More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0962 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_2244  ABC transporter related  87.07 
 
 		 495 aa  873    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0962  ABC transporter related  100 
 
 		 495 aa  997    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4866  ABC transporter related  71.29 
 
 		 513 aa  695    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3675  ABC sugar transporter, ATPase subunit  94.75 
 
 		 495 aa  956    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.973573  normal  0.0920445 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3274  ABC transporter related  68.95 
 
 		 496 aa  667    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.201144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4769  ABC transporter related  51.84 
 
 		 494 aa  467  9.999999999999999e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.132101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2683  ABC transporter related  51.93 
 
 		 499 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1247  ABC sugar transporter, ATPase subunit  51.52 
 
 		 499 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.886783  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2907  ABC transporter related  51.12 
 
 		 499 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.78181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1859  ABC transporter related  45.66 
 
 		 499 aa  442  1e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345151 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3406  ABC transporter related  47.02 
 
 		 507 aa  440  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.551553  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4263  ABC transporter related  47.42 
 
 		 508 aa  427  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.208543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0544  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  47.35 
 
 		 521 aa  427  1e-118  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0542  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  46.94 
 
 		 511 aa  421  1e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.146804  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  46.25 
 
 		 514 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  46.08 
 
 		 514 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  46.25 
 
 		 514 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  45.51 
 
 		 520 aa  413  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  46.12 
 
 		 515 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3707  ABC transporter related  45.77 
 
 		 508 aa  414  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.934804 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  44.89 
 
 		 508 aa  414  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  45.77 
 
 		 516 aa  411  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  46.41 
 
 		 512 aa  409  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  46.5 
 
 		 514 aa  409  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  45.93 
 
 		 517 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2808  ABC transporter related  44.44 
 
 		 501 aa  409  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  43.18 
 
 		 506 aa  406  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  45.51 
 
 		 507 aa  406  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  45.18 
 
 		 504 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4850  ABC transporter related  42.97 
 
 		 503 aa  405  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  45.33 
 
 		 513 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  45.51 
 
 		 507 aa  405  1e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3409  ABC transporter related  44.74 
 
 		 508 aa  403  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  41.85 
 
 		 496 aa  404  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  45.31 
 
 		 507 aa  404  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0289  ABC transporter related  45.08 
 
 		 506 aa  404  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  43.58 
 
 		 513 aa  402  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3104  ABC transporter related protein  44.38 
 
 		 511 aa  400  9.999999999999999e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  43.84 
 
 		 495 aa  400  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  45.12 
 
 		 513 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0291  ABC transporter related  43.38 
 
 		 514 aa  401  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  45.9 
 
 		 512 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3784  ABC transporter related  44.24 
 
 		 506 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.915652  hitchhiker  0.00808443 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  40.49 
 
 		 501 aa  399  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3129  ABC transporter related  45.56 
 
 		 504 aa  396  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149382  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  44.11 
 
 		 507 aa  395  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  41.96 
 
 		 494 aa  394  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4010  ABC transporter related protein  40.98 
 
 		 500 aa  393  1e-108  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5263  ABC transporter related  44.4 
 
 		 530 aa  392  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.417586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  44.69 
 
 		 512 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4658  ABC transporter related  45.29 
 
 		 497 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4200  ABC transporter related  44.04 
 
 		 528 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  44.69 
 
 		 512 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  44.9 
 
 		 514 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4723  ABC transporter related  44.24 
 
 		 506 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.943494  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  42.54 
 
 		 497 aa  389  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5597  ABC transporter related  44.58 
 
 		 503 aa  391  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.609428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0885  ABC sugar transporter, ATPase subunit  43.23 
 
 		 506 aa  389  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533742  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3235  ABC transporter related  41.82 
 
 		 506 aa  389  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.365394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  44.38 
 
 		 503 aa  392  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.41 
 
 		 501 aa  389  1e-107  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0501  ABC transporter related  41.41 
 
 		 511 aa  386  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548503 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  43.24 
 
 		 517 aa  387  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  42.47 
 
 		 494 aa  388  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  41.97 
 
 		 524 aa  387  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1465  ABC transporter related  44.65 
 
 		 517 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.748698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4768  ABC transporter related  42.68 
 
 		 503 aa  388  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957059  normal  0.347139 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2524  ABC transporter related  44.06 
 
 		 505 aa  385  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  43.38 
 
 		 506 aa  386  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  41.89 
 
 		 499 aa  385  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  43.09 
 
 		 510 aa  384  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  42.54 
 
 		 503 aa  382  1e-105  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0809  ABC transporter related  42.11 
 
 		 509 aa  383  1e-105  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3182  ABC transporter related  44.81 
 
 		 518 aa  383  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.868778  normal  0.140125 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  41.34 
 
 		 501 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2492  ABC transporter related protein  39.55 
 
 		 498 aa  384  1e-105  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  40.2 
 
 		 501 aa  385  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1425  ABC transporter related  44.44 
 
 		 517 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2010  ABC transporter related  40.04 
 
 		 500 aa  384  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  41.89 
 
 		 499 aa  385  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03635  fused D-ribose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  41.77 
 
 		 501 aa  379  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.483932  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4117  D-ribose transporter ATP binding protein  41.97 
 
 		 501 aa  381  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159229 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4218  ABC transporter related protein  41.97 
 
 		 501 aa  381  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03580  hypothetical protein  41.77 
 
 		 501 aa  379  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550483  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4683  ABC sugar transporter, ATPase subunit  44.24 
 
 		 517 aa  380  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.532161  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1519  ABC transporter related  44.44 
 
 		 517 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0747025  normal  0.022294 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5185  D-ribose transporter ATP binding protein  41.77 
 
 		 501 aa  379  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0631054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1063  ABC transporter related  44.44 
 
 		 517 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627623  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3548  ABC transporter related  43.43 
 
 		 506 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.650239  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3706  ABC transporter related  42.44 
 
 		 506 aa  379  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.594267  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4215  D-ribose transporter ATP binding protein  41.94 
 
 		 516 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.777457 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  41.7 
 
 		 492 aa  380  1e-104  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1543  ABC transporter related  44.44 
 
 		 517 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0849155  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4819  ABC transporter related  43.43 
 
 		 506 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0757413  normal  0.247948 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0779  ABC transporter related protein  43.74 
 
 		 528 aa  379  1e-104  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.63436  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3965  D-ribose transporter ATP binding protein  41.77 
 
 		 501 aa  379  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0832  ABC transporter related  42.11 
 
 		 520 aa  381  1e-104  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  41.02 
 
 		 494 aa  380  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000081797  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5464  ABC transporter related  43.43 
 
 		 506 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.146779 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0154  xylose transporter ATP-binding subunit  41.58 
 
 		 513 aa  379  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>