More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_10500 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1351  ABC transporter related  69.74 
 
 		 508 aa  641    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.387252 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2401  ABC transporter related protein  77.51 
 
 		 505 aa  729    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3726  ABC transporter related  76.1 
 
 		 522 aa  714    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136325  hitchhiker  0.00703863 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10500  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 499 aa  974    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3851  ABC transporter related protein  66.73 
 
 		 521 aa  622  1e-177  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8259  ABC transporter-related protein  62.98 
 
 		 509 aa  584  1.0000000000000001e-165  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.332477  decreased coverage  0.00989255 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2884  ABC transporter-like protein  63.13 
 
 		 502 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.913699 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11040  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  61.11 
 
 		 500 aa  563  1.0000000000000001e-159  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  47.29 
 
 		 499 aa  413  1e-114  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  43.99 
 
 		 497 aa  404  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  48.17 
 
 		 508 aa  399  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  45.01 
 
 		 495 aa  399  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  41.14 
 
 		 495 aa  397  1e-109  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  41.3 
 
 		 494 aa  392  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  44.21 
 
 		 517 aa  390  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09550  ABC transporter related  42.44 
 
 		 500 aa  385  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.58805  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  43.04 
 
 		 510 aa  388  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  44.42 
 
 		 520 aa  387  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  45.05 
 
 		 515 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01050  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  47.98 
 
 		 540 aa  387  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1601  ABC transporter related  40.12 
 
 		 525 aa  386  1e-106  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  41.54 
 
 		 503 aa  385  1e-105  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  44.86 
 
 		 517 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  46.49 
 
 		 504 aa  384  1e-105  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4656  ABC transporter related protein  46.95 
 
 		 506 aa  382  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479751 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0580  ABC transporter related  39.66 
 
 		 508 aa  380  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.677056  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  47.93 
 
 		 519 aa  379  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  45.71 
 
 		 505 aa  376  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2823  ABC transporter related  41.23 
 
 		 511 aa  377  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  43.37 
 
 		 523 aa  377  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7809  ABC transporter related  41.65 
 
 		 512 aa  378  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2595  ABC transporter related  42.77 
 
 		 537 aa  378  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.870253  normal  0.943264 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2492  ABC transporter related protein  37.01 
 
 		 498 aa  376  1e-103  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2089  ABC transporter related protein  46.25 
 
 		 504 aa  376  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.558184  normal  0.156772 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.9 
 
 		 507 aa  375  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1338  ABC transporter, ATP-binding protein  42.74 
 
 		 497 aa  378  1e-103  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.375231 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  42.19 
 
 		 506 aa  375  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0343  ABC transporter related  42.94 
 
 		 497 aa  374  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  43.83 
 
 		 512 aa  372  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.53 
 
 		 525 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3855  ABC transporter related  41.89 
 
 		 513 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  42.77 
 
 		 507 aa  374  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  44.3 
 
 		 516 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3129  ABC transporter related  41.99 
 
 		 504 aa  372  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149382  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4768  ABC transporter related  43.67 
 
 		 503 aa  372  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957059  normal  0.347139 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4658  ABC transporter related  43.74 
 
 		 497 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4183  ABC transporter related  42.11 
 
 		 513 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3235  ABC transporter related  40.96 
 
 		 506 aa  374  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.365394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4850  ABC transporter related  44.05 
 
 		 503 aa  373  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3207  L-arabinose transporter ATP-binding protein  45.57 
 
 		 515 aa  374  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0870889 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2808  ABC transporter ATP-binding protein  40.12 
 
 		 510 aa  373  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  42.62 
 
 		 516 aa  373  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2686  ABC transporter related  47.6 
 
 		 505 aa  372  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  46.22 
 
 		 508 aa  374  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1986  ABC transporter related  38.78 
 
 		 501 aa  372  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.437257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3569  ABC transporter related  40.8 
 
 		 516 aa  374  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.585388  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0289  ABC transporter related  42.19 
 
 		 506 aa  375  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  42.77 
 
 		 507 aa  371  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  42.71 
 
 		 508 aa  369  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  41.44 
 
 		 527 aa  371  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2458  ABC transporter-related protein  44.72 
 
 		 498 aa  370  1e-101  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2586  L-arabinose transporter ATP-binding protein  43.52 
 
 		 511 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  38.49 
 
 		 504 aa  369  1e-101  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  37.85 
 
 		 501 aa  369  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2996  L-arabinose transporter ATP-binding protein  43.49 
 
 		 511 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.519724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  41.86 
 
 		 524 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3699  ABC transporter related protein  44.75 
 
 		 510 aa  371  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92688  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2904  ABC transporter related  41.01 
 
 		 503 aa  370  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  41.09 
 
 		 506 aa  369  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0832  ABC transporter related  40.37 
 
 		 520 aa  369  1e-101  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3596  ABC transporter related  43.07 
 
 		 509 aa  372  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.979323  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3784  ABC transporter related  42.57 
 
 		 506 aa  371  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.915652  hitchhiker  0.00808443 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0881  ABC transporter related protein  46.32 
 
 		 499 aa  371  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.873937  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1612  ABC transporter related  40.56 
 
 		 496 aa  366  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  41.65 
 
 		 524 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  42.89 
 
 		 514 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0711  ABC transporter related  44.58 
 
 		 495 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0109933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0809  ABC transporter related  40.37 
 
 		 509 aa  368  1e-100  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3041  ABC transporter related  46.09 
 
 		 500 aa  369  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3104  ABC transporter related protein  40.82 
 
 		 511 aa  369  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0046  L-arabinose transporter ATP-binding protein  44.63 
 
 		 522 aa  368  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.54995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  43.03 
 
 		 512 aa  366  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1760  ribose ABC transporter ATP-binding protein  40.56 
 
 		 496 aa  365  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.185473  hitchhiker  0.0000761209 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0211  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  45.85 
 
 		 517 aa  368  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40873  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6711  ABC transporter related  40.84 
 
 		 511 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1035  ABC sugar transporter, ATPase subunit  44.12 
 
 		 516 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.474314  normal  0.672241 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5684  ABC transporter related  43.7 
 
 		 509 aa  368  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.878529 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5219  L-arabinose transporter ATP-binding protein  44.63 
 
 		 515 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1508  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.56 
 
 		 496 aa  366  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.106354  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  37.65 
 
 		 501 aa  368  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  39.96 
 
 		 495 aa  368  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  39.19 
 
 		 494 aa  368  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000081797  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  39.09 
 
 		 501 aa  366  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4608  ABC transporter related  41.55 
 
 		 519 aa  366  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4589  L-arabinose transporter ATP-binding protein  44.63 
 
 		 515 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173683 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1711  ABC transporter related  44.64 
 
 		 517 aa  369  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0318504 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5640  L-arabinose transporter ATP-binding protein  44.63 
 
 		 515 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.273168  normal  0.0496803 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1683  ABC transporter related  41.68 
 
 		 503 aa  366  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305806  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  42.68 
 
 		 512 aa  365  1e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3766  ABC transporter related  40.93 
 
 		 492 aa  365  1e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0098796  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>