More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3347 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  65.45 
 
 
520 aa  647    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  100 
 
 
513 aa  1042    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  63.69 
 
 
515 aa  638    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  65.79 
 
 
514 aa  657    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  62.97 
 
 
514 aa  653    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  62.97 
 
 
514 aa  653    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  66.06 
 
 
516 aa  658    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  64.46 
 
 
517 aa  635    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  62.97 
 
 
514 aa  653    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  78.29 
 
 
524 aa  819    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  55.47 
 
 
513 aa  535  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  55.47 
 
 
513 aa  534  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  53.36 
 
 
514 aa  528  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  54.51 
 
 
512 aa  526  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  53.31 
 
 
512 aa  522  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  54.26 
 
 
512 aa  523  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  53.31 
 
 
512 aa  522  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  52.41 
 
 
501 aa  522  1e-147  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  52.85 
 
 
499 aa  521  1e-146  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  52.85 
 
 
499 aa  521  1e-146  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  50.41 
 
 
494 aa  510  1e-143  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  53.04 
 
 
503 aa  508  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  52.83 
 
 
507 aa  508  9.999999999999999e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  52.4 
 
 
508 aa  498  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  52.43 
 
 
504 aa  501  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  49.8 
 
 
494 aa  499  1e-140  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  47.28 
 
 
501 aa  498  1e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5597  ABC transporter related  52.23 
 
 
503 aa  498  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.609428  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  50.6 
 
 
497 aa  498  1e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1134  ABC transporter related  47.57 
 
 
506 aa  488  1e-137  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000497905  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3129  ABC transporter related  50.2 
 
 
504 aa  488  1e-136  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149382  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  50.2 
 
 
499 aa  486  1e-136  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  48.69 
 
 
503 aa  488  1e-136  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1060  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  47.15 
 
 
506 aa  485  1e-136  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  49.19 
 
 
496 aa  484  1e-135  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3279  ABC transporter related  50 
 
 
505 aa  484  1e-135  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  49.69 
 
 
495 aa  482  1e-135  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2996  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  46.95 
 
 
506 aa  483  1e-135  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2466  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  45.93 
 
 
506 aa  480  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2565  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  45.93 
 
 
506 aa  480  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3018  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  45.93 
 
 
506 aa  480  1e-134  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0173855 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0391  ABC transporter related protein  48.07 
 
 
499 aa  479  1e-134  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.302991  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02078  fused methyl-galactoside transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  46.34 
 
 
506 aa  476  1e-133  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.833223  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1509  ABC transporter related protein  46.34 
 
 
506 aa  476  1e-133  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.521077  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2283  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  46.34 
 
 
506 aa  476  1e-133  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2010  ABC transporter related  48.99 
 
 
500 aa  476  1e-133  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2444  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  46.34 
 
 
506 aa  476  1e-133  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2296  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  46.34 
 
 
506 aa  476  1e-133  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0020685 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3166  ABC transporter related  49.19 
 
 
500 aa  477  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2379  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  45.42 
 
 
506 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1499  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  46.34 
 
 
506 aa  476  1e-133  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02037  hypothetical protein  46.34 
 
 
506 aa  476  1e-133  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.656876  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2335  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  45.42 
 
 
506 aa  474  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.728797  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  47.55 
 
 
525 aa  475  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2428  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  45.42 
 
 
506 aa  475  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2424  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  45.42 
 
 
506 aa  474  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.6193  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1549  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  45.21 
 
 
515 aa  473  1e-132  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.178403  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2492  ABC transporter related protein  47.98 
 
 
498 aa  472  1e-132  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  48.88 
 
 
516 aa  473  1e-132  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3282  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  46.14 
 
 
506 aa  475  1e-132  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.684279 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1564  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  46.34 
 
 
502 aa  474  1e-132  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7809  ABC transporter related  47.6 
 
 
512 aa  473  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.67 
 
 
525 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  47.76 
 
 
494 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  47.76 
 
 
494 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  47.56 
 
 
494 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  47.76 
 
 
494 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  47.97 
 
 
494 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1683  ABC transporter related  47.86 
 
 
503 aa  469  1.0000000000000001e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305806  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  47.97 
 
 
496 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2749  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  44.62 
 
 
506 aa  469  1.0000000000000001e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  47.56 
 
 
495 aa  467  9.999999999999999e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1342  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  44.81 
 
 
515 aa  467  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.172168  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  47.81 
 
 
524 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4639  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  47.76 
 
 
494 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.202571  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  47.61 
 
 
524 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4183  ABC transporter related  47.31 
 
 
513 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3855  ABC transporter related  47.11 
 
 
513 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  47.56 
 
 
494 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1242  sugar ATP-binding ABC transporter protein  46.46 
 
 
518 aa  462  1e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  47.21 
 
 
524 aa  463  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0735  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  47.36 
 
 
494 aa  463  1e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  46.94 
 
 
523 aa  464  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  47.38 
 
 
527 aa  462  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2929  ABC transporter related  47.66 
 
 
521 aa  462  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  47.21 
 
 
524 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  44.6 
 
 
504 aa  462  1e-129  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2823  ABC transporter related  47.25 
 
 
511 aa  462  1e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3312  ABC transporter-related protein  45.88 
 
 
515 aa  462  1e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  47.21 
 
 
524 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  47.09 
 
 
524 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  47.56 
 
 
496 aa  463  1e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0944  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  45.97 
 
 
502 aa  464  1e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2266  ABC transporter related  48.1 
 
 
499 aa  462  1e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000122283  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4267  ABC transporter related  46.44 
 
 
513 aa  462  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844031  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0106  xylose transporter ATP-binding subunit  47.5 
 
 
505 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6621  ABC transporter related protein  48.24 
 
 
525 aa  457  1e-127  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000823555 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  46.75 
 
 
495 aa  455  1e-127  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0613  ABC transporter related  47.06 
 
 
497 aa  452  1.0000000000000001e-126  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0318  ABC transporter related protein  45.21 
 
 
498 aa  453  1.0000000000000001e-126  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>