More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0921 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0921  ABC transporter related  100 
 
 
496 aa  986    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1792  ABC transporter related  58.86 
 
 
494 aa  586  1e-166  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0113555  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  49.09 
 
 
503 aa  462  1e-129  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0157  ABC transporter related  47.2 
 
 
507 aa  442  1e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0106  xylose transporter ATP-binding subunit  45.29 
 
 
505 aa  436  1e-121  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  43.9 
 
 
497 aa  432  1e-120  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  43.12 
 
 
523 aa  432  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  44.24 
 
 
499 aa  434  1e-120  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  45.4 
 
 
494 aa  433  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2021  xylose transporter ATP-binding subunit  45.89 
 
 
504 aa  426  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3166  ABC transporter related  44.85 
 
 
500 aa  423  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2266  ABC transporter related  45.81 
 
 
499 aa  421  1e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000122283  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.18 
 
 
525 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  42.31 
 
 
514 aa  418  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  42.31 
 
 
514 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  44.33 
 
 
501 aa  421  1e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  44.53 
 
 
501 aa  421  1e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  41.78 
 
 
513 aa  419  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  42.31 
 
 
514 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2725  ABC transporter related  41.45 
 
 
501 aa  422  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  44.9 
 
 
499 aa  418  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  48.48 
 
 
495 aa  417  9.999999999999999e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0613  ABC transporter related  44.02 
 
 
497 aa  415  9.999999999999999e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0832  ABC transporter related  46.15 
 
 
520 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  43.03 
 
 
514 aa  417  9.999999999999999e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  44.9 
 
 
499 aa  418  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1683  ABC transporter related  43.04 
 
 
503 aa  417  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305806  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0809  ABC transporter related  46.15 
 
 
509 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19490  ABC transporter related  45.33 
 
 
509 aa  418  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.524485  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3855  ABC transporter related  43.15 
 
 
513 aa  414  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  41.82 
 
 
524 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  42.57 
 
 
525 aa  412  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  44.92 
 
 
496 aa  414  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1601  ABC transporter related  47.03 
 
 
525 aa  413  1e-114  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6711  ABC transporter related  41.09 
 
 
511 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  41.82 
 
 
524 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  41.25 
 
 
524 aa  412  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4267  ABC transporter related  42.53 
 
 
513 aa  414  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844031  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1049  ABC transporter related protein  43.38 
 
 
496 aa  410  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  41.61 
 
 
527 aa  410  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  41.04 
 
 
524 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  41.04 
 
 
524 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4174  D-ribose transporter ATP binding protein  42.83 
 
 
501 aa  409  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283711  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1580  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.37 
 
 
505 aa  411  1e-113  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.598954  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  41.04 
 
 
524 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2808  ABC transporter ATP-binding protein  44.4 
 
 
510 aa  410  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2929  ABC transporter related  40.83 
 
 
521 aa  408  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4183  ABC transporter related  42.53 
 
 
513 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  41.53 
 
 
516 aa  411  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  44.15 
 
 
494 aa  409  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000081797  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0226  ABC transporter related  41.15 
 
 
503 aa  410  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.973654  normal  0.104566 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1703  ABC transporter related protein  44.69 
 
 
504 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2823  ABC transporter related  40.98 
 
 
511 aa  407  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0058  xylose transporter ATP-binding subunit  43 
 
 
510 aa  408  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  40.56 
 
 
510 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4100  xylose transporter ATP-binding subunit  43 
 
 
510 aa  408  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  41.72 
 
 
495 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  40.37 
 
 
516 aa  407  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  43.84 
 
 
501 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  42 
 
 
524 aa  407  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  44.08 
 
 
495 aa  406  1.0000000000000001e-112  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5810  ABC transporter related  40.89 
 
 
511 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.644683  normal  0.0896237 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3569  ABC transporter related  39.88 
 
 
516 aa  403  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.585388  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000341  ribose ABC transport system ATP-binding protein RbsA  42.57 
 
 
501 aa  405  1e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6267  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  40.28 
 
 
511 aa  403  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1711  ABC transporter related  42.83 
 
 
517 aa  404  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0318504 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7809  ABC transporter related  42.29 
 
 
512 aa  404  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  43.75 
 
 
504 aa  405  1e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1549  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  43.53 
 
 
515 aa  404  1e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.178403  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  42.8 
 
 
501 aa  402  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  42.48 
 
 
497 aa  404  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  41.67 
 
 
495 aa  403  1e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2524  ABC transporter related  43.69 
 
 
505 aa  402  1e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06145  D-ribose transporter ATP binding protein  41.96 
 
 
501 aa  402  1e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1465  ABC transporter related  42.42 
 
 
517 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.748698  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4010  ABC transporter related protein  43.86 
 
 
500 aa  399  9.999999999999999e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0211  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.01 
 
 
517 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40873  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2863  ABC transporter related  43.35 
 
 
518 aa  399  9.999999999999999e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.18747  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  42.6 
 
 
501 aa  400  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  39.39 
 
 
505 aa  399  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1342  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  43.33 
 
 
515 aa  401  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.172168  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1425  ABC transporter related  42.42 
 
 
517 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1371  D-ribose transporter ATP binding protein  42.57 
 
 
504 aa  399  9.999999999999999e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0341  D-ribose transporter ATP binding protein  41.99 
 
 
501 aa  400  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3310  ABC transporter related  40.73 
 
 
505 aa  401  9.999999999999999e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156818  hitchhiker  0.00192862 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0154  xylose transporter ATP-binding subunit  41.68 
 
 
513 aa  399  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  44.53 
 
 
494 aa  398  1e-109  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  41.53 
 
 
504 aa  396  1e-109  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  41.52 
 
 
517 aa  396  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3890  xylose transporter ATP-binding subunit  42.43 
 
 
513 aa  396  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4683  ABC sugar transporter, ATPase subunit  42.21 
 
 
517 aa  398  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.532161  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4943  xylose transporter ATP-binding subunit  42.43 
 
 
513 aa  396  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0106818 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4265  D-ribose transporter ATP binding protein  42.02 
 
 
501 aa  398  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146477  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3279  ABC transporter related  43.97 
 
 
505 aa  396  1e-109  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1134  ABC transporter related  41.22 
 
 
506 aa  395  1e-109  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000497905  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5185  D-ribose transporter ATP binding protein  41.82 
 
 
501 aa  395  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0631054  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  39.55 
 
 
520 aa  397  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  39.72 
 
 
515 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4071  ABC transporter related  40.12 
 
 
500 aa  396  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.414928  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4115  D-ribose transporter ATP binding protein  42.22 
 
 
501 aa  398  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.684938  normal  0.0182067 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>