More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2401 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3851  ABC transporter related protein  68.74 
 
 
521 aa  637    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3726  ABC transporter related  74.9 
 
 
522 aa  696    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136325  hitchhiker  0.00703863 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10500  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  77.51 
 
 
499 aa  713    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2401  ABC transporter related protein  100 
 
 
505 aa  982    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1351  ABC transporter related  70.24 
 
 
508 aa  649    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.387252 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8259  ABC transporter-related protein  65.53 
 
 
509 aa  605  9.999999999999999e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.332477  decreased coverage  0.00989255 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2884  ABC transporter-like protein  65.46 
 
 
502 aa  588  1e-167  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.913699 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11040  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  62.93 
 
 
500 aa  572  1.0000000000000001e-162  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  49.6 
 
 
499 aa  433  1e-120  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  49.08 
 
 
508 aa  425  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3129  ABC transporter related  45.95 
 
 
504 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149382  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  43.38 
 
 
506 aa  417  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  46.54 
 
 
517 aa  412  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  45.4 
 
 
512 aa  412  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  45.05 
 
 
512 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  45.05 
 
 
514 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  44.29 
 
 
507 aa  409  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  44.29 
 
 
507 aa  410  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  45.05 
 
 
512 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  44.29 
 
 
507 aa  409  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4658  ABC transporter related  46.25 
 
 
497 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  41.63 
 
 
495 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0289  ABC transporter related  44.4 
 
 
506 aa  407  1.0000000000000001e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  45.07 
 
 
512 aa  404  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  44.84 
 
 
497 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2474  ABC transporter related  46.88 
 
 
513 aa  400  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0599981  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  44.76 
 
 
513 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  43.18 
 
 
506 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09550  ABC transporter related  42.13 
 
 
500 aa  398  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.58805  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  42.83 
 
 
508 aa  398  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  44.56 
 
 
513 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01050  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  47.67 
 
 
540 aa  392  1e-108  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0211  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  46.93 
 
 
517 aa  394  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40873  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1601  ABC transporter related  40 
 
 
525 aa  394  1e-108  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0832  ABC transporter related  41.84 
 
 
520 aa  394  1e-108  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  43.24 
 
 
510 aa  392  1e-108  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.24 
 
 
501 aa  391  1e-107  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  39.36 
 
 
501 aa  392  1e-107  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  46.09 
 
 
514 aa  392  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4850  ABC transporter related  45.51 
 
 
503 aa  389  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616228  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0809  ABC transporter related  42.06 
 
 
509 aa  392  1e-107  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  40.82 
 
 
499 aa  388  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4656  ABC transporter related protein  47.21 
 
 
506 aa  387  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00479751 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1655  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  47.11 
 
 
517 aa  388  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  44.69 
 
 
495 aa  387  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  45.4 
 
 
508 aa  387  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3569  ABC transporter related  42.95 
 
 
516 aa  385  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.585388  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  40.82 
 
 
499 aa  388  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6711  ABC transporter related  42.71 
 
 
511 aa  386  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0286  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  47.11 
 
 
517 aa  388  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0197  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  47.11 
 
 
517 aa  388  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5810  ABC transporter related  42.29 
 
 
511 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.644683  normal  0.0896237 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1519  ABC transporter related  45.24 
 
 
517 aa  385  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0747025  normal  0.022294 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6710  ABC transporter, ATP binding subunit (putative high-affinity D-ribose transport)  45.07 
 
 
507 aa  382  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11533  normal  0.0914748 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3235  ABC transporter related  42.23 
 
 
506 aa  382  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.365394  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1986  ABC transporter related  39.1 
 
 
501 aa  383  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.437257  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2595  ABC transporter related  42.44 
 
 
537 aa  382  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.870253  normal  0.943264 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  41.82 
 
 
504 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1063  ABC transporter related  45.24 
 
 
517 aa  385  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627623  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  39.67 
 
 
494 aa  382  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000081797  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0839  ABC transporter related  41.58 
 
 
515 aa  383  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500489  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  40.85 
 
 
503 aa  384  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  39.34 
 
 
494 aa  383  1e-105  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1543  ABC transporter related  45.24 
 
 
517 aa  385  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0849155  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  40.45 
 
 
495 aa  384  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3596  ABC transporter related  43.24 
 
 
509 aa  382  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.979323  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7365  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  40.95 
 
 
506 aa  379  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.568459  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2586  L-arabinose transporter ATP-binding protein  45.67 
 
 
511 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2246  L-arabinose transporter ATP-binding protein  43.86 
 
 
511 aa  380  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000548441 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4267  ABC transporter related  41.3 
 
 
513 aa  379  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844031  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  41.27 
 
 
525 aa  381  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6267  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.02 
 
 
511 aa  379  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1653  ABC transporter related  45.64 
 
 
519 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0555167  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2996  L-arabinose transporter ATP-binding protein  45.47 
 
 
511 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.519724  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2458  ABC transporter-related protein  45.81 
 
 
498 aa  381  1e-104  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1667  ABC transporter related  41.21 
 
 
502 aa  380  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.338027  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2808  ABC transporter related  42.11 
 
 
501 aa  379  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3104  ABC transporter related protein  44.3 
 
 
511 aa  380  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1683  ABC transporter related  41.56 
 
 
503 aa  379  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305806  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1859  ABC transporter related  37.7 
 
 
499 aa  381  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345151 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0989  ABC transporter related  38.78 
 
 
499 aa  379  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86187  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.56 
 
 
494 aa  375  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  46.96 
 
 
504 aa  378  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1911  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42 
 
 
506 aa  378  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389706  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1465  ABC transporter related  44.64 
 
 
517 aa  378  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.748698  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0343  ABC transporter related  43.25 
 
 
497 aa  378  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2122  ABC transporter related  42.02 
 
 
511 aa  377  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4608  ABC transporter related  42.05 
 
 
519 aa  375  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0501  ABC transporter related  41.81 
 
 
511 aa  376  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00548503 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  46.18 
 
 
519 aa  378  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  42.3 
 
 
520 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1425  ABC transporter related  44.44 
 
 
517 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0580  ABC transporter related  37.88 
 
 
508 aa  376  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.677056  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4589  L-arabinose transporter ATP-binding protein  44.35 
 
 
515 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00173683 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  38.79 
 
 
503 aa  379  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4639  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.56 
 
 
494 aa  377  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.202571  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2808  ABC transporter ATP-binding protein  40.71 
 
 
510 aa  376  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2475  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.4 
 
 
504 aa  376  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.74587  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1338  ABC transporter, ATP-binding protein  41.63 
 
 
497 aa  377  1e-103  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.375231 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  42.54 
 
 
517 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>