More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3418 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3418  ABC transporter related  100 
 
 		 526 aa  1058    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.247847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3182  ABC transporter related  64.6 
 
 		 518 aa  625  1e-178  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.868778  normal  0.140125 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4850  ABC transporter related  57.6 
 
 		 503 aa  541  9.999999999999999e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0291  ABC transporter related  53.52 
 
 		 514 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4768  ABC transporter related  54.4 
 
 		 503 aa  504  1e-141  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957059  normal  0.347139 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3109  ABC transporter related  51.99 
 
 		 500 aa  503  1e-141  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00977673  hitchhiker  0.0000567489 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  46.43 
 
 		 504 aa  475  1e-133  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  46.64 
 
 		 501 aa  466  9.999999999999999e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  43.74 
 
 		 503 aa  430  1e-119  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  43.98 
 
 		 495 aa  425  1e-117  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  44.81 
 
 		 524 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  44.81 
 
 		 524 aa  423  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  44.82 
 
 		 527 aa  419  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  44.81 
 
 		 524 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  45.02 
 
 		 524 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  44.81 
 
 		 524 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  43.39 
 
 		 497 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  44.82 
 
 		 516 aa  416  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  44.36 
 
 		 524 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  43.08 
 
 		 513 aa  415  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1242  sugar ATP-binding ABC transporter protein  44.06 
 
 		 518 aa  415  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2929  ABC transporter related  45.42 
 
 		 521 aa  414  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3312  ABC transporter-related protein  42.21 
 
 		 515 aa  412  1e-114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  45.33 
 
 		 520 aa  414  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0809  ABC transporter related  41.85 
 
 		 509 aa  412  1e-114  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  43.11 
 
 		 494 aa  412  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  43.59 
 
 		 510 aa  411  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  44.06 
 
 		 515 aa  412  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0832  ABC transporter related  41.65 
 
 		 520 aa  410  1e-113  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  45.15 
 
 		 517 aa  410  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  43.85 
 
 		 507 aa  405  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  45.05 
 
 		 514 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0157  ABC transporter related  40.2 
 
 		 507 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  43.85 
 
 		 507 aa  406  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  44.22 
 
 		 495 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  43.14 
 
 		 524 aa  407  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  42.74 
 
 		 494 aa  405  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000081797  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  43.85 
 
 		 507 aa  405  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  44.87 
 
 		 516 aa  405  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  44.03 
 
 		 506 aa  404  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  43.75 
 
 		 514 aa  405  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  44.85 
 
 		 514 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  44.85 
 
 		 514 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1049  ABC transporter related protein  42.38 
 
 		 496 aa  402  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1134  ABC transporter related  42.03 
 
 		 506 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000497905  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.68 
 
 		 525 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  44.57 
 
 		 512 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  45.29 
 
 		 497 aa  400  9.999999999999999e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4065  ABC transporter related  45.92 
 
 		 505 aa  399  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0517348  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  43.65 
 
 		 506 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3855  ABC transporter related  43.31 
 
 		 513 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2904  ABC transporter related  41.5 
 
 		 503 aa  397  1e-109  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  43.71 
 
 		 513 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6012  ABC transporter related  40.97 
 
 		 861 aa  396  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  42.71 
 
 		 495 aa  397  1e-109  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  44.14 
 
 		 513 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1683  ABC transporter related  43.22 
 
 		 503 aa  397  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305806  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4183  ABC transporter related  43.31 
 
 		 513 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4267  ABC transporter related  42.71 
 
 		 513 aa  398  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844031  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2266  ABC transporter related  40.04 
 
 		 499 aa  395  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000122283  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2823  ABC transporter related  41.89 
 
 		 511 aa  395  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0813  ABC transporter related  40.88 
 
 		 499 aa  393  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  44.33 
 
 		 504 aa  395  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.44 
 
 		 501 aa  394  1e-108  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  44.25 
 
 		 523 aa  392  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  41.03 
 
 		 496 aa  393  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0813  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.88 
 
 		 499 aa  394  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2326  ABC transporter related protein  39.17 
 
 		 501 aa  392  1e-108  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2524  ABC transporter related  42.16 
 
 		 505 aa  394  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0289  ABC transporter related  43.34 
 
 		 506 aa  395  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.47 
 
 		 494 aa  392  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4639  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.07 
 
 		 494 aa  389  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.202571  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0735  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.47 
 
 		 494 aa  392  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0116  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.56 
 
 		 492 aa  390  1e-107  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  41.47 
 
 		 494 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.47 
 
 		 494 aa  390  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.27 
 
 		 494 aa  390  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  43.39 
 
 		 525 aa  392  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  41.59 
 
 		 517 aa  391  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2725  ABC transporter related  44.14 
 
 		 501 aa  390  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  43.66 
 
 		 505 aa  390  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  43.75 
 
 		 512 aa  391  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7809  ABC transporter related  41.29 
 
 		 512 aa  389  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3310  ABC transporter related  44.16 
 
 		 505 aa  391  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156818  hitchhiker  0.00192862 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0437  ABC transporter related  43.22 
 
 		 501 aa  390  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  44.2 
 
 		 508 aa  389  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  40.32 
 
 		 496 aa  390  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3166  ABC transporter related  40.67 
 
 		 500 aa  389  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.47 
 
 		 494 aa  390  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  39.24 
 
 		 501 aa  391  1e-107  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.07 
 
 		 494 aa  389  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  40.83 
 
 		 496 aa  391  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0157  sugar ABC transporter ATP-binding protein  40.68 
 
 		 499 aa  390  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000963677 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  42.44 
 
 		 507 aa  391  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0989  ABC transporter related  39.92 
 
 		 499 aa  391  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86187  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2122  ABC transporter related  41.65 
 
 		 511 aa  389  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1632  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  44.69 
 
 		 486 aa  385  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2021  xylose transporter ATP-binding subunit  39.96 
 
 		 504 aa  387  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1620  ABC transporter related  39.24 
 
 		 493 aa  387  1e-106  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3041  ABC transporter related  45.15 
 
 		 500 aa  387  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>