More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4739 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4739  ABC transporter related  100 
 
 		 497 aa  991    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.383875  hitchhiker  0.00325994 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2025  ABC transporter related  59.51 
 
 		 519 aa  546  1e-154  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.770144 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0380  ABC transporter related  55.65 
 
 		 544 aa  542  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4341  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  55.85 
 
 		 544 aa  543  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4365  ABC transporter related  49.33 
 
 		 585 aa  473  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.309192  normal  0.0851247 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1987  ABC transporter related  45.45 
 
 		 500 aa  442  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.063033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1987  ABC transporter related  45.45 
 
 		 499 aa  442  1e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.479214  hitchhiker  0.000308121 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2148  ABC transporter related  44.96 
 
 		 499 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.123365  normal  0.259949 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2074  ABC transporter related  45.45 
 
 		 499 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.144534  hitchhiker  0.0000031172 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2058  ABC transporter related  44.85 
 
 		 499 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04097  predicted sugar transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  46.34 
 
 		 500 aa  436  1e-121  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3765  ABC transporter related protein  46.34 
 
 		 500 aa  435  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0983  ABC transporter related  46.87 
 
 		 501 aa  438  1e-121  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0969  ABC transporter related  47.17 
 
 		 500 aa  437  1e-121  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2128  putative ABC transporter ATP-binding protein  47.69 
 
 		 516 aa  437  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04061  hypothetical protein  46.34 
 
 		 500 aa  436  1e-121  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1721  ABC transporter related  46.69 
 
 		 507 aa  434  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0492105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4067  ABC transporter related  46.98 
 
 		 496 aa  432  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4482  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.34 
 
 		 500 aa  432  1e-120  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4798  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.34 
 
 		 500 aa  432  1e-120  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3782  ABC transporter related  46.34 
 
 		 500 aa  435  1e-120  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0476  putative sugar ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  46.98 
 
 		 496 aa  432  1e-120  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.251819  normal  0.0934917 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1224  ABC transporter related  43.86 
 
 		 510 aa  434  1e-120  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0148  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  47.18 
 
 		 496 aa  432  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.361964  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4706  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.14 
 
 		 500 aa  430  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.706122  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1905  ABC transporter related  46.69 
 
 		 507 aa  430  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308353  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0413  ABC transporter related  46.14 
 
 		 500 aa  430  1e-119  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6222  sugar ABC transporter ATP-binding protein  48 
 
 		 503 aa  426  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.597291 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5049  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  45.07 
 
 		 512 aa  425  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2119  ABC transporter related  46.97 
 
 		 504 aa  424  1e-117  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.307687  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0767  putative sugar uptake ABC transporter ATP-binding protein  45.03 
 
 		 501 aa  420  1e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.162932 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4909  ABC transporter related  46.25 
 
 		 505 aa  418  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.368986  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4038  ABC transporter related  45.14 
 
 		 506 aa  421  1e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  44.85 
 
 		 497 aa  416  9.999999999999999e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4096  ABC transporter related  47.07 
 
 		 525 aa  413  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4228  ABC transporter related protein  44.53 
 
 		 506 aa  413  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4208  ABC transporter related  47.07 
 
 		 525 aa  413  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.577364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  42.8 
 
 		 497 aa  409  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4767  ABC transporter-related protein  46.88 
 
 		 503 aa  410  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.883977 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1854  ABC transporter related  49.23 
 
 		 505 aa  410  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.99038  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2370  ABC sugar transporter, ATPase subunit  44.62 
 
 		 518 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3534  ABC transporter related  42.68 
 
 		 523 aa  399  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.116696 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  43.92 
 
 		 495 aa  402  9.999999999999999e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  43.09 
 
 		 495 aa  398  1e-109  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1417  ABC transporter related  45.86 
 
 		 515 aa  393  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.441776  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1048  ABC transporter related  43.92 
 
 		 506 aa  392  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4174  D-ribose transporter ATP binding protein  43.81 
 
 		 501 aa  393  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283711  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2251  ABC transporter-related protein  44.2 
 
 		 511 aa  394  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.687423  hitchhiker  0.00000468234 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2863  ABC transporter related  45.88 
 
 		 518 aa  392  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.18747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2524  ABC transporter related  42.83 
 
 		 505 aa  392  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  44.51 
 
 		 504 aa  392  1e-108  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0279  ABC transporter related  44.17 
 
 		 526 aa  395  1e-108  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.60123  normal  0.12609 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2010  ABC transporter related  40.49 
 
 		 500 aa  395  1e-108  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5597  ABC transporter related  45.15 
 
 		 503 aa  389  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.609428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  46.82 
 
 		 499 aa  391  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  44.79 
 
 		 495 aa  389  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  42.48 
 
 		 501 aa  391  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  42.39 
 
 		 501 aa  389  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0420  ABC transporter related protein  45.38 
 
 		 507 aa  389  1e-107  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  44.94 
 
 		 512 aa  390  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  41.62 
 
 		 494 aa  390  1e-107  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2215  ABC transporter related  45.11 
 
 		 509 aa  389  1e-107  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0215537  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2238  ABC transporter related  45.32 
 
 		 504 aa  389  1e-107  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5925  ABC transporter related  44.58 
 
 		 504 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.737944  normal  0.893001 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0613  ABC transporter related  42.71 
 
 		 497 aa  386  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5626  ABC transporter related  44.76 
 
 		 504 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000841006  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1667  ABC transporter related  43.95 
 
 		 502 aa  385  1e-106  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.338027  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6194  ABC transporter related  44.78 
 
 		 504 aa  386  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1915  ABC transporter related  41.86 
 
 		 502 aa  387  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.483253  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6482  ABC transporter related  44.76 
 
 		 504 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.611957  normal  0.251961 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5991  ABC transporter related  44.76 
 
 		 504 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122815  normal  0.14883 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  42.48 
 
 		 507 aa  386  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  40.94 
 
 		 504 aa  382  1e-105  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  44.51 
 
 		 512 aa  382  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  43.33 
 
 		 508 aa  383  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  45.36 
 
 		 504 aa  384  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  44.72 
 
 		 519 aa  383  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3040  ABC transporter related protein  44.26 
 
 		 529 aa  384  1e-105  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3166  ABC transporter related  41.01 
 
 		 500 aa  383  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0809  ABC transporter related  42.97 
 
 		 509 aa  382  1e-105  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03635  fused D-ribose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  41.38 
 
 		 501 aa  379  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.483932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4218  ABC transporter related protein  41.38 
 
 		 501 aa  380  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4109  D-ribose transporter ATP binding protein  41.67 
 
 		 516 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114584  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  42.35 
 
 		 517 aa  380  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  43.88 
 
 		 503 aa  380  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2122  ABC transporter related  41.57 
 
 		 511 aa  381  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  39.83 
 
 		 494 aa  380  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000081797  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3965  D-ribose transporter ATP binding protein  41.38 
 
 		 501 aa  379  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4274  D-ribose transporter ATP binding protein  41.67 
 
 		 516 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4117  D-ribose transporter ATP binding protein  41.38 
 
 		 501 aa  380  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159229 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  44.13 
 
 		 516 aa  380  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4165  D-ribose transporter ATP binding protein  41.67 
 
 		 501 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.846402  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1338  ABC transporter related  41.55 
 
 		 515 aa  380  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.224173  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  40.53 
 
 		 496 aa  382  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  40.12 
 
 		 492 aa  380  1e-104  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  41.92 
 
 		 524 aa  382  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4215  D-ribose transporter ATP binding protein  41.67 
 
 		 516 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.777457 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  43.88 
 
 		 514 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3766  ABC transporter related  39.47 
 
 		 492 aa  379  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0098796  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03580  hypothetical protein  41.38 
 
 		 501 aa  379  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550483  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>