47.14 
 
 		 507 aa  437  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  46.11 
 
 		 501 aa  435  1e-121  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2746  ABC transporter related  47.93 
 
 		 524 aa  436  1e-121  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.565066 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1667  ABC transporter related  45.85 
 
 		 507 aa  434  1e-120  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.2144  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  43.63 
 
 		 501 aa  433  1e-120  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1046  ABC transporter related  46.59 
 
 		 521 aa  432  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0239  ABC transporter related protein  47.09 
 
 		 512 aa  432  1e-120  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.301252  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2890  ABC transporter related protein  47.77 
 
 		 516 aa  435  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0580102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27960  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  45.49 
 
 		 512 aa  433  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.887259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  44.82 
 
 		 494 aa  435  1e-120  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000081797  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3073  ABC transporter related  45.62 
 
 		 511 aa  431  1e-119  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.697432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1371  D-ribose transporter ATP binding protein  44.69 
 
 		 504 aa  429  1e-119  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4215  D-ribose transporter ATP binding protein  45.11 
 
 		 516 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.777457 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  43.43 
 
 		 501 aa  429  1e-119  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0384  ABC transporter related  46.69 
 
 		 509 aa  429  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0503  ABC transporter related  46.39 
 
 		 508 aa  431  1e-119  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.689531  normal  0.17522 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3199  ABC transporter-related protein  46.27 
 
 		 507 aa  430  1e-119  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.28101 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000341  ribose ABC transport system ATP-binding protein RbsA  44.79 
 
 		 501 aa  429  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  45.51 
 
 		 501 aa  431  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03635  fused D-ribose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  44.91 
 
 		 501 aa  427  1e-118  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.483932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4218  ABC transporter related protein  44.91 
 
 		 501 aa  427  1e-118  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4094  D-ribose transporter ATP binding protein  45.11 
 
 		 516 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3965  D-ribose transporter ATP binding protein  44.91 
 
 		 501 aa  427  1e-118  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5185  D-ribose transporter ATP binding protein  44.91 
 
 		 501 aa  425  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0631054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1181  ABC transporter related  46.41 
 
 		 520 aa  426  1e-118  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000288216 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2945  ABC transporter related  44.82 
 
 		 541 aa  425  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.854224 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4109  D-ribose transporter ATP binding protein  45.11 
 
 		 516 aa  428  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114584  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  46.34 
 
 		 497 aa  426  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4165  D-ribose transporter ATP binding protein  45.11 
 
 		 501 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.846402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4265  D-ribose transporter ATP binding protein  44.71 
 
 		 501 aa  426  1e-118  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146477  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4117  D-ribose transporter ATP binding protein  44.91 
 
 		 501 aa  427  1e-118  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159229 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4274  D-ribose transporter ATP binding protein  45.11 
 
 		 516 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4109  ABC transporter related  44.83 
 
 		 512 aa  425  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000359898 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0405  ABC transporter related protein  45.76 
 
 		 514 aa  426  1e-118  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.251912  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4900  D-ribose transporter ATP binding protein  45.71 
 
 		 501 aa  427  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200163  hitchhiker  0.000000993507 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29470  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  46.92 
 
 		 513 aa  426  1e-118  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2138  L-arabinose transport ATP-binding protein araG  46.71 
 
 		 516 aa  425  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.960653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4245  D-ribose transporter ATP binding protein  44.91 
 
 		 501 aa  426  1e-118  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0036959 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3174  ABC transporter related  45.24 
 
 		 512 aa  427  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4474  ABC transporter related  45.04 
 
 		 511 aa  427  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.882977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2913  ABC transporter related  45.04 
 
 		 512 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.169153  normal  0.630322 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03580  hypothetical protein  44.91 
 
 		 501 aa  427  1e-118  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550483  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3905  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  44.78 
 
 		 504 aa  424  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.876803  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0257  ABC transporter related protein  46.73 
 
 		 516 aa  423  1e-117  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.391608  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0614  ABC transporter related  47.13 
 
 		 511 aa  424  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1586  ABC transporter related  45.26 
 
 		 513 aa  422  1e-117  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.192443  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06145  D-ribose transporter ATP binding protein  44.01 
 
 		 501 aa  423  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>