More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1048 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1048  ABC transporter related  100 
 
 		 506 aa  1006    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2251  ABC transporter-related protein  80.92 
 
 		 511 aa  803    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.687423  hitchhiker  0.00000468234 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4096  ABC transporter related  58.63 
 
 		 525 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4208  ABC transporter related  58.63 
 
 		 525 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.577364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5626  ABC transporter related  58.05 
 
 		 504 aa  558  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000841006  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5991  ABC transporter related  58.05 
 
 		 504 aa  558  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122815  normal  0.14883 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6482  ABC transporter related  57.46 
 
 		 504 aa  558  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.611957  normal  0.251961 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6194  ABC transporter related  58.13 
 
 		 504 aa  552  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5925  ABC transporter related  58.33 
 
 		 504 aa  552  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.737944  normal  0.893001 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5962  ABC transporter related  57.06 
 
 		 503 aa  547  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0248969 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5517  ABC transporter related  56.04 
 
 		 516 aa  545  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.422457  normal  0.0683787 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2343  ATP binding protein of ABC transporter  57.49 
 
 		 502 aa  537  1e-151  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1224  ABC transporter related  53.46 
 
 		 510 aa  530  1e-149  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4809  ABC transporter related  53.77 
 
 		 549 aa  525  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0173038  hitchhiker  0.00297179 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1721  ABC transporter related  56.69 
 
 		 507 aa  513  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0492105  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1905  ABC transporter related  56.29 
 
 		 507 aa  511  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308353  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6222  sugar ABC transporter ATP-binding protein  55.67 
 
 		 503 aa  508  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.597291 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4909  ABC transporter related  54.64 
 
 		 505 aa  503  1e-141  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.368986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2119  ABC transporter related  52.17 
 
 		 504 aa  499  1e-140  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.307687  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2128  putative ABC transporter ATP-binding protein  53.88 
 
 		 516 aa  492  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01030  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  50.3 
 
 		 522 aa  489  1e-137  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3040  ABC transporter related protein  50.98 
 
 		 529 aa  483  1e-135  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2148  ABC transporter related  50.2 
 
 		 499 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.123365  normal  0.259949 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2058  ABC transporter related  50 
 
 		 499 aa  480  1e-134  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1854  ABC transporter related  52.85 
 
 		 505 aa  479  1e-134  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.99038  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1987  ABC transporter related  50 
 
 		 500 aa  477  1e-133  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.063033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1987  ABC transporter related  50 
 
 		 499 aa  477  1e-133  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.479214  hitchhiker  0.000308121 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2074  ABC transporter related  50 
 
 		 499 aa  476  1e-133  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.144534  hitchhiker  0.0000031172 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5049  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  50.6 
 
 		 512 aa  475  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3534  ABC transporter related  49.8 
 
 		 523 aa  478  1e-133  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.116696 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0969  ABC transporter related  50.31 
 
 		 500 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0046  sugar ABC transporter ATPase  47.18 
 
 		 513 aa  465  9.999999999999999e-131  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0138528  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0420  ABC transporter related protein  52.37 
 
 		 507 aa  464  1e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04097  predicted sugar transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  49.8 
 
 		 500 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04061  hypothetical protein  49.8 
 
 		 500 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0767  putative sugar uptake ABC transporter ATP-binding protein  49.01 
 
 		 501 aa  460  9.999999999999999e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.162932 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4038  ABC transporter related  52.06 
 
 		 506 aa  460  9.999999999999999e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0279  ABC transporter related  49.39 
 
 		 526 aa  460  9.999999999999999e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.60123  normal  0.12609 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3765  ABC transporter related protein  49.59 
 
 		 500 aa  455  1e-127  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3782  ABC transporter related  49.8 
 
 		 500 aa  458  1e-127  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4706  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.8 
 
 		 500 aa  456  1e-127  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.706122  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0983  ABC transporter related  49.29 
 
 		 501 aa  458  1e-127  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4798  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.8 
 
 		 500 aa  455  1e-127  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4228  ABC transporter related protein  51.65 
 
 		 506 aa  455  1e-127  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4482  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.8 
 
 		 500 aa  455  1e-127  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1417  ABC transporter related  51.2 
 
 		 515 aa  451  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.441776  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0413  ABC transporter related  48.88 
 
 		 500 aa  450  1e-125  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4067  ABC transporter related  50.52 
 
 		 496 aa  444  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0148  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  50.31 
 
 		 496 aa  444  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.361964  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0476  putative sugar ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  50.52 
 
 		 496 aa  444  1e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.251819  normal  0.0934917 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0380  ABC transporter related  47.51 
 
 		 544 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4341  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  46.64 
 
 		 544 aa  428  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4767  ABC transporter-related protein  49.7 
 
 		 503 aa  417  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.883977 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2025  ABC transporter related  47.89 
 
 		 519 aa  418  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.770144 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0277  ABC transporter related  47.22 
 
 		 511 aa  410  1e-113  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.277921  normal  0.268674 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01050  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  47.51 
 
 		 526 aa  411  1e-113  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.552248  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  46.19 
 
 		 499 aa  405  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  42.69 
 
 		 504 aa  401  9.999999999999999e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2370  ABC sugar transporter, ATPase subunit  46.59 
 
 		 518 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  40.81 
 
 		 496 aa  398  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0211  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  43.8 
 
 		 517 aa  393  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40873  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1063  ABC transporter related  43.68 
 
 		 517 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627623  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4739  ABC transporter related  43.92 
 
 		 497 aa  392  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.383875  hitchhiker  0.00325994 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1543  ABC transporter related  43.68 
 
 		 517 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0849155  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1519  ABC transporter related  43.68 
 
 		 517 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0747025  normal  0.022294 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4683  ABC sugar transporter, ATPase subunit  43.68 
 
 		 517 aa  391  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.532161  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1465  ABC transporter related  43.28 
 
 		 517 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.748698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  42.18 
 
 		 512 aa  389  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3310  ABC transporter related  43.8 
 
 		 505 aa  389  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156818  hitchhiker  0.00192862 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1425  ABC transporter related  43.48 
 
 		 517 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  38.54 
 
 		 504 aa  389  1e-107  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  40.53 
 
 		 501 aa  390  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1711  ABC transporter related  43.46 
 
 		 517 aa  389  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0318504 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  40.45 
 
 		 517 aa  387  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  42.23 
 
 		 512 aa  386  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  41.18 
 
 		 497 aa  388  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  40.5 
 
 		 503 aa  387  1e-106  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  42.31 
 
 		 508 aa  385  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1655  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  43 
 
 		 517 aa  385  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1338  ABC transporter related  41.37 
 
 		 515 aa  384  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.224173  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  41.07 
 
 		 514 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  42.4 
 
 		 519 aa  385  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2725  ABC transporter related  42.98 
 
 		 501 aa  384  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0286  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  43 
 
 		 517 aa  385  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0197  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  43 
 
 		 517 aa  385  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0010  D-ribose transporter ATP binding protein  41.38 
 
 		 500 aa  383  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2863  ABC transporter related  40.57 
 
 		 518 aa  382  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.18747  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.89 
 
 		 525 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  40.59 
 
 		 512 aa  382  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  41.3 
 
 		 501 aa  380  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  42.86 
 
 		 495 aa  381  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  40.63 
 
 		 501 aa  380  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  41.65 
 
 		 513 aa  381  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  40.59 
 
 		 512 aa  382  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  40.28 
 
 		 506 aa  378  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  41.04 
 
 		 513 aa  378  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0289  ABC transporter related  42.02 
 
 		 506 aa  378  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  40.76 
 
 		 495 aa  375  1e-103  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6710  ABC transporter, ATP binding subunit (putative high-affinity D-ribose transport)  42.06 
 
 		 507 aa  376  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11533  normal  0.0914748 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5684  ABC transporter related  41.74 
 
 		 509 aa  374  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.878529 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>