More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3707 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3409  ABC transporter related  96.26 
 
 		 508 aa  969    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3707  ABC transporter related  100 
 
 		 508 aa  1025    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.934804 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4263  ABC transporter related  86.61 
 
 		 508 aa  879    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.208543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2683  ABC transporter related  55.31 
 
 		 499 aa  528  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1247  ABC sugar transporter, ATPase subunit  56.51 
 
 		 499 aa  524  1e-147  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.886783  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2907  ABC transporter related  56.31 
 
 		 499 aa  521  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.78181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3406  ABC transporter related  48.33 
 
 		 507 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.551553  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4769  ABC transporter related  50.7 
 
 		 494 aa  464  1e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.132101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0544  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  48.91 
 
 		 521 aa  455  1e-127  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0542  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  48.15 
 
 		 511 aa  453  1.0000000000000001e-126  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.146804  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4866  ABC transporter related  47.38 
 
 		 513 aa  439  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1859  ABC transporter related  45.78 
 
 		 499 aa  439  9.999999999999999e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345151 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5263  ABC transporter related  46.55 
 
 		 530 aa  434  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.417586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3274  ABC transporter related  45.38 
 
 		 496 aa  434  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.201144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2244  ABC transporter related  46.93 
 
 		 495 aa  431  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3675  ABC sugar transporter, ATPase subunit  46.39 
 
 		 495 aa  425  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.973573  normal  0.0920445 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0962  ABC transporter related  45.77 
 
 		 495 aa  422  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  44.62 
 
 		 495 aa  413  1e-114  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0289  ABC transporter related  43.2 
 
 		 506 aa  402  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  44.56 
 
 		 503 aa  401  9.999999999999999e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  43.41 
 
 		 507 aa  401  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  42.71 
 
 		 506 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  42.46 
 
 		 513 aa  399  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  42.74 
 
 		 506 aa  399  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  43.2 
 
 		 507 aa  399  9.999999999999999e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2904  ABC transporter related  40.8 
 
 		 503 aa  397  1e-109  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  43.17 
 
 		 517 aa  398  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  42.89 
 
 		 507 aa  397  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  41.38 
 
 		 494 aa  392  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1655  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.17 
 
 		 517 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0211  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.75 
 
 		 517 aa  394  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40873  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  43.31 
 
 		 505 aa  394  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0286  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  41.17 
 
 		 517 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0197  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  41.17 
 
 		 517 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1711  ABC transporter related  42.48 
 
 		 517 aa  389  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0318504 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  43.5 
 
 		 516 aa  389  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  43.29 
 
 		 508 aa  390  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2863  ABC transporter related  42.31 
 
 		 518 aa  388  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.18747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  42.16 
 
 		 514 aa  386  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  41.05 
 
 		 525 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  42.42 
 
 		 515 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  42.94 
 
 		 508 aa  387  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.4 
 
 		 525 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  42.36 
 
 		 520 aa  385  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3463  ABC transporter related  42.89 
 
 		 516 aa  383  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.309481 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1035  ABC sugar transporter, ATPase subunit  42.65 
 
 		 516 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.474314  normal  0.672241 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  42.57 
 
 		 519 aa  382  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  42.45 
 
 		 517 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  40.04 
 
 		 492 aa  385  1e-105  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3699  ABC transporter related protein  42.34 
 
 		 510 aa  382  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92688  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1508  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.5 
 
 		 496 aa  382  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.106354  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1612  ABC transporter related  41.5 
 
 		 496 aa  382  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4627  ABC transporter related  43.11 
 
 		 505 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.556183 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1760  ribose ABC transporter ATP-binding protein  41.5 
 
 		 496 aa  383  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.185473  hitchhiker  0.0000761209 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  42.39 
 
 		 499 aa  381  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0291  ABC transporter related  40.61 
 
 		 514 aa  380  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  40.4 
 
 		 524 aa  380  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  39.28 
 
 		 501 aa  379  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5684  ABC transporter related  42.36 
 
 		 509 aa  379  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.878529 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1653  ABC transporter related  41.96 
 
 		 519 aa  380  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0555167  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  42.39 
 
 		 499 aa  381  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3129  ABC transporter related  43 
 
 		 504 aa  379  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149382  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1188  ABC transporter related  39.01 
 
 		 511 aa  380  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.909394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  40.56 
 
 		 524 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1549  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  39.02 
 
 		 515 aa  379  1e-104  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.178403  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  41.18 
 
 		 501 aa  381  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  40.77 
 
 		 495 aa  379  1e-104  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2808  ABC transporter ATP-binding protein  40.28 
 
 		 510 aa  380  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4658  ABC transporter related  42.08 
 
 		 497 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6710  ABC transporter, ATP binding subunit (putative high-affinity D-ribose transport)  41.85 
 
 		 507 aa  381  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11533  normal  0.0914748 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  40.99 
 
 		 524 aa  378  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3166  ABC transporter related  40.96 
 
 		 500 aa  377  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1049  ABC transporter related protein  41.26 
 
 		 496 aa  377  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5810  ABC transporter related  41.82 
 
 		 511 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.644683  normal  0.0896237 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0116  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.6 
 
 		 492 aa  377  1e-103  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  40.69 
 
 		 527 aa  375  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  39.76 
 
 		 496 aa  375  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  40.6 
 
 		 524 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1063  ABC transporter related  41.08 
 
 		 517 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627623  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5155  ABC transporter related  40.44 
 
 		 512 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1342  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  39.02 
 
 		 515 aa  376  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.172168  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  40.36 
 
 		 524 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  43.06 
 
 		 494 aa  376  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  40.6 
 
 		 524 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1543  ABC transporter related  41.08 
 
 		 517 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0849155  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  41.4 
 
 		 514 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4850  ABC transporter related  40.52 
 
 		 503 aa  377  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  40.53 
 
 		 510 aa  377  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  39.96 
 
 		 516 aa  377  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0779  ABC transporter related protein  40.96 
 
 		 528 aa  376  1e-103  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.63436  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2266  ABC transporter related  40.41 
 
 		 499 aa  377  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000122283  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4683  ABC sugar transporter, ATPase subunit  40.68 
 
 		 517 aa  373  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.532161  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  41.4 
 
 		 512 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0885  ABC sugar transporter, ATPase subunit  41.2 
 
 		 506 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533742  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  42.09 
 
 		 512 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.59 
 
 		 501 aa  373  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  39.59 
 
 		 501 aa  374  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1425  ABC transporter related  41.08 
 
 		 517 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1212  ABC transporter related  41.07 
 
 		 511 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3604  ABC transporter related  40.12 
 
 		 513 aa  374  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.88039  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>