More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4541 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4541  putative ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 501 aa  996    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.956339  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0700  ABC transporter related  46.26 
 
 		 492 aa  441  9.999999999999999e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000766615  hitchhiker  0.000015345 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4608  ABC transporter related  41.43 
 
 		 519 aa  380  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1048  ABC transporter related  42.43 
 
 		 506 aa  371  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2021  xylose transporter ATP-binding subunit  40.4 
 
 		 504 aa  371  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1212  ABC transporter related  41.83 
 
 		 511 aa  371  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3596  ABC transporter related  40.64 
 
 		 509 aa  370  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.979323  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  41.2 
 
 		 517 aa  366  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  39.84 
 
 		 510 aa  366  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  39.68 
 
 		 495 aa  365  1e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  40.36 
 
 		 501 aa  365  1e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0291  ABC transporter related  43.22 
 
 		 514 aa  363  4e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  40.56 
 
 		 495 aa  363  5.0000000000000005e-99  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1035  ABC sugar transporter, ATPase subunit  42.23 
 
 		 516 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.474314  normal  0.672241 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  37.04 
 
 		 501 aa  362  9e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2251  ABC transporter-related protein  41.9 
 
 		 511 aa  361  2e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.687423  hitchhiker  0.00000468234 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  42.71 
 
 		 504 aa  360  3e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  38.55 
 
 		 497 aa  360  3e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0689  ABC transporter related  43.55 
 
 		 507 aa  360  3e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.135079 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  36.16 
 
 		 496 aa  359  5e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3699  ABC transporter related protein  40.2 
 
 		 510 aa  359  8e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92688  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5810  ABC transporter related  39.45 
 
 		 511 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.644683  normal  0.0896237 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4174  D-ribose transporter ATP binding protein  40.36 
 
 		 501 aa  358  9.999999999999999e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283711  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0989  ABC transporter related  37.7 
 
 		 499 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86187  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6711  ABC transporter related  39.76 
 
 		 511 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  39.56 
 
 		 501 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2443  ABC transporter related  41.33 
 
 		 494 aa  357  2.9999999999999997e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4215  D-ribose transporter ATP binding protein  39.64 
 
 		 516 aa  356  3.9999999999999996e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.777457 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  40.48 
 
 		 503 aa  357  3.9999999999999996e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2089  ABC transporter related protein  41.6 
 
 		 504 aa  356  5e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.558184  normal  0.156772 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5684  ABC transporter related  41.24 
 
 		 509 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.878529 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4109  D-ribose transporter ATP binding protein  39.64 
 
 		 516 aa  356  6.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114584  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4094  D-ribose transporter ATP binding protein  39.64 
 
 		 516 aa  355  8.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4274  D-ribose transporter ATP binding protein  39.64 
 
 		 516 aa  355  8.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4165  D-ribose transporter ATP binding protein  39.64 
 
 		 501 aa  355  8.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.846402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4245  D-ribose transporter ATP binding protein  39.64 
 
 		 501 aa  355  1e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0036959 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3463  ABC transporter related  41.48 
 
 		 516 aa  355  1e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.309481 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4218  ABC transporter related protein  39.64 
 
 		 501 aa  354  2e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  39.68 
 
 		 497 aa  354  2e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4117  D-ribose transporter ATP binding protein  39.64 
 
 		 501 aa  354  2e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159229 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0226  ABC transporter related  38.96 
 
 		 503 aa  354  2e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.973654  normal  0.104566 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0813  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  37.7 
 
 		 499 aa  353  2.9999999999999997e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6012  ABC transporter related  40.76 
 
 		 861 aa  353  4e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  41.16 
 
 		 519 aa  353  4e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0813  ABC transporter related  37.7 
 
 		 499 aa  353  5e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4850  ABC transporter related  42.18 
 
 		 503 aa  353  5e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4265  D-ribose transporter ATP binding protein  39.44 
 
 		 501 aa  352  7e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146477  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0157  sugar ABC transporter ATP-binding protein  37.7 
 
 		 499 aa  352  7e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000963677 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03635  fused D-ribose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  39.44 
 
 		 501 aa  352  1e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.483932  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  40.93 
 
 		 494 aa  352  1e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000081797  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03580  hypothetical protein  39.44 
 
 		 501 aa  352  1e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550483  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3965  D-ribose transporter ATP binding protein  39.44 
 
 		 501 aa  352  1e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4316  ABC transporter related  45.36 
 
 		 528 aa  352  1e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293814  normal  0.113849 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6621  ABC transporter related protein  40.59 
 
 		 525 aa  352  1e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823555 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5185  D-ribose transporter ATP binding protein  39.44 
 
 		 501 aa  351  2e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0631054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  40.61 
 
 		 499 aa  351  2e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2128  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.34 
 
 		 516 aa  351  2e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  36.64 
 
 		 504 aa  350  3e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0341  D-ribose transporter ATP binding protein  37.83 
 
 		 501 aa  350  3e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5219  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.08 
 
 		 515 aa  350  4e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5640  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.08 
 
 		 515 aa  350  4e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.273168  normal  0.0496803 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0010  D-ribose transporter ATP binding protein  38.43 
 
 		 500 aa  349  5e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6267  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  38.68 
 
 		 511 aa  349  6e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1425  ABC transporter related  39.88 
 
 		 530 aa  349  8e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.577416  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3207  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.24 
 
 		 515 aa  348  9e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0870889 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01030  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  40.12 
 
 		 522 aa  348  1e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4589  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.68 
 
 		 515 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173683 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2787  ABC transporter for sugar (aldose) ATP-binding protein  38.25 
 
 		 495 aa  348  1e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0149064  normal  0.48477 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3851  ABC transporter related protein  41.77 
 
 		 521 aa  348  1e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2401  ABC transporter related protein  41.73 
 
 		 505 aa  347  2e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3977  D-ribose transporter ATP binding protein  38.96 
 
 		 501 aa  347  2e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  38.69 
 
 		 514 aa  347  3e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0580  ABC transporter related  37.68 
 
 		 508 aa  347  3e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.677056  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1986  ABC transporter related  37.22 
 
 		 501 aa  347  3e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.437257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0046  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.48 
 
 		 522 aa  347  4e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.54995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  38.89 
 
 		 512 aa  347  4e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1224  ABC transporter related  37.08 
 
 		 510 aa  347  4e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000341  ribose ABC transport system ATP-binding protein RbsA  37.83 
 
 		 501 aa  346  6e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0046  sugar ABC transporter ATPase  38.69 
 
 		 513 aa  345  8e-94  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0138528  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  38.77 
 
 		 512 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  38.77 
 
 		 512 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3450  ABC transporter related protein  35.77 
 
 		 496 aa  345  8.999999999999999e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3040  ABC transporter related protein  41.15 
 
 		 529 aa  345  1e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  40.08 
 
 		 514 aa  345  2e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  39.2 
 
 		 512 aa  344  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  42.36 
 
 		 505 aa  344  2e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3279  ABC transporter related  38.72 
 
 		 505 aa  345  2e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3706  ABC transporter related  37.9 
 
 		 506 aa  344  2e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.594267  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  38.2 
 
 		 506 aa  344  2e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2474  ABC transporter related  39.92 
 
 		 513 aa  344  2e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0599981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06145  D-ribose transporter ATP binding protein  37.42 
 
 		 501 aa  344  2e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2595  ABC transporter related  38.2 
 
 		 537 aa  343  2.9999999999999997e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.870253  normal  0.943264 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4920  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.87 
 
 		 519 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.671617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0289  ABC transporter related  37.6 
 
 		 506 aa  343  2.9999999999999997e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4900  D-ribose transporter ATP binding protein  38.96 
 
 		 501 aa  343  4e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200163  hitchhiker  0.000000993507 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1915  ABC transporter related  38.1 
 
 		 502 aa  343  4e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.483253  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1792  ABC transporter related  39.84 
 
 		 494 aa  343  4e-93  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0113555  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4115  D-ribose transporter ATP binding protein  39.24 
 
 		 501 aa  343  5e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.684938  normal  0.0182067 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.08 
 
 		 525 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0767  putative sugar uptake ABC transporter ATP-binding protein  39.24 
 
 		 501 aa  342  7e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.162932 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>