More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1351 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3726  ABC transporter related  71.74 
 
 
522 aa  656    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136325  hitchhiker  0.00703863 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2401  ABC transporter related protein  70.24 
 
 
505 aa  649    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1351  ABC transporter related  100 
 
 
508 aa  988    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.387252 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10500  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  69.74 
 
 
499 aa  632  1e-180  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3851  ABC transporter related protein  63.37 
 
 
521 aa  587  1e-166  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2884  ABC transporter-like protein  61.68 
 
 
502 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.913699 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8259  ABC transporter-related protein  58.97 
 
 
509 aa  533  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.332477  decreased coverage  0.00989255 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11040  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  58.76 
 
 
500 aa  526  1e-148  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  47.07 
 
 
508 aa  407  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  46.15 
 
 
499 aa  390  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  40.49 
 
 
495 aa  384  1e-105  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  41.68 
 
 
497 aa  381  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  42.51 
 
 
515 aa  378  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  46.56 
 
 
508 aa  377  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  42.14 
 
 
517 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0832  ABC transporter related  39.75 
 
 
520 aa  374  1e-102  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4658  ABC transporter related  44.2 
 
 
497 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0809  ABC transporter related  39.79 
 
 
509 aa  373  1e-102  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  41.77 
 
 
507 aa  365  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  44.88 
 
 
504 aa  367  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  42.38 
 
 
520 aa  366  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2122  ABC transporter related  39.8 
 
 
511 aa  367  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  41.77 
 
 
507 aa  366  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1601  ABC transporter related  40 
 
 
525 aa  367  1e-100  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2787  ABC transporter for sugar (aldose) ATP-binding protein  39.87 
 
 
495 aa  367  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0149064  normal  0.48477 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09550  ABC transporter related  41.34 
 
 
500 aa  365  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.58805  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.77 
 
 
507 aa  365  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  41.6 
 
 
512 aa  363  4e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0613  ABC transporter related  38.09 
 
 
497 aa  363  5.0000000000000005e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  40.75 
 
 
495 aa  363  5.0000000000000005e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1338  ABC transporter, ATP-binding protein  40.16 
 
 
497 aa  362  6e-99  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.375231 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  44.07 
 
 
514 aa  362  8e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  41.3 
 
 
506 aa  362  1e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  38.76 
 
 
499 aa  361  2e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  38.76 
 
 
499 aa  361  2e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7365  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  40.84 
 
 
506 aa  361  2e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.568459  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  41.7 
 
 
495 aa  360  2e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  43.1 
 
 
516 aa  361  2e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01050  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  44.69 
 
 
540 aa  360  3e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  41.21 
 
 
517 aa  359  5e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0289  ABC transporter related  41.7 
 
 
506 aa  359  5e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4608  ABC transporter related  41.68 
 
 
519 aa  359  6e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  42.41 
 
 
514 aa  359  7e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3129  ABC transporter related  40.92 
 
 
504 aa  359  7e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149382  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1859  ABC transporter related  36.79 
 
 
499 aa  359  7e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345151 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  39.47 
 
 
506 aa  359  8e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2808  ABC transporter related  40.85 
 
 
501 aa  358  9.999999999999999e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  39.34 
 
 
503 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  39.36 
 
 
494 aa  357  2.9999999999999997e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  42.2 
 
 
514 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  42.2 
 
 
514 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  40.79 
 
 
510 aa  356  3.9999999999999996e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3766  ABC transporter related  40.34 
 
 
492 aa  356  6.999999999999999e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0098796  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  40.6 
 
 
512 aa  356  6.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  38.67 
 
 
501 aa  355  6.999999999999999e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  40.6 
 
 
512 aa  356  6.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  38.26 
 
 
494 aa  355  1e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  40.6 
 
 
513 aa  354  2e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  40.6 
 
 
514 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3418  ABC transporter related  42.35 
 
 
526 aa  354  2.9999999999999997e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.247847  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  40.4 
 
 
513 aa  353  5.9999999999999994e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0274  ABC transporter related protein  35.54 
 
 
498 aa  352  7e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6711  ABC transporter related  39.79 
 
 
511 aa  352  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2595  ABC transporter related  41.41 
 
 
537 aa  352  1e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.870253  normal  0.943264 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4850  ABC transporter related  42.62 
 
 
503 aa  351  1e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616228  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0813  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  39.2 
 
 
499 aa  351  2e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0813  ABC transporter related  39.2 
 
 
499 aa  351  2e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  39.24 
 
 
495 aa  351  2e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2266  ABC transporter related  36.53 
 
 
499 aa  351  2e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000122283  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4768  ABC transporter related  43.19 
 
 
503 aa  350  3e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957059  normal  0.347139 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  40.8 
 
 
512 aa  350  3e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  40.99 
 
 
513 aa  350  3e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4133  ABC transporter related  40.24 
 
 
502 aa  350  4e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3596  ABC transporter related  41.18 
 
 
509 aa  350  4e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.979323  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2058  ABC transporter related  37.35 
 
 
499 aa  350  4e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5597  ABC transporter related  39.96 
 
 
503 aa  350  5e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.609428  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  42.2 
 
 
507 aa  349  6e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  43.29 
 
 
505 aa  349  7e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6267  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  39.83 
 
 
511 aa  349  7e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2474  ABC transporter related  41.42 
 
 
513 aa  349  7e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0599981  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1986  ABC transporter related  37.65 
 
 
501 aa  349  8e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.437257  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3699  ABC transporter related protein  42.15 
 
 
510 aa  348  1e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92688  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3104  ABC transporter related protein  41.72 
 
 
511 aa  348  1e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3706  ABC transporter related  41.07 
 
 
506 aa  348  1e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.594267  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4183  ABC transporter related  40.37 
 
 
513 aa  348  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  37.21 
 
 
504 aa  348  2e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0157  sugar ABC transporter ATP-binding protein  39 
 
 
499 aa  348  2e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000963677 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2074  ABC transporter related  37.75 
 
 
499 aa  347  2e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.144534  hitchhiker  0.0000031172 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2447  ABC transporter related protein  37.37 
 
 
495 aa  348  2e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000548266  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1049  ABC transporter related protein  40.45 
 
 
496 aa  347  2e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  37.27 
 
 
501 aa  347  3e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2010  ABC transporter related  36.7 
 
 
500 aa  347  3e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1667  ABC transporter related  41.36 
 
 
502 aa  347  4e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.338027  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1987  ABC transporter related  37.55 
 
 
500 aa  347  4e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.063033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1987  ABC transporter related  37.55 
 
 
499 aa  347  4e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.479214  hitchhiker  0.000308121 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0226  ABC transporter related  40.79 
 
 
503 aa  347  4e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.973654  normal  0.104566 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0046  sugar ABC transporter ATPase  37.79 
 
 
513 aa  346  5e-94  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0138528  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0279  ABC transporter related  39.96 
 
 
526 aa  346  6e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.60123  normal  0.12609 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5810  ABC transporter related  38.96 
 
 
511 aa  346  7e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.644683  normal  0.0896237 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4739  ABC transporter related  40.97 
 
 
497 aa  346  7e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.383875  hitchhiker  0.00325994 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>