More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0689 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0689  ABC transporter related  100 
 
 		 507 aa  999    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.135079 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4627  ABC transporter related  58 
 
 		 505 aa  554  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.556183 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6621  ABC transporter related protein  44.24 
 
 		 525 aa  391  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823555 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  42.74 
 
 		 497 aa  386  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  46.83 
 
 		 508 aa  380  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0936  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.03 
 
 		 529 aa  378  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.411664  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  45.56 
 
 		 499 aa  378  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3706  ABC transporter related  45.53 
 
 		 506 aa  377  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.594267  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  44.49 
 
 		 505 aa  377  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1425  ABC transporter related  41.83 
 
 		 530 aa  377  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.577416  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0878  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.03 
 
 		 529 aa  378  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.459343  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06145  D-ribose transporter ATP binding protein  41.19 
 
 		 501 aa  374  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2279  ABC transporter related  44.49 
 
 		 500 aa  374  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.488082  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  41.94 
 
 		 494 aa  372  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0010  D-ribose transporter ATP binding protein  42.35 
 
 		 500 aa  373  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000341  ribose ABC transport system ATP-binding protein RbsA  41.58 
 
 		 501 aa  374  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  40.57 
 
 		 501 aa  374  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  40.62 
 
 		 495 aa  371  1e-101  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2021  xylose transporter ATP-binding subunit  40.39 
 
 		 504 aa  371  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8259  ABC transporter-related protein  46.08 
 
 		 509 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.332477  decreased coverage  0.00989255 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0839  ABC transporter related  42.94 
 
 		 515 aa  369  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500489  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  45 
 
 		 504 aa  369  1e-101  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  38.14 
 
 		 504 aa  369  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  37.71 
 
 		 496 aa  368  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2649  ABC transporter related protein  43.09 
 
 		 518 aa  367  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.684281  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6710  ABC transporter, ATP binding subunit (putative high-affinity D-ribose transport)  44.47 
 
 		 507 aa  368  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11533  normal  0.0914748 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  41.51 
 
 		 510 aa  365  1e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0989  ABC transporter related  40.29 
 
 		 499 aa  365  1e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86187  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3062  ABC transporter related  40.37 
 
 		 525 aa  364  2e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.187248  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  45.3 
 
 		 514 aa  364  2e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2401  ABC transporter related protein  43.96 
 
 		 505 aa  364  2e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2122  ABC transporter related  41.76 
 
 		 511 aa  364  2e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3851  ABC transporter related protein  43.76 
 
 		 521 aa  364  2e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0711  ABC transporter related  44.64 
 
 		 495 aa  363  3e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0109933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  45.62 
 
 		 519 aa  363  3e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1371  D-ribose transporter ATP binding protein  41.55 
 
 		 504 aa  363  3e-99  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  40.5 
 
 		 503 aa  363  3e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0515  D-ribose transporter ATP binding protein  40.95 
 
 		 501 aa  363  4e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  38.89 
 
 		 501 aa  362  8e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0906  ABC sugar transporter, ATPase subunit  45.06 
 
 		 517 aa  361  1e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0350072 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4109  ABC transporter related  41.93 
 
 		 512 aa  362  1e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000359898 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  44.58 
 
 		 495 aa  362  1e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.89 
 
 		 501 aa  362  1e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2683  ABC transporter related  44.81 
 
 		 499 aa  362  1e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3406  ABC transporter related  40.98 
 
 		 507 aa  361  2e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.551553  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4656  ABC transporter related  40.84 
 
 		 516 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.489627  normal  0.659628 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4769  ABC transporter related  43.72 
 
 		 494 aa  361  2e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.132101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3604  ABC transporter related  41.45 
 
 		 513 aa  360  2e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.88039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4541  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.55 
 
 		 501 aa  360  3e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.956339  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1866  D-xylose ABC transporter, ATPase subunit  41.33 
 
 		 509 aa  360  3e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.486033 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1860  xylose ABC transporter ATPase  41.05 
 
 		 517 aa  360  4e-98  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.05268  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2884  ABC transporter-like protein  45.82 
 
 		 502 aa  359  6e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.913699 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  41.67 
 
 		 506 aa  358  9.999999999999999e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1035  ABC sugar transporter, ATPase subunit  44.31 
 
 		 516 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.474314  normal  0.672241 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  41.91 
 
 		 506 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5684  ABC transporter related  43.8 
 
 		 509 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.878529 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0580  ABC transporter related  39.54 
 
 		 508 aa  357  1.9999999999999998e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.677056  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3699  ABC transporter related protein  41.8 
 
 		 510 aa  358  1.9999999999999998e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92688  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  43.84 
 
 		 508 aa  357  2.9999999999999997e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  40.81 
 
 		 517 aa  357  3.9999999999999996e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1873  ABC transporter related  42.11 
 
 		 506 aa  357  3.9999999999999996e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.242655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4608  ABC transporter related  44.13 
 
 		 519 aa  356  5.999999999999999e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3977  D-ribose transporter ATP binding protein  41.19 
 
 		 501 aa  356  6.999999999999999e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  41.88 
 
 		 516 aa  355  6.999999999999999e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2138  L-arabinose transport ATP-binding protein araG  41.27 
 
 		 516 aa  356  6.999999999999999e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.960653  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  39.57 
 
 		 499 aa  355  7.999999999999999e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  39.57 
 
 		 499 aa  355  7.999999999999999e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2913  ABC transporter related  40.37 
 
 		 512 aa  355  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.169153  normal  0.630322 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4757  ABC transporter related  41.04 
 
 		 516 aa  355  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139896  normal  0.719575 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0341  D-ribose transporter ATP binding protein  39.8 
 
 		 501 aa  355  1e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0405  ABC transporter related protein  43.74 
 
 		 514 aa  355  1e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.251912  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0613  ABC transporter related  40.08 
 
 		 497 aa  354  2e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12280  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  44.67 
 
 		 505 aa  354  2e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.171798  normal  0.428152 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2242  ABC transporter related  39.79 
 
 		 499 aa  354  2e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3274  ABC transporter related  45.57 
 
 		 496 aa  355  2e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.201144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5597  ABC transporter related  43.41 
 
 		 503 aa  354  2e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.609428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0544  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.78 
 
 		 521 aa  354  2e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4474  ABC transporter related  40.2 
 
 		 511 aa  354  2e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.882977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3235  ABC transporter related  42.12 
 
 		 506 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.365394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  43.66 
 
 		 503 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2746  ABC transporter related  42.39 
 
 		 524 aa  353  2.9999999999999997e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.565066 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3073  ABC transporter related  40.28 
 
 		 508 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4866  ABC transporter related  45.23 
 
 		 513 aa  353  2.9999999999999997e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  44.7 
 
 		 516 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0157  ABC transporter related  38.62 
 
 		 507 aa  353  5e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  40.99 
 
 		 497 aa  353  5e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3463  ABC transporter related  43.91 
 
 		 516 aa  353  5e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.309481 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1620  ABC transporter related  37.74 
 
 		 493 aa  352  5.9999999999999994e-96  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10500  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  43.41 
 
 		 499 aa  352  7e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2997  ABC transporter related  41.96 
 
 		 519 aa  352  7e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.746869  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0372  ABC transporter related  42.32 
 
 		 509 aa  352  7e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  41.58 
 
 		 501 aa  352  8e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2474  ABC transporter related  43.62 
 
 		 513 aa  352  8e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0599981  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  41.34 
 
 		 523 aa  352  1e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.59 
 
 		 525 aa  352  1e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1612  ABC transporter related  41.37 
 
 		 496 aa  352  1e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1508  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.37 
 
 		 496 aa  352  1e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.106354  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2238  ABC transporter related  41.53 
 
 		 504 aa  351  1e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1760  ribose ABC transporter ATP-binding protein  41.37 
 
 		 496 aa  352  1e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.185473  hitchhiker  0.0000761209 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0384  ABC transporter related  43.06 
 
 		 509 aa  351  2e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>