More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4866 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4866  ABC transporter related  100 
 
 		 513 aa  1031    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2244  ABC transporter related  70.48 
 
 		 495 aa  686    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3675  ABC sugar transporter, ATPase subunit  71.29 
 
 		 495 aa  714    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.973573  normal  0.0920445 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0962  ABC transporter related  71.29 
 
 		 495 aa  714    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3274  ABC transporter related  70.94 
 
 		 496 aa  685    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.201144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4769  ABC transporter related  52.04 
 
 		 494 aa  481  1e-134  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.132101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2683  ABC transporter related  51.92 
 
 		 499 aa  478  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1247  ABC sugar transporter, ATPase subunit  51.92 
 
 		 499 aa  476  1e-133  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.886783  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2907  ABC transporter related  51.72 
 
 		 499 aa  477  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.78181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3406  ABC transporter related  48.44 
 
 		 507 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.551553  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0544  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  50.2 
 
 		 521 aa  465  9.999999999999999e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0542  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  49.8 
 
 		 511 aa  459  9.999999999999999e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.146804  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4263  ABC transporter related  47.46 
 
 		 508 aa  441  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.208543  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3707  ABC transporter related  47.38 
 
 		 508 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.934804 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1859  ABC transporter related  44.17 
 
 		 499 aa  432  1e-120  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345151 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3409  ABC transporter related  46.17 
 
 		 508 aa  428  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  41.65 
 
 		 496 aa  414  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5263  ABC transporter related  47.37 
 
 		 530 aa  415  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.417586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4850  ABC transporter related  44.81 
 
 		 503 aa  409  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  44.94 
 
 		 520 aa  404  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  45.45 
 
 		 514 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  45.45 
 
 		 514 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  45.45 
 
 		 514 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  44.53 
 
 		 515 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  45.38 
 
 		 512 aa  395  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0291  ABC transporter related  41.54 
 
 		 514 aa  396  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  45.67 
 
 		 495 aa  397  1e-109  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  45.88 
 
 		 513 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  44.27 
 
 		 516 aa  397  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  45.67 
 
 		 513 aa  395  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  43.57 
 
 		 514 aa  392  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  42.34 
 
 		 497 aa  395  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  45.27 
 
 		 514 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4768  ABC transporter related  42.65 
 
 		 503 aa  389  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957059  normal  0.347139 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  43.96 
 
 		 517 aa  392  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  44.87 
 
 		 512 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  44.35 
 
 		 517 aa  392  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  42.66 
 
 		 506 aa  389  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  44.87 
 
 		 512 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1653  ABC transporter related  44.34 
 
 		 519 aa  387  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0555167  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2021  xylose transporter ATP-binding subunit  42.54 
 
 		 504 aa  387  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0289  ABC transporter related  42.35 
 
 		 506 aa  388  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  44.4 
 
 		 512 aa  388  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  39.88 
 
 		 501 aa  387  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5155  ABC transporter related  41.88 
 
 		 512 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.2 
 
 		 507 aa  384  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0391  ABC transporter related protein  40.89 
 
 		 499 aa  384  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.302991  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2808  ABC transporter related  44.02 
 
 		 501 aa  381  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4658  ABC transporter related  44.72 
 
 		 497 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  42.91 
 
 		 519 aa  380  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  42 
 
 		 507 aa  381  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0372  ABC transporter related  41.95 
 
 		 509 aa  379  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  41.94 
 
 		 494 aa  379  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0157  ABC transporter related  40.59 
 
 		 507 aa  380  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  42 
 
 		 507 aa  380  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2725  ABC transporter related  42.86 
 
 		 501 aa  380  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1620  ABC transporter related  38.1 
 
 		 493 aa  377  1e-103  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1655  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  43.44 
 
 		 517 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  42.97 
 
 		 510 aa  377  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  40.84 
 
 		 506 aa  377  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0211  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  43.64 
 
 		 517 aa  378  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40873  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6621  ABC transporter related protein  43.22 
 
 		 525 aa  376  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823555 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  43.97 
 
 		 504 aa  375  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  36.97 
 
 		 504 aa  375  1e-103  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  43.71 
 
 		 499 aa  376  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1612  ABC transporter related  41.68 
 
 		 496 aa  376  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1760  ribose ABC transporter ATP-binding protein  41.68 
 
 		 496 aa  376  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.185473  hitchhiker  0.0000761209 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  40.4 
 
 		 492 aa  377  1e-103  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  41.67 
 
 		 501 aa  375  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1508  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.68 
 
 		 496 aa  376  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.106354  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3104  ABC transporter related protein  42.6 
 
 		 511 aa  378  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0286  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  43.44 
 
 		 517 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0197  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  43.44 
 
 		 517 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  42.6 
 
 		 513 aa  372  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19490  ABC transporter related  42.13 
 
 		 509 aa  373  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.524485  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3604  ABC transporter related  42.66 
 
 		 513 aa  375  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.88039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0515  D-ribose transporter ATP binding protein  40.93 
 
 		 501 aa  373  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.73 
 
 		 494 aa  372  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3310  ABC transporter related  43.35 
 
 		 505 aa  374  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156818  hitchhiker  0.00192862 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  40.73 
 
 		 494 aa  372  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.73 
 
 		 494 aa  372  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.73 
 
 		 494 aa  374  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1711  ABC transporter related  43.55 
 
 		 517 aa  374  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0318504 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.52 
 
 		 494 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0921  ABC transporter related  41.92 
 
 		 496 aa  373  1e-102  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6710  ABC transporter, ATP binding subunit (putative high-affinity D-ribose transport)  42.29 
 
 		 507 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11533  normal  0.0914748 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2524  ABC transporter related  41.63 
 
 		 505 aa  373  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0735  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.52 
 
 		 494 aa  372  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0689  ABC transporter related  45.23 
 
 		 507 aa  369  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.135079 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  42.71 
 
 		 508 aa  371  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.32 
 
 		 494 aa  369  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  40.52 
 
 		 495 aa  370  1e-101  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0010  D-ribose transporter ATP binding protein  41.45 
 
 		 500 aa  370  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3073  ABC transporter related  42.09 
 
 		 508 aa  370  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1063  ABC transporter related  42.97 
 
 		 517 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627623  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3706  ABC transporter related  42.45 
 
 		 506 aa  369  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.594267  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.72 
 
 		 501 aa  370  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1519  ABC transporter related  42.97 
 
 		 517 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0747025  normal  0.022294 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1543  ABC transporter related  42.97 
 
 		 517 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0849155  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  42.51 
 
 		 507 aa  369  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.117363 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>