More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5321 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0860  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  79.18 
 
 		 514 aa  836    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5321  ABC transporter related  100 
 
 		 514 aa  1036    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0567275  normal  0.751648 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0361  ABC transporter related  76.74 
 
 		 515 aa  764    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1851  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  75.6 
 
 		 512 aa  753    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1961  ABC transporter related  75.6 
 
 		 512 aa  753    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.194037  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0807  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  78.99 
 
 		 514 aa  832    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.41753  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2913  ABC transporter related  80.35 
 
 		 514 aa  847    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.762867  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4757  ABC transporter related  49.3 
 
 		 516 aa  478  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139896  normal  0.719575 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4656  ABC transporter related  48.7 
 
 		 516 aa  472  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.489627  normal  0.659628 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3062  ABC transporter related  46.71 
 
 		 525 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.187248  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3768  ABC transporter related  47.7 
 
 		 514 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3524  ABC transporter related  45.42 
 
 		 514 aa  436  1e-121  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.503605  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3638  ABC transporter related  45.63 
 
 		 532 aa  432  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.810983  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2649  ABC transporter related protein  46.84 
 
 		 518 aa  431  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.684281  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1873  ABC transporter related  45.53 
 
 		 506 aa  427  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.242655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0913  ribose ABC transporter ATP-binding protein  44.6 
 
 		 507 aa  414  1e-114  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3251  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  44.4 
 
 		 507 aa  413  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3385  ABC transporter related  44.4 
 
 		 507 aa  414  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1064  ABC transporter related  45.36 
 
 		 504 aa  408  1.0000000000000001e-112  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0465117  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2122  ABC transporter related  42.94 
 
 		 511 aa  392  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2803  ABC transporter related  42.94 
 
 		 501 aa  390  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.508475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  42.74 
 
 		 501 aa  386  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  42.74 
 
 		 501 aa  383  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3977  D-ribose transporter ATP binding protein  41.94 
 
 		 501 aa  384  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4115  D-ribose transporter ATP binding protein  41.77 
 
 		 501 aa  382  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.684938  normal  0.0182067 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03635  fused D-ribose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  41.57 
 
 		 501 aa  379  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.483932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4218  ABC transporter related protein  41.57 
 
 		 501 aa  379  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3965  D-ribose transporter ATP binding protein  41.57 
 
 		 501 aa  379  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4265  D-ribose transporter ATP binding protein  41.77 
 
 		 501 aa  380  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146477  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4117  D-ribose transporter ATP binding protein  41.57 
 
 		 501 aa  379  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159229 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4174  D-ribose transporter ATP binding protein  42.34 
 
 		 501 aa  382  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283711  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03580  hypothetical protein  41.57 
 
 		 501 aa  379  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550483  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3125  ABC transporter related  43.58 
 
 		 495 aa  379  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  43.23 
 
 		 495 aa  376  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4245  D-ribose transporter ATP binding protein  41.57 
 
 		 501 aa  378  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0036959 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0906  ABC sugar transporter, ATPase subunit  41.85 
 
 		 517 aa  376  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0350072 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  40.24 
 
 		 494 aa  378  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000081797  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0157  ABC transporter related  41 
 
 		 507 aa  377  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5185  D-ribose transporter ATP binding protein  41.37 
 
 		 501 aa  377  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0631054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0341  D-ribose transporter ATP binding protein  41.41 
 
 		 501 aa  377  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  40.44 
 
 		 496 aa  375  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3041  ABC transporter related protein  40.76 
 
 		 511 aa  377  1e-103  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1371  D-ribose transporter ATP binding protein  42.14 
 
 		 504 aa  373  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  42.28 
 
 		 495 aa  374  1e-102  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4109  D-ribose transporter ATP binding protein  40.76 
 
 		 516 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114584  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4215  D-ribose transporter ATP binding protein  40.76 
 
 		 516 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.777457 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3890  xylose transporter ATP-binding subunit  40.16 
 
 		 513 aa  372  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1866  D-xylose ABC transporter, ATPase subunit  40.2 
 
 		 509 aa  372  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.486033 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0143  D-xylose ABC transporter, ATPase subunit  39.96 
 
 		 513 aa  370  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1634  xylose transporter ATP-binding subunit  42.02 
 
 		 514 aa  369  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.714407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4274  D-ribose transporter ATP binding protein  40.76 
 
 		 516 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5684  ABC transporter related  41.09 
 
 		 509 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.878529 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4943  xylose transporter ATP-binding subunit  40.16 
 
 		 513 aa  371  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0106818 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4063  xylose transporter ATP-binding subunit  40.16 
 
 		 513 aa  370  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2021  xylose transporter ATP-binding subunit  39.44 
 
 		 504 aa  369  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4165  D-ribose transporter ATP binding protein  40.76 
 
 		 501 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.846402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3770  xylose transporter ATP-binding subunit  40.16 
 
 		 513 aa  370  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0585  xylose transporter ATP-binding subunit  39.08 
 
 		 504 aa  370  1e-101  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3955  xylose transporter ATP-binding subunit  39.96 
 
 		 513 aa  370  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4094  D-ribose transporter ATP binding protein  40.76 
 
 		 516 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0147  xylose transporter ATP-binding subunit  40.16 
 
 		 513 aa  370  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  40.77 
 
 		 507 aa  365  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  39.72 
 
 		 497 aa  369  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.77 
 
 		 507 aa  365  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3004  D-xylose ABC transporter, ATP-binding protein  40.12 
 
 		 528 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.271477  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1035  ABC sugar transporter, ATPase subunit  40.72 
 
 		 516 aa  368  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.474314  normal  0.672241 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1549  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  39.6 
 
 		 515 aa  367  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.178403  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.14 
 
 		 501 aa  365  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  41.34 
 
 		 501 aa  367  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6621  ABC transporter related protein  44.31 
 
 		 525 aa  368  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823555 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000341  ribose ABC transport system ATP-binding protein RbsA  40.64 
 
 		 501 aa  366  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2030  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.2 
 
 		 507 aa  365  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.288148  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0010  D-ribose transporter ATP binding protein  41.25 
 
 		 500 aa  367  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19490  ABC transporter related  40.56 
 
 		 509 aa  365  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.524485  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0080  xylose transporter ATP-binding subunit  39.88 
 
 		 513 aa  368  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2885  xylose transporter ATP-binding subunit  39.92 
 
 		 518 aa  365  1e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.700201  normal  0.945677 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2379  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  41.25 
 
 		 506 aa  365  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0154  xylose transporter ATP-binding subunit  39.92 
 
 		 513 aa  365  1e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2301  xylose transporter ATP-binding subunit  40.12 
 
 		 518 aa  364  2e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.538906  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4153  xylose transporter ATP-binding subunit  38.68 
 
 		 513 aa  364  2e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  40.77 
 
 		 507 aa  364  2e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2475  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.08 
 
 		 504 aa  364  2e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.74587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3406  ABC transporter related  40.04 
 
 		 507 aa  363  3e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.551553  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3837  xylose transporter ATP-binding subunit  41.21 
 
 		 515 aa  363  4e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.623686  normal  0.377794 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1342  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  39.4 
 
 		 515 aa  363  4e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.172168  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4914  xylose transporter ATP-binding subunit  41.21 
 
 		 515 aa  363  4e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00466146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06145  D-ribose transporter ATP binding protein  40.24 
 
 		 501 aa  363  4e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1620  ABC transporter related  39.51 
 
 		 493 aa  363  5.0000000000000005e-99  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2424  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  41.05 
 
 		 506 aa  363  6e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.6193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  41.1 
 
 		 508 aa  363  6e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2335  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  41.05 
 
 		 506 aa  363  6e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.728797  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1865  ABC transporter related  40.2 
 
 		 508 aa  362  8e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.251568  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0058  xylose transporter ATP-binding subunit  38.48 
 
 		 510 aa  362  1e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4100  xylose transporter ATP-binding subunit  38.48 
 
 		 510 aa  362  1e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1049  ABC transporter related protein  41.01 
 
 		 496 aa  361  2e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  40.41 
 
 		 524 aa  360  2e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  40.41 
 
 		 524 aa  360  2e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  39.43 
 
 		 506 aa  360  3e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.2 
 
 		 525 aa  360  4e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6267  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  41.2 
 
 		 511 aa  360  4e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>