More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1601 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1601  ABC transporter related  100 
 
 
525 aa  1044    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  49.5 
 
 
494 aa  455  1e-127  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  47.77 
 
 
495 aa  457  1e-127  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1667  ABC transporter related  49.59 
 
 
502 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.338027  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  47.24 
 
 
495 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  44.88 
 
 
497 aa  436  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  48.28 
 
 
503 aa  434  1e-120  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0832  ABC transporter related  46.93 
 
 
520 aa  435  1e-120  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0711  ABC transporter related  45.95 
 
 
495 aa  434  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0109933  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0809  ABC transporter related  46.93 
 
 
509 aa  434  1e-120  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09550  ABC transporter related  50.5 
 
 
500 aa  430  1e-119  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.58805  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2492  ABC transporter related protein  46.83 
 
 
498 aa  432  1e-119  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  44.76 
 
 
499 aa  431  1e-119  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2808  ABC transporter ATP-binding protein  46.45 
 
 
510 aa  432  1e-119  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  46.25 
 
 
494 aa  426  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2148  L-arabinose transporter ATP-binding protein  45.36 
 
 
507 aa  426  1e-118  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2475  L-arabinose transporter ATP-binding protein  45.16 
 
 
504 aa  428  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.74587  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4658  ABC transporter related  43.64 
 
 
497 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0106  xylose transporter ATP-binding subunit  46.23 
 
 
505 aa  423  1e-117  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0735  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  43.35 
 
 
494 aa  421  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  41.37 
 
 
512 aa  421  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  46 
 
 
495 aa  419  1e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2021  xylose transporter ATP-binding subunit  46.61 
 
 
504 aa  421  1e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1911  L-arabinose transporter ATP-binding protein  45.17 
 
 
506 aa  422  1e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389706  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2808  ABC transporter related  44.17 
 
 
501 aa  421  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  45.14 
 
 
501 aa  421  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  43.56 
 
 
494 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  43.56 
 
 
494 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2330  L-arabinose transporter ATP-binding protein  45.47 
 
 
507 aa  416  9.999999999999999e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4639  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  43.35 
 
 
494 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.202571  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  45.31 
 
 
501 aa  415  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2474  ABC transporter related  43.58 
 
 
513 aa  417  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0599981  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3279  ABC transporter related  46.23 
 
 
505 aa  418  9.999999999999999e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  42.94 
 
 
496 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  43.35 
 
 
494 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  43.35 
 
 
494 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  43.15 
 
 
497 aa  417  9.999999999999999e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  43.56 
 
 
494 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  43.15 
 
 
496 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  45.21 
 
 
499 aa  414  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0921  ABC transporter related  47.03 
 
 
496 aa  413  1e-114  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  46.33 
 
 
504 aa  414  1e-114  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  43.15 
 
 
494 aa  415  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  43.79 
 
 
517 aa  412  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  42.86 
 
 
508 aa  412  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2266  ABC transporter related  44.15 
 
 
499 aa  414  1e-114  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000122283  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2010  ABC transporter related  45.51 
 
 
500 aa  415  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  46.87 
 
 
501 aa  412  1e-114  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  46.87 
 
 
501 aa  412  1e-114  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  45.21 
 
 
499 aa  414  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2246  L-arabinose transporter ATP-binding protein  45.19 
 
 
511 aa  415  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000548441 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2030  L-arabinose transporter ATP-binding protein  45.19 
 
 
507 aa  412  1e-114  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.288148  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7809  ABC transporter related  44.06 
 
 
512 aa  413  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01868  fused L-arabinose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  43.26 
 
 
504 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.97097  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  43.52 
 
 
503 aa  411  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1743  ABC transporter related protein  43.26 
 
 
504 aa  410  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.50451  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4335  ABC transporter related  45.4 
 
 
511 aa  411  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.975481  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1998  L-arabinose transporter ATP-binding protein  44.07 
 
 
523 aa  409  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2131  L-arabinose transporter ATP-binding protein  43.46 
 
 
504 aa  410  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00340592  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01857  hypothetical protein  43.26 
 
 
504 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.974378  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1286  L-arabinose transporter ATP-binding protein  43.46 
 
 
504 aa  410  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00939133  hitchhiker  0.000000120675 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1996  L-arabinose transporter ATP-binding protein  43.26 
 
 
504 aa  410  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00548515  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2636  L-arabinose transporter ATP-binding protein  43.26 
 
 
504 aa  410  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000458478 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  43.23 
 
 
514 aa  409  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2262  L-arabinose transporter ATP-binding protein  44.27 
 
 
523 aa  411  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1735  L-arabinose transporter ATP-binding protein  43.26 
 
 
504 aa  410  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1683  ABC transporter related  44.06 
 
 
503 aa  409  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305806  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  42.62 
 
 
516 aa  411  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1884  L-arabinose transporter ATP-binding protein  44.07 
 
 
523 aa  409  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.326668  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1134  ABC transporter related  44.65 
 
 
506 aa  410  1e-113  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000497905  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2524  ABC transporter related  44.74 
 
 
505 aa  410  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0289  ABC transporter related  43.74 
 
 
506 aa  409  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3855  ABC transporter related  42.25 
 
 
513 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3312  ABC transporter-related protein  41.88 
 
 
515 aa  406  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  43.51 
 
 
507 aa  406  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1465  ABC transporter related  42.6 
 
 
517 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.748698  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  40.56 
 
 
512 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2122  ABC transporter related  44.16 
 
 
511 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0211  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  43.15 
 
 
517 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40873  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3129  ABC transporter related  42.57 
 
 
504 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149382  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  43.38 
 
 
506 aa  405  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  42.37 
 
 
504 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0157  ABC transporter related  46.35 
 
 
507 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1425  ABC transporter related  42.6 
 
 
517 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4598  ABC transporter related  44.49 
 
 
506 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0392025 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1024  L-arabinose transporter ATP-binding protein  43.26 
 
 
504 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1711  ABC transporter related  42.6 
 
 
517 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0318504 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2787  ABC transporter for sugar (aldose) ATP-binding protein  45.15 
 
 
495 aa  408  1.0000000000000001e-112  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0149064  normal  0.48477 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  42.02 
 
 
507 aa  406  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3776  L-arabinose transporter ATP-binding protein  43.88 
 
 
514 aa  407  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.947339  normal  0.636393 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  43.71 
 
 
507 aa  408  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  43.51 
 
 
507 aa  406  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0813  ABC transporter related  43.41 
 
 
499 aa  402  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  42.42 
 
 
527 aa  404  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  42.42 
 
 
524 aa  405  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3706  ABC transporter related  44.11 
 
 
506 aa  402  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.594267  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1580  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.37 
 
 
505 aa  405  1e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.598954  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4267  ABC transporter related  42.05 
 
 
513 aa  402  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844031  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  46.11 
 
 
494 aa  403  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000081797  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0580  ABC transporter related  44.53 
 
 
508 aa  404  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.677056  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>