More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3182 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3182  ABC transporter related  100 
 
 		 518 aa  1033    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.868778  normal  0.140125 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3418  ABC transporter related  64.76 
 
 		 526 aa  623  1e-177  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.247847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4850  ABC transporter related  58.62 
 
 		 503 aa  559  1e-158  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0291  ABC transporter related  57.68 
 
 		 514 aa  555  1e-157  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3109  ABC transporter related  54.11 
 
 		 500 aa  533  1e-150  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00977673  hitchhiker  0.0000567489 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4768  ABC transporter related  55.89 
 
 		 503 aa  528  1e-149  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957059  normal  0.347139 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  48.48 
 
 		 504 aa  512  1e-144  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  48.5 
 
 		 501 aa  491  1e-137  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  46.71 
 
 		 513 aa  455  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  46.33 
 
 		 494 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000081797  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  47.31 
 
 		 514 aa  447  1.0000000000000001e-124  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  45.29 
 
 		 497 aa  444  1e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  48.48 
 
 		 515 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  46.81 
 
 		 505 aa  441  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  48.29 
 
 		 517 aa  437  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  46.22 
 
 		 524 aa  434  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  44.22 
 
 		 503 aa  434  1e-120  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  46.77 
 
 		 514 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  46.77 
 
 		 514 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  47.31 
 
 		 516 aa  432  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  46.77 
 
 		 514 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  48.11 
 
 		 512 aa  433  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  46.67 
 
 		 495 aa  431  1e-119  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2929  ABC transporter related  48.43 
 
 		 521 aa  431  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  47.47 
 
 		 520 aa  431  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  46.53 
 
 		 524 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3166  ABC transporter related  44.27 
 
 		 500 aa  427  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0809  ABC transporter related  43.51 
 
 		 509 aa  424  1e-117  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  42.63 
 
 		 494 aa  424  1e-117  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.63 
 
 		 494 aa  424  1e-117  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.42 
 
 		 494 aa  425  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.63 
 
 		 494 aa  424  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  45.4 
 
 		 497 aa  422  1e-117  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  44.11 
 
 		 494 aa  422  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  47.18 
 
 		 512 aa  425  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.83 
 
 		 494 aa  422  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  46.08 
 
 		 499 aa  425  1e-117  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  46.32 
 
 		 524 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  44.66 
 
 		 524 aa  424  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  46.57 
 
 		 516 aa  424  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0989  ABC transporter related  41.87 
 
 		 499 aa  420  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86187  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0832  ABC transporter related  43.31 
 
 		 520 aa  421  1e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0735  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.42 
 
 		 494 aa  421  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  45.27 
 
 		 527 aa  420  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.22 
 
 		 494 aa  421  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  41.53 
 
 		 496 aa  420  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2904  ABC transporter related  44.65 
 
 		 503 aa  420  1e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7809  ABC transporter related  44.4 
 
 		 512 aa  419  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  47.67 
 
 		 508 aa  420  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  46.4 
 
 		 513 aa  421  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  45.31 
 
 		 523 aa  419  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1242  sugar ATP-binding ABC transporter protein  45.56 
 
 		 518 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  43.37 
 
 		 517 aa  417  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1711  ABC transporter related  46.25 
 
 		 517 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0318504 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  41.94 
 
 		 496 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  45.11 
 
 		 524 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  44.4 
 
 		 524 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  46.57 
 
 		 513 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  42.22 
 
 		 496 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  44.4 
 
 		 524 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3041  ABC transporter related  47.38 
 
 		 500 aa  416  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4639  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.42 
 
 		 494 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.202571  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4267  ABC transporter related  45.38 
 
 		 513 aa  414  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0211  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  46.03 
 
 		 517 aa  412  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40873  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  46.37 
 
 		 514 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  46.98 
 
 		 512 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3855  ABC transporter related  44.53 
 
 		 513 aa  413  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  44.51 
 
 		 510 aa  414  1e-114  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6012  ABC transporter related  45.29 
 
 		 861 aa  414  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  41.37 
 
 		 492 aa  412  1e-114  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  46.98 
 
 		 512 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  41.33 
 
 		 495 aa  414  1e-114  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  44.15 
 
 		 507 aa  409  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  43 
 
 		 499 aa  409  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  44.15 
 
 		 507 aa  410  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3073  ABC transporter related  43.4 
 
 		 508 aa  412  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  43 
 
 		 499 aa  409  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1049  ABC transporter related protein  43.93 
 
 		 496 aa  412  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3048  ABC transporter related protein  39.76 
 
 		 513 aa  409  1e-113  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.182553  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4183  ABC transporter related  43.93 
 
 		 513 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1683  ABC transporter related  44.85 
 
 		 503 aa  411  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305806  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2725  ABC transporter related  46.36 
 
 		 501 aa  411  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2279  ABC transporter related  44.98 
 
 		 500 aa  410  1e-113  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.488082  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  43.86 
 
 		 506 aa  410  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  44.15 
 
 		 507 aa  409  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1564  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  40.49 
 
 		 502 aa  406  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  43.15 
 
 		 506 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.76 
 
 		 525 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1655  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  45.85 
 
 		 517 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2266  ABC transporter related  42.36 
 
 		 499 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000122283  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3310  ABC transporter related  46.15 
 
 		 505 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156818  hitchhiker  0.00192862 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3312  ABC transporter-related protein  44.94 
 
 		 515 aa  408  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1620  ABC transporter related  38.99 
 
 		 493 aa  408  1.0000000000000001e-112  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4065  ABC transporter related  46.43 
 
 		 505 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0517348  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3129  ABC transporter related  45.86 
 
 		 504 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149382  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  42.13 
 
 		 494 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1465  ABC transporter related  45.63 
 
 		 517 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.748698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  44.49 
 
 		 507 aa  408  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0286  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  45.85 
 
 		 517 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0197  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  45.85 
 
 		 517 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>