More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0813 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0813  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 499 aa  1011    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0813  ABC transporter related  99.8 
 
 		 499 aa  1009    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0157  sugar ABC transporter ATP-binding protein  99.6 
 
 		 499 aa  1006    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000963677 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3766  ABC transporter related  46.22 
 
 		 492 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0098796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2474  ABC transporter related  46.39 
 
 		 513 aa  448  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0599981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3279  ABC transporter related  46.95 
 
 		 505 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  42.11 
 
 		 505 aa  437  1e-121  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  46 
 
 		 504 aa  434  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  45.51 
 
 		 507 aa  434  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  45.58 
 
 		 513 aa  430  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  43.76 
 
 		 501 aa  430  1e-119  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3699  ABC transporter related protein  45.14 
 
 		 510 aa  428  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92688  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  45.38 
 
 		 513 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2913  ABC transporter related  47.62 
 
 		 512 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.169153  normal  0.630322 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2279  ABC transporter related  43.44 
 
 		 500 aa  425  1e-118  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.488082  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  45.79 
 
 		 494 aa  425  1e-118  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2010  ABC transporter related  44.94 
 
 		 500 aa  424  1e-117  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3174  ABC transporter related  47.52 
 
 		 512 aa  422  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  44.88 
 
 		 524 aa  422  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  43.18 
 
 		 504 aa  422  1e-117  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  45.29 
 
 		 514 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5597  ABC transporter related  46.08 
 
 		 503 aa  424  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.609428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  44.51 
 
 		 512 aa  424  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  44.78 
 
 		 512 aa  419  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  43.69 
 
 		 501 aa  419  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3129  ABC transporter related  45.29 
 
 		 504 aa  421  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149382  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  43.29 
 
 		 514 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  44.64 
 
 		 512 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0989  ABC transporter related  44.78 
 
 		 499 aa  419  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86187  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  43.5 
 
 		 514 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3706  ABC transporter related  44.33 
 
 		 506 aa  421  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.594267  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  45.23 
 
 		 503 aa  421  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  44.88 
 
 		 492 aa  419  1e-116  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  44.64 
 
 		 512 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  43.5 
 
 		 514 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  45.81 
 
 		 496 aa  421  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0291  ABC transporter related  43.79 
 
 		 514 aa  421  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  44.49 
 
 		 503 aa  420  1e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  44.78 
 
 		 499 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  44.78 
 
 		 499 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  42.56 
 
 		 508 aa  416  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  41.75 
 
 		 523 aa  416  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  44.86 
 
 		 513 aa  416  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4658  ABC transporter related  42.8 
 
 		 497 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0116  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  44.88 
 
 		 492 aa  413  1e-114  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  44.26 
 
 		 507 aa  412  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2021  xylose transporter ATP-binding subunit  44.62 
 
 		 504 aa  412  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0881  ABC transporter related protein  42.98 
 
 		 499 aa  414  1e-114  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.873937  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2458  ABC transporter-related protein  44.17 
 
 		 498 aa  415  1e-114  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  44.21 
 
 		 519 aa  412  1e-114  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  43.76 
 
 		 495 aa  412  1e-114  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4850  ABC transporter related  43.52 
 
 		 503 aa  412  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616228  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3104  ABC transporter related protein  45.93 
 
 		 511 aa  412  1e-114  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  44.93 
 
 		 514 aa  412  1e-114  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  44.06 
 
 		 507 aa  410  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  45.38 
 
 		 495 aa  409  1e-113  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1865  ABC transporter related  44.31 
 
 		 508 aa  409  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.251568  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  44.49 
 
 		 508 aa  411  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3596  ABC transporter related  40.61 
 
 		 509 aa  411  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.979323  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3784  ABC transporter related  44.24 
 
 		 506 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.915652  hitchhiker  0.00808443 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0711  ABC transporter related  42.86 
 
 		 495 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0109933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  44.06 
 
 		 507 aa  408  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  42.65 
 
 		 496 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3310  ABC transporter related  42.62 
 
 		 505 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156818  hitchhiker  0.00192862 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  42.13 
 
 		 497 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  43.47 
 
 		 501 aa  405  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0343  ABC transporter related  43.71 
 
 		 497 aa  405  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  42.01 
 
 		 516 aa  405  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3905  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  45.97 
 
 		 504 aa  406  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.876803  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4723  ABC transporter related  45.27 
 
 		 506 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.943494  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4109  ABC transporter related  45.56 
 
 		 512 aa  406  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000359898 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  43.27 
 
 		 515 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1620  ABC transporter related  41.75 
 
 		 493 aa  402  1e-111  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  42.13 
 
 		 494 aa  404  1e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.13 
 
 		 494 aa  404  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.13 
 
 		 494 aa  404  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0885  ABC sugar transporter, ATPase subunit  43.83 
 
 		 506 aa  402  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533742  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  42.65 
 
 		 520 aa  402  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.13 
 
 		 494 aa  404  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  43.3 
 
 		 517 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4200  ABC transporter related  45.06 
 
 		 528 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  42.89 
 
 		 494 aa  402  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1601  ABC transporter related  43.41 
 
 		 525 aa  402  1e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  44.06 
 
 		 504 aa  404  1e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2577  ABC transporter related  44.86 
 
 		 507 aa  403  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.589076 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.92 
 
 		 494 aa  402  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4474  ABC transporter related  44.84 
 
 		 511 aa  404  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.882977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4768  ABC transporter related  44.53 
 
 		 503 aa  402  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957059  normal  0.347139 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  43.89 
 
 		 516 aa  402  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1986  ABC transporter related  42.83 
 
 		 511 aa  404  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7809  ABC transporter related  42.36 
 
 		 512 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  40.73 
 
 		 510 aa  399  9.999999999999999e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.45 
 
 		 494 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  43.53 
 
 		 499 aa  402  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4718  ABC transporter related  44.84 
 
 		 564 aa  401  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  43.27 
 
 		 501 aa  401  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  42.21 
 
 		 524 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2686  ABC transporter related  44.73 
 
 		 516 aa  401  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4900  D-ribose transporter ATP binding protein  44.15 
 
 		 501 aa  400  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200163  hitchhiker  0.000000993507 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1612  ABC transporter related  43.88 
 
 		 496 aa  401  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>