More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0274 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_0274  ABC transporter related protein  100 
 
 
498 aa  1004    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  46.99 
 
 
501 aa  454  1.0000000000000001e-126  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  43.29 
 
 
513 aa  437  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  41.41 
 
 
514 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  46.33 
 
 
494 aa  435  1e-121  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  41.41 
 
 
514 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  41.67 
 
 
514 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4010  ABC transporter related protein  44.62 
 
 
500 aa  431  1e-119  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  43.41 
 
 
504 aa  431  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  44.15 
 
 
495 aa  429  1e-119  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2010  ABC transporter related  44.83 
 
 
500 aa  429  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1667  ABC transporter related  46 
 
 
502 aa  427  1e-118  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.338027  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  41.09 
 
 
508 aa  426  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5597  ABC transporter related  44.11 
 
 
503 aa  428  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.609428  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  43.09 
 
 
503 aa  426  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  40.97 
 
 
514 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  42.28 
 
 
515 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  40.57 
 
 
512 aa  422  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1049  ABC transporter related protein  42.37 
 
 
496 aa  425  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2246  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.16 
 
 
511 aa  422  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000548441 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2148  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.91 
 
 
507 aa  422  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  42.41 
 
 
504 aa  424  1e-117  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3166  ABC transporter related  43.63 
 
 
500 aa  424  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  41.26 
 
 
516 aa  419  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  41.9 
 
 
508 aa  419  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2330  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.31 
 
 
507 aa  420  1e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1911  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.71 
 
 
506 aa  421  1e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389706  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2021  xylose transporter ATP-binding subunit  43 
 
 
504 aa  419  1e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  40.97 
 
 
512 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  42.11 
 
 
517 aa  421  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  41.06 
 
 
513 aa  420  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  40.97 
 
 
513 aa  421  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  40.97 
 
 
512 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  42.6 
 
 
495 aa  420  1e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  39.72 
 
 
507 aa  419  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0809  ABC transporter related  43.34 
 
 
509 aa  418  9.999999999999999e-116  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2262  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.75 
 
 
523 aa  415  9.999999999999999e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2372  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.36 
 
 
507 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179136  normal  0.245048 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  43.5 
 
 
494 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000081797  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  41.45 
 
 
517 aa  418  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2030  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.11 
 
 
507 aa  417  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.288148  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  39.8 
 
 
497 aa  416  9.999999999999999e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1998  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.75 
 
 
523 aa  416  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  40.2 
 
 
523 aa  416  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0832  ABC transporter related  43.14 
 
 
520 aa  415  9.999999999999999e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  40.57 
 
 
512 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  44.18 
 
 
503 aa  418  9.999999999999999e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  42.57 
 
 
497 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1683  ABC transporter related  41.96 
 
 
503 aa  415  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305806  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1884  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.75 
 
 
523 aa  416  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.326668  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  41.14 
 
 
520 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  42.97 
 
 
514 aa  414  1e-114  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  43.12 
 
 
494 aa  414  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0106  xylose transporter ATP-binding subunit  41.11 
 
 
505 aa  412  1e-114  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  40.64 
 
 
524 aa  412  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1549  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  43.2 
 
 
515 aa  412  1e-114  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.178403  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3207  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.96 
 
 
515 aa  412  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0870889 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0157  ABC transporter related  42.41 
 
 
507 aa  412  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2475  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.22 
 
 
504 aa  415  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.74587  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7365  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  39.76 
 
 
506 aa  414  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.568459  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1134  ABC transporter related  41.77 
 
 
506 aa  413  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000497905  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  42.8 
 
 
501 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  41.33 
 
 
499 aa  409  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0580  ABC transporter related  41.7 
 
 
508 aa  410  1e-113  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.677056  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7809  ABC transporter related  40.89 
 
 
512 aa  411  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0116  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.89 
 
 
492 aa  410  1e-113  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  39.84 
 
 
525 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  41.33 
 
 
499 aa  409  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2725  ABC transporter related  38.74 
 
 
501 aa  409  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0613  ABC transporter related  42.17 
 
 
497 aa  409  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3129  ABC transporter related  41.38 
 
 
504 aa  410  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149382  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4183  ABC transporter related  40.94 
 
 
513 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  43.81 
 
 
504 aa  408  1e-113  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  45.18 
 
 
501 aa  410  1e-113  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1342  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  43.2 
 
 
515 aa  411  1e-113  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.172168  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  45.18 
 
 
501 aa  409  1e-113  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2808  ABC transporter related  41.34 
 
 
501 aa  409  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2474  ABC transporter related  39.88 
 
 
513 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0599981  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4768  ABC transporter related  42.02 
 
 
503 aa  408  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957059  normal  0.347139 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2485  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.85 
 
 
503 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3855  ABC transporter related  40.73 
 
 
513 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  40.49 
 
 
524 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1627  L-arabinose transporter ATP-binding protein  39.68 
 
 
525 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1180  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.89 
 
 
503 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2595  ABC transporter related  40.85 
 
 
537 aa  407  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.870253  normal  0.943264 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  39.03 
 
 
499 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  39.96 
 
 
495 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  43.64 
 
 
496 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0341  D-ribose transporter ATP binding protein  43.55 
 
 
501 aa  408  1.0000000000000001e-112  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3310  ABC transporter related  39.15 
 
 
505 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156818  hitchhiker  0.00192862 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0405  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.85 
 
 
503 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.582822  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1265  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.85 
 
 
503 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0391  ABC transporter related protein  42.34 
 
 
499 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.302991  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3300  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.85 
 
 
503 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3601  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.04 
 
 
508 aa  402  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611963  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5684  ABC transporter related  40.33 
 
 
509 aa  405  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.878529 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2639  L-arabinose ABC transporter, ATP-binding protein  41.55 
 
 
507 aa  404  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0558785  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3483  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.85 
 
 
503 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4140  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.87 
 
 
514 aa  402  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5219  L-arabinose transporter ATP-binding protein  39.96 
 
 
515 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>