More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3675 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_2244  ABC transporter related  86.49 
 
 		 495 aa  869    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141236  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4866  ABC transporter related  71.29 
 
 		 513 aa  694    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3675  ABC sugar transporter, ATPase subunit  100 
 
 		 495 aa  998    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.973573  normal  0.0920445 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0962  ABC transporter related  94.75 
 
 		 495 aa  956    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3274  ABC transporter related  68.35 
 
 		 496 aa  665    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.201144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4769  ABC transporter related  51.33 
 
 		 494 aa  469  1.0000000000000001e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.132101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2683  ABC transporter related  52.13 
 
 		 499 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1247  ABC sugar transporter, ATPase subunit  51.52 
 
 		 499 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.886783  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2907  ABC transporter related  51.12 
 
 		 499 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.78181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1859  ABC transporter related  45.25 
 
 		 499 aa  438  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345151 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3406  ABC transporter related  46.71 
 
 		 507 aa  437  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.551553  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4263  ABC transporter related  48.04 
 
 		 508 aa  430  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.208543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0544  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  47.14 
 
 		 521 aa  428  1e-118  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  46.04 
 
 		 514 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  46.04 
 
 		 514 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  46.5 
 
 		 514 aa  418  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0542  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  46.73 
 
 		 511 aa  421  1e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.146804  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  46.04 
 
 		 514 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  45.92 
 
 		 515 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  44.9 
 
 		 520 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  45.16 
 
 		 516 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3707  ABC transporter related  46.39 
 
 		 508 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.934804 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  46 
 
 		 507 aa  414  1e-114  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  45.79 
 
 		 507 aa  412  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  43.99 
 
 		 506 aa  413  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  45.73 
 
 		 517 aa  413  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0289  ABC transporter related  45.7 
 
 		 506 aa  412  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  45.79 
 
 		 507 aa  414  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2808  ABC transporter related  45.12 
 
 		 501 aa  415  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3409  ABC transporter related  45.36 
 
 		 508 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  43.89 
 
 		 508 aa  408  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  44.98 
 
 		 504 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4850  ABC transporter related  43.18 
 
 		 503 aa  405  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  41.65 
 
 		 496 aa  404  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  45.38 
 
 		 512 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  43.84 
 
 		 495 aa  400  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  43.18 
 
 		 513 aa  400  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  45.08 
 
 		 512 aa  397  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4658  ABC transporter related  45.29 
 
 		 497 aa  398  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3129  ABC transporter related  44.35 
 
 		 504 aa  395  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149382  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  44.11 
 
 		 513 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  44.31 
 
 		 513 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  39.88 
 
 		 501 aa  395  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5597  ABC transporter related  44.58 
 
 		 503 aa  392  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.609428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  44.38 
 
 		 514 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  44.08 
 
 		 512 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0291  ABC transporter related  42.57 
 
 		 514 aa  392  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  44.08 
 
 		 512 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  43.44 
 
 		 506 aa  393  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3104  ABC transporter related protein  43.64 
 
 		 511 aa  393  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  44.18 
 
 		 503 aa  394  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  43.29 
 
 		 507 aa  393  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3784  ABC transporter related  43.03 
 
 		 506 aa  390  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.915652  hitchhiker  0.00808443 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5263  ABC transporter related  44.2 
 
 		 530 aa  389  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.417586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  42.27 
 
 		 494 aa  389  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2010  ABC transporter related  40.65 
 
 		 500 aa  389  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  41.34 
 
 		 494 aa  392  1e-107  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4010  ABC transporter related protein  40.78 
 
 		 500 aa  392  1e-107  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  41.77 
 
 		 524 aa  390  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  41.63 
 
 		 494 aa  389  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000081797  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  41.48 
 
 		 499 aa  386  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  43.85 
 
 		 517 aa  387  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1465  ABC transporter related  45.56 
 
 		 517 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.748698  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  41.48 
 
 		 499 aa  386  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4215  D-ribose transporter ATP binding protein  41.73 
 
 		 516 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.777457 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2492  ABC transporter related protein  39.35 
 
 		 498 aa  387  1e-106  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  42.68 
 
 		 510 aa  387  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2524  ABC transporter related  44.47 
 
 		 505 aa  388  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0809  ABC transporter related  41.82 
 
 		 509 aa  382  1e-105  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0779  ABC transporter related protein  43.53 
 
 		 528 aa  385  1e-105  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.63436  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4768  ABC transporter related  42.28 
 
 		 503 aa  383  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957059  normal  0.347139 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0501  ABC transporter related  41.01 
 
 		 511 aa  383  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548503 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3235  ABC transporter related  41.21 
 
 		 506 aa  382  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.365394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2021  xylose transporter ATP-binding subunit  41.65 
 
 		 504 aa  383  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1063  ABC transporter related  45.36 
 
 		 517 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627623  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  44.24 
 
 		 499 aa  382  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4165  D-ribose transporter ATP binding protein  41.53 
 
 		 501 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.846402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.39 
 
 		 501 aa  385  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4094  D-ribose transporter ATP binding protein  41.53 
 
 		 516 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1425  ABC transporter related  45.36 
 
 		 517 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1543  ABC transporter related  45.36 
 
 		 517 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0849155  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4109  D-ribose transporter ATP binding protein  41.53 
 
 		 516 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114584  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4274  D-ribose transporter ATP binding protein  41.53 
 
 		 516 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03635  fused D-ribose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  40.93 
 
 		 501 aa  379  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.483932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4218  ABC transporter related protein  41.13 
 
 		 501 aa  381  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1519  ABC transporter related  45.36 
 
 		 517 aa  382  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0747025  normal  0.022294 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3182  ABC transporter related  44.6 
 
 		 518 aa  380  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.868778  normal  0.140125 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1655  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  44.24 
 
 		 517 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4117  D-ribose transporter ATP binding protein  41.13 
 
 		 501 aa  381  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159229 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4683  ABC sugar transporter, ATPase subunit  44.96 
 
 		 517 aa  380  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.532161  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0211  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  44.85 
 
 		 517 aa  381  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40873  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0832  ABC transporter related  41.82 
 
 		 520 aa  381  1e-104  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  43.32 
 
 		 519 aa  380  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3706  ABC transporter related  42.24 
 
 		 506 aa  380  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.594267  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  39.18 
 
 		 501 aa  381  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1711  ABC transporter related  45.36 
 
 		 517 aa  379  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0318504 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0286  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  44.24 
 
 		 517 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0921  ABC transporter related  42.42 
 
 		 496 aa  380  1e-104  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0197  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  44.24 
 
 		 517 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4265  D-ribose transporter ATP binding protein  40.93 
 
 		 501 aa  379  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146477  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>