More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4133 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4133  ABC transporter related  100 
 
 		 502 aa  1011    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  50.31 
 
 		 499 aa  463  1e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09550  ABC transporter related  48.77 
 
 		 500 aa  464  1e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.58805  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  49.29 
 
 		 512 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  46.03 
 
 		 501 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  48.79 
 
 		 512 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  47.99 
 
 		 513 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  48.79 
 
 		 512 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  48.48 
 
 		 512 aa  444  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  48.22 
 
 		 514 aa  443  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  48.16 
 
 		 513 aa  442  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3129  ABC transporter related  46.15 
 
 		 504 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149382  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  46.75 
 
 		 506 aa  433  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  48.08 
 
 		 495 aa  434  1e-120  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  45.51 
 
 		 494 aa  432  1e-120  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  46.28 
 
 		 508 aa  430  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  45.75 
 
 		 503 aa  428  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  47.58 
 
 		 508 aa  425  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  45.62 
 
 		 507 aa  424  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  45.14 
 
 		 517 aa  422  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  45.33 
 
 		 496 aa  423  1e-117  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1911  L-arabinose transporter ATP-binding protein  45.62 
 
 		 506 aa  421  1e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389706  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  45.42 
 
 		 507 aa  420  1e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2030  L-arabinose transporter ATP-binding protein  45.31 
 
 		 507 aa  421  1e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.288148  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2330  L-arabinose transporter ATP-binding protein  45.51 
 
 		 507 aa  421  1e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  45.42 
 
 		 507 aa  419  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  44.6 
 
 		 516 aa  419  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  45.66 
 
 		 495 aa  420  1e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5597  ABC transporter related  44.74 
 
 		 503 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.609428  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  48.34 
 
 		 504 aa  417  9.999999999999999e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3855  ABC transporter related  42.17 
 
 		 513 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0613  ABC transporter related  44.02 
 
 		 497 aa  417  9.999999999999999e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  44.85 
 
 		 504 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  46.11 
 
 		 501 aa  418  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0289  ABC transporter related  44.89 
 
 		 506 aa  416  9.999999999999999e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2246  L-arabinose transporter ATP-binding protein  46.61 
 
 		 511 aa  418  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000548441 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  44.79 
 
 		 497 aa  413  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2148  L-arabinose transporter ATP-binding protein  45.4 
 
 		 507 aa  412  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.32 
 
 		 501 aa  412  1e-114  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  42.54 
 
 		 501 aa  412  1e-114  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0637  ABC transporter related  41.92 
 
 		 498 aa  413  1e-114  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.011918  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  44.9 
 
 		 494 aa  413  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0299142 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  44.83 
 
 		 499 aa  409  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4183  ABC transporter related  41.77 
 
 		 513 aa  411  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1667  ABC transporter related  43.64 
 
 		 502 aa  411  1e-113  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.338027  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  44.8 
 
 		 506 aa  410  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1653  ABC transporter related  46.84 
 
 		 519 aa  409  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0555167  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3463  ABC transporter related  46.09 
 
 		 516 aa  409  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.309481 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2021  xylose transporter ATP-binding subunit  44.89 
 
 		 504 aa  410  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  44.83 
 
 		 499 aa  409  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  42.8 
 
 		 495 aa  411  1e-113  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2279  ABC transporter related  45.21 
 
 		 500 aa  409  1e-113  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.488082  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0106  xylose transporter ATP-binding subunit  42.69 
 
 		 505 aa  409  1e-113  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2524  ABC transporter related  44.22 
 
 		 505 aa  411  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5684  ABC transporter related  45.97 
 
 		 509 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.878529 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1465  ABC transporter related  44.98 
 
 		 517 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.748698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3279  ABC transporter related  44.79 
 
 		 505 aa  405  1.0000000000000001e-112  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  44.42 
 
 		 524 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1612  ABC transporter related  44.81 
 
 		 496 aa  406  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1760  ribose ABC transporter ATP-binding protein  44.81 
 
 		 496 aa  406  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.185473  hitchhiker  0.0000761209 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  46.64 
 
 		 514 aa  406  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  44.42 
 
 		 524 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  44.67 
 
 		 520 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  45.32 
 
 		 524 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2475  L-arabinose transporter ATP-binding protein  44.8 
 
 		 504 aa  405  1.0000000000000001e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.74587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  43.23 
 
 		 495 aa  408  1.0000000000000001e-112  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1212  ABC transporter related  45.77 
 
 		 511 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1508  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  44.81 
 
 		 496 aa  406  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.106354  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01868  fused L-arabinose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  45.6 
 
 		 504 aa  404  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.97097  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1743  ABC transporter related protein  45.6 
 
 		 504 aa  404  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.50451  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  45.34 
 
 		 516 aa  402  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2131  L-arabinose transporter ATP-binding protein  45.6 
 
 		 504 aa  404  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00340592  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2636  L-arabinose transporter ATP-binding protein  45.6 
 
 		 504 aa  404  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000458478 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  44.21 
 
 		 527 aa  404  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4608  ABC transporter related  43.35 
 
 		 519 aa  404  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  45.53 
 
 		 513 aa  403  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01857  hypothetical protein  45.6 
 
 		 504 aa  404  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.974378  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1035  ABC sugar transporter, ATPase subunit  45.97 
 
 		 516 aa  402  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.474314  normal  0.672241 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1286  L-arabinose transporter ATP-binding protein  45.6 
 
 		 504 aa  404  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00939133  hitchhiker  0.000000120675 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2122  ABC transporter related  43.29 
 
 		 511 aa  402  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1063  ABC transporter related  45.62 
 
 		 517 aa  405  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627623  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  45.81 
 
 		 514 aa  405  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  45.6 
 
 		 514 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1735  L-arabinose transporter ATP-binding protein  45.6 
 
 		 504 aa  404  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0832  ABC transporter related  43.35 
 
 		 520 aa  403  1e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4267  ABC transporter related  42.37 
 
 		 513 aa  403  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1425  ABC transporter related  44.98 
 
 		 517 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7809  ABC transporter related  42.42 
 
 		 512 aa  404  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1996  L-arabinose transporter ATP-binding protein  45.6 
 
 		 504 aa  404  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00548515  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1543  ABC transporter related  45.62 
 
 		 517 aa  405  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0849155  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  45.81 
 
 		 514 aa  405  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  44.81 
 
 		 524 aa  405  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1519  ABC transporter related  45.42 
 
 		 517 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0747025  normal  0.022294 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1024  L-arabinose transporter ATP-binding protein  45.6 
 
 		 504 aa  404  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  44.44 
 
 		 507 aa  402  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2266  ABC transporter related  43.03 
 
 		 499 aa  403  1e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000122283  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1134  ABC transporter related  44.53 
 
 		 506 aa  404  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000497905  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0809  ABC transporter related  43.35 
 
 		 509 aa  405  1e-111  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  44.21 
 
 		 524 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1998  L-arabinose transporter ATP-binding protein  44.98 
 
 		 523 aa  400  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>