More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0437 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0437  ABC transporter related  100 
 
 		 501 aa  1022    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4900  D-ribose transporter ATP binding protein  44.91 
 
 		 501 aa  437  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200163  hitchhiker  0.000000993507 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  45.6 
 
 		 497 aa  435  1e-120  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  44.4 
 
 		 501 aa  432  1e-120  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  46.12 
 
 		 494 aa  431  1e-119  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0299142 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03635  fused D-ribose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  45.11 
 
 		 501 aa  431  1e-119  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.483932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4218  ABC transporter related protein  45.11 
 
 		 501 aa  430  1e-119  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  45.31 
 
 		 501 aa  429  1e-119  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4274  D-ribose transporter ATP binding protein  44.91 
 
 		 516 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5185  D-ribose transporter ATP binding protein  45.11 
 
 		 501 aa  429  1e-119  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0631054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4094  D-ribose transporter ATP binding protein  44.91 
 
 		 516 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4109  D-ribose transporter ATP binding protein  45.11 
 
 		 516 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114584  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  44.42 
 
 		 508 aa  429  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03580  hypothetical protein  45.11 
 
 		 501 aa  431  1e-119  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550483  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4245  D-ribose transporter ATP binding protein  45.11 
 
 		 501 aa  429  1e-119  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0036959 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3965  D-ribose transporter ATP binding protein  45.11 
 
 		 501 aa  431  1e-119  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2808  ABC transporter ATP-binding protein  45.45 
 
 		 510 aa  431  1e-119  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4165  D-ribose transporter ATP binding protein  44.91 
 
 		 501 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.846402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4265  D-ribose transporter ATP binding protein  45.11 
 
 		 501 aa  429  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146477  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4117  D-ribose transporter ATP binding protein  45.11 
 
 		 501 aa  430  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159229 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  45.58 
 
 		 495 aa  426  1e-118  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4215  D-ribose transporter ATP binding protein  44.71 
 
 		 516 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.777457 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  44.02 
 
 		 501 aa  428  1e-118  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  45 
 
 		 507 aa  427  1e-118  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4115  D-ribose transporter ATP binding protein  44.91 
 
 		 501 aa  427  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.684938  normal  0.0182067 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1655  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  46.93 
 
 		 517 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3104  ABC transporter related protein  45.89 
 
 		 511 aa  424  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  45.58 
 
 		 523 aa  424  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4174  D-ribose transporter ATP binding protein  44.91 
 
 		 501 aa  423  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283711  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0341  D-ribose transporter ATP binding protein  43.37 
 
 		 501 aa  424  1e-117  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0286  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  46.93 
 
 		 517 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0197  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  46.93 
 
 		 517 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2595  ABC transporter related  45.09 
 
 		 537 aa  419  1e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.870253  normal  0.943264 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2803  ABC transporter related  44.38 
 
 		 501 aa  419  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.508475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  43.12 
 
 		 501 aa  419  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  45.8 
 
 		 495 aa  422  1e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1667  ABC transporter related  43.9 
 
 		 502 aa  420  1e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.338027  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2122  ABC transporter related  44.67 
 
 		 511 aa  421  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  44.25 
 
 		 492 aa  419  1e-116  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  46.9 
 
 		 510 aa  419  1e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  44.11 
 
 		 501 aa  420  1e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6710  ABC transporter, ATP binding subunit (putative high-affinity D-ribose transport)  46.34 
 
 		 507 aa  421  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11533  normal  0.0914748 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0116  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.57 
 
 		 492 aa  415  9.999999999999999e-116  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3977  D-ribose transporter ATP binding protein  44.11 
 
 		 501 aa  418  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0613  ABC transporter related  42.8 
 
 		 497 aa  415  9.999999999999999e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0211  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  45.9 
 
 		 517 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40873  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1711  ABC transporter related  45.14 
 
 		 517 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0318504 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0157  ABC transporter related  42.91 
 
 		 507 aa  418  9.999999999999999e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  45.13 
 
 		 495 aa  414  1e-114  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.71 
 
 		 525 aa  414  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4183  ABC transporter related  44.18 
 
 		 513 aa  413  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  45.51 
 
 		 525 aa  415  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  43.96 
 
 		 524 aa  412  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1425  ABC transporter related  45.7 
 
 		 517 aa  414  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1683  ABC transporter related  45.69 
 
 		 503 aa  412  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305806  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4850  ABC transporter related  44.67 
 
 		 503 aa  414  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7809  ABC transporter related  43.98 
 
 		 512 aa  413  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0289  ABC transporter related  43.89 
 
 		 506 aa  414  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0010  D-ribose transporter ATP binding protein  45.27 
 
 		 500 aa  413  1e-114  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1465  ABC transporter related  45.7 
 
 		 517 aa  415  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.748698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1519  ABC transporter related  45.49 
 
 		 517 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0747025  normal  0.022294 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06145  D-ribose transporter ATP binding protein  43.55 
 
 		 501 aa  409  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  44.91 
 
 		 517 aa  411  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4683  ABC sugar transporter, ATPase subunit  44.88 
 
 		 517 aa  409  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.532161  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  44.18 
 
 		 506 aa  410  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  45.22 
 
 		 504 aa  410  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000341  ribose ABC transport system ATP-binding protein RbsA  43.55 
 
 		 501 aa  411  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1063  ABC transporter related  45.49 
 
 		 517 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627623  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1371  D-ribose transporter ATP binding protein  43.57 
 
 		 504 aa  411  1e-113  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5597  ABC transporter related  44.82 
 
 		 503 aa  410  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.609428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1543  ABC transporter related  45.49 
 
 		 517 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0849155  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3855  ABC transporter related  43.98 
 
 		 513 aa  411  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  44.78 
 
 		 495 aa  409  1e-113  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0106  xylose transporter ATP-binding subunit  43.23 
 
 		 505 aa  411  1e-113  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0779  ABC transporter related protein  45.67 
 
 		 528 aa  409  1e-113  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.63436  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  44.4 
 
 		 507 aa  405  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19490  ABC transporter related  43.45 
 
 		 509 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.524485  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  42.51 
 
 		 504 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3129  ABC transporter related  45.02 
 
 		 504 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149382  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4267  ABC transporter related  44.38 
 
 		 513 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3279  ABC transporter related  44.29 
 
 		 505 aa  405  1.0000000000000001e-112  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  44.31 
 
 		 508 aa  405  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  43.86 
 
 		 520 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0226  ABC transporter related  43.82 
 
 		 503 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.973654  normal  0.104566 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  43.54 
 
 		 497 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  44.4 
 
 		 507 aa  406  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2904  ABC transporter related  42.97 
 
 		 503 aa  402  1e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1760  ribose ABC transporter ATP-binding protein  42.05 
 
 		 496 aa  403  1e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.185473  hitchhiker  0.0000761209 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1508  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.05 
 
 		 496 aa  403  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.106354  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  42.77 
 
 		 494 aa  403  1e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09550  ABC transporter related  45.89 
 
 		 500 aa  402  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.58805  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3310  ABC transporter related  44.29 
 
 		 505 aa  403  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156818  hitchhiker  0.00192862 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  43.74 
 
 		 499 aa  402  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  42.97 
 
 		 506 aa  404  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1612  ABC transporter related  42.05 
 
 		 496 aa  403  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  43.8 
 
 		 512 aa  403  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  44.4 
 
 		 507 aa  405  1e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0291  ABC transporter related  43.51 
 
 		 514 aa  402  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  43.17 
 
 		 513 aa  400  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  43.17 
 
 		 513 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>