More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5263 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5263  ABC transporter related  100 
 
 		 530 aa  1053    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.417586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3406  ABC transporter related  53.52 
 
 		 507 aa  502  1e-141  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.551553  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0544  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  51.89 
 
 		 521 aa  486  1e-136  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0542  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  51.5 
 
 		 511 aa  479  1e-134  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.146804  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1247  ABC sugar transporter, ATPase subunit  53.75 
 
 		 499 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.886783  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2683  ABC transporter related  52.6 
 
 		 499 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2907  ABC transporter related  53.12 
 
 		 499 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.78181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4769  ABC transporter related  52.16 
 
 		 494 aa  453  1.0000000000000001e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.132101  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3707  ABC transporter related  46.55 
 
 		 508 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.934804 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3409  ABC transporter related  46.55 
 
 		 508 aa  428  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4263  ABC transporter related  47.65 
 
 		 508 aa  426  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.208543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3274  ABC transporter related  46.71 
 
 		 496 aa  406  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.201144  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4866  ABC transporter related  47.37 
 
 		 513 aa  404  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0143  D-xylose ABC transporter, ATPase subunit  42.28 
 
 		 513 aa  396  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3770  xylose transporter ATP-binding subunit  42.28 
 
 		 513 aa  397  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4943  xylose transporter ATP-binding subunit  42.28 
 
 		 513 aa  397  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0106818 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3955  xylose transporter ATP-binding subunit  42.28 
 
 		 513 aa  397  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4063  xylose transporter ATP-binding subunit  42.28 
 
 		 513 aa  397  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0147  xylose transporter ATP-binding subunit  42.28 
 
 		 513 aa  397  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3890  xylose transporter ATP-binding subunit  42.08 
 
 		 513 aa  394  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0962  ABC transporter related  44.4 
 
 		 495 aa  392  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0289  ABC transporter related  42.21 
 
 		 506 aa  392  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1859  ABC transporter related  40.99 
 
 		 499 aa  390  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345151 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3675  ABC sugar transporter, ATPase subunit  44.2 
 
 		 495 aa  389  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.973573  normal  0.0920445 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2244  ABC transporter related  44.6 
 
 		 495 aa  387  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  42.49 
 
 		 517 aa  386  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0154  xylose transporter ATP-binding subunit  42.08 
 
 		 513 aa  387  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.92 
 
 		 507 aa  382  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  40.92 
 
 		 507 aa  381  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  40.92 
 
 		 507 aa  381  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2863  ABC transporter related  43.56 
 
 		 518 aa  381  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.18747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2604  ABC transporter related  41.45 
 
 		 522 aa  381  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.916852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  40.25 
 
 		 497 aa  376  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  41.12 
 
 		 506 aa  379  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  38.52 
 
 		 501 aa  377  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1865  ABC transporter related  42.97 
 
 		 508 aa  378  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.251568  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  40.04 
 
 		 506 aa  374  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4608  ABC transporter related  41.75 
 
 		 519 aa  373  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  41.92 
 
 		 508 aa  374  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4100  xylose transporter ATP-binding subunit  40.68 
 
 		 510 aa  371  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  42.03 
 
 		 516 aa  371  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3166  ABC transporter related  39.07 
 
 		 500 aa  371  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0058  xylose transporter ATP-binding subunit  40.68 
 
 		 510 aa  371  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6710  ABC transporter, ATP binding subunit (putative high-affinity D-ribose transport)  41.75 
 
 		 507 aa  369  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11533  normal  0.0914748 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  39.15 
 
 		 499 aa  367  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1653  ABC transporter related  42.77 
 
 		 519 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0555167  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  43.44 
 
 		 495 aa  367  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3706  ABC transporter related  42.27 
 
 		 506 aa  367  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.594267  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2010  ABC transporter related  37.47 
 
 		 500 aa  367  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2266  ABC transporter related  39.47 
 
 		 499 aa  366  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000122283  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  39.15 
 
 		 499 aa  367  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0010  D-ribose transporter ATP binding protein  40.91 
 
 		 500 aa  366  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0080  xylose transporter ATP-binding subunit  40.68 
 
 		 513 aa  367  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1049  ABC transporter related protein  40.53 
 
 		 496 aa  368  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3604  ABC transporter related  41.53 
 
 		 513 aa  366  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.88039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0239  ABC transporter related protein  42.57 
 
 		 512 aa  366  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.301252  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  40.24 
 
 		 510 aa  365  1e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  41.33 
 
 		 514 aa  365  1e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.34 
 
 		 501 aa  365  1e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  38.34 
 
 		 501 aa  365  1e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  41.33 
 
 		 514 aa  365  1e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2808  ABC transporter ATP-binding protein  39.47 
 
 		 510 aa  365  1e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1046  ABC transporter related  40.35 
 
 		 521 aa  365  2e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1655  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.29 
 
 		 517 aa  364  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  36.92 
 
 		 494 aa  365  2e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000081797  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1711  ABC transporter related  42.05 
 
 		 517 aa  364  2e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0318504 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0286  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  41.29 
 
 		 517 aa  364  2e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0197  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  41.29 
 
 		 517 aa  364  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1425  ABC transporter related  40.85 
 
 		 530 aa  363  3e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.577416  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  39.8 
 
 		 503 aa  363  3e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0843  ABC transporter related  44.49 
 
 		 496 aa  363  5.0000000000000005e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.896355  normal  0.0750454 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1860  xylose ABC transporter ATPase  39.68 
 
 		 517 aa  363  6e-99  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.05268  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  41.13 
 
 		 514 aa  362  8e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2021  xylose transporter ATP-binding subunit  41.4 
 
 		 504 aa  362  9e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0211  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.21 
 
 		 517 aa  362  1e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40873  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1465  ABC transporter related  41.53 
 
 		 517 aa  362  1e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.748698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1425  ABC transporter related  41.53 
 
 		 517 aa  362  1e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1915  ABC transporter related  42.3 
 
 		 502 aa  362  1e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.483253  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19490  ABC transporter related  39.92 
 
 		 509 aa  362  1e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.524485  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2787  ABC transporter for sugar (aldose) ATP-binding protein  40.17 
 
 		 495 aa  362  1e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0149064  normal  0.48477 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3041  ABC transporter related protein  37.92 
 
 		 511 aa  361  2e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1519  ABC transporter related  41.28 
 
 		 517 aa  360  3e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0747025  normal  0.022294 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1063  ABC transporter related  41.28 
 
 		 517 aa  360  3e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627623  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4435  xylose transporter ATP-binding subunit  40.28 
 
 		 513 aa  360  3e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1543  ABC transporter related  41.28 
 
 		 517 aa  360  3e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0849155  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0515  D-ribose transporter ATP binding protein  40.16 
 
 		 501 aa  360  5e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6012  ABC transporter related  40.21 
 
 		 861 aa  359  8e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  39.18 
 
 		 524 aa  358  9.999999999999999e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2945  ABC transporter related  41.17 
 
 		 541 aa  358  9.999999999999999e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.854224 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4683  ABC sugar transporter, ATPase subunit  40.68 
 
 		 517 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.532161  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4153  xylose transporter ATP-binding subunit  40.08 
 
 		 513 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  41.27 
 
 		 508 aa  357  1.9999999999999998e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  38.93 
 
 		 495 aa  358  1.9999999999999998e-97  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5810  ABC transporter related  40.4 
 
 		 511 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.644683  normal  0.0896237 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  37.6 
 
 		 494 aa  357  1.9999999999999998e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3073  ABC transporter related  40.79 
 
 		 508 aa  357  2.9999999999999997e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6711  ABC transporter related  39.69 
 
 		 511 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3073  ABC transporter related  40.6 
 
 		 511 aa  357  2.9999999999999997e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.697432  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0116  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  37.19 
 
 		 492 aa  357  3.9999999999999996e-97  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  37.45 
 
 		 496 aa  357  3.9999999999999996e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>