More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3726 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3726  ABC transporter related  100 
 
 		 522 aa  1006    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136325  hitchhiker  0.00703863 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1351  ABC transporter related  71.74 
 
 		 508 aa  656    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.387252 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2401  ABC transporter related protein  74.9 
 
 		 505 aa  696    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3851  ABC transporter related protein  70.34 
 
 		 521 aa  645    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10500  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  76.1 
 
 		 499 aa  700    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11040  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  66.13 
 
 		 500 aa  606  9.999999999999999e-173  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8259  ABC transporter-related protein  65.19 
 
 		 509 aa  596  1e-169  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.332477  decreased coverage  0.00989255 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2884  ABC transporter-like protein  65.53 
 
 		 502 aa  594  1e-168  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.913699 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  50.63 
 
 		 508 aa  425  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  47.7 
 
 		 499 aa  421  1e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  45.21 
 
 		 497 aa  409  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4658  ABC transporter related  45.78 
 
 		 497 aa  399  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  44.72 
 
 		 512 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  44.72 
 
 		 512 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  40.37 
 
 		 495 aa  394  1e-108  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  44.47 
 
 		 510 aa  392  1e-108  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  43.64 
 
 		 523 aa  386  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  44.65 
 
 		 514 aa  388  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0226  ABC transporter related  44.44 
 
 		 503 aa  388  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.973654  normal  0.104566 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  45.82 
 
 		 514 aa  388  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  43.49 
 
 		 512 aa  386  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1859  ABC transporter related  38.57 
 
 		 499 aa  387  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345151 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  44.03 
 
 		 507 aa  385  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3182  ABC transporter related  45.86 
 
 		 518 aa  382  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.868778  normal  0.140125 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  46.88 
 
 		 508 aa  383  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  44.19 
 
 		 512 aa  383  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  43.44 
 
 		 513 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  46.22 
 
 		 495 aa  385  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  43.42 
 
 		 517 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  43.33 
 
 		 515 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  39.45 
 
 		 494 aa  384  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000081797  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3125  ABC transporter related  44.17 
 
 		 495 aa  384  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  43.34 
 
 		 520 aa  382  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3596  ABC transporter related  43.09 
 
 		 509 aa  385  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.979323  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2474  ABC transporter related  46.42 
 
 		 513 aa  383  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0599981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  40.57 
 
 		 494 aa  379  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  46.37 
 
 		 505 aa  379  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  43.41 
 
 		 516 aa  380  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3129  ABC transporter related  43.7 
 
 		 504 aa  381  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149382  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2458  ABC transporter-related protein  48.16 
 
 		 498 aa  380  1e-104  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  37.85 
 
 		 501 aa  381  1e-104  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  43.95 
 
 		 513 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  46.25 
 
 		 504 aa  379  1e-104  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1683  ABC transporter related  42.36 
 
 		 503 aa  380  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305806  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  43.87 
 
 		 508 aa  382  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1049  ABC transporter related protein  44.09 
 
 		 496 aa  382  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2808  ABC transporter related  42.47 
 
 		 501 aa  380  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4589  L-arabinose transporter ATP-binding protein  45.6 
 
 		 515 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173683 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2492  ABC transporter related protein  36.58 
 
 		 498 aa  377  1e-103  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3855  ABC transporter related  41.09 
 
 		 513 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4183  ABC transporter related  41.3 
 
 		 513 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5219  L-arabinose transporter ATP-binding protein  45.4 
 
 		 515 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7809  ABC transporter related  40.32 
 
 		 512 aa  378  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  37.45 
 
 		 501 aa  377  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5640  L-arabinose transporter ATP-binding protein  45.4 
 
 		 515 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.273168  normal  0.0496803 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3207  L-arabinose transporter ATP-binding protein  46.22 
 
 		 515 aa  377  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0870889 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4656  ABC transporter related protein  47.29 
 
 		 506 aa  379  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479751 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01050  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  46.78 
 
 		 540 aa  372  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0046  L-arabinose transporter ATP-binding protein  45.26 
 
 		 522 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.54995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1601  ABC transporter related  39.76 
 
 		 525 aa  375  1e-102  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0832  ABC transporter related  42 
 
 		 520 aa  375  1e-102  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  43.49 
 
 		 514 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  41.37 
 
 		 524 aa  374  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0274  ABC transporter related protein  37.7 
 
 		 498 aa  374  1e-102  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  43.49 
 
 		 514 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  38.66 
 
 		 494 aa  372  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6621  ABC transporter related protein  42.03 
 
 		 525 aa  375  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823555 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2089  ABC transporter related protein  45.82 
 
 		 504 aa  372  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.558184  normal  0.156772 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0809  ABC transporter related  42 
 
 		 509 aa  374  1e-102  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4267  ABC transporter related  41.34 
 
 		 513 aa  372  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3041  ABC transporter related  47.02 
 
 		 500 aa  369  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1338  ABC transporter, ATP-binding protein  41.24 
 
 		 497 aa  369  1e-101  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.375231 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  43.71 
 
 		 514 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  41.39 
 
 		 525 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  41.09 
 
 		 525 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  42.44 
 
 		 517 aa  372  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2340  xylose transporter ATP-binding subunit  45.28 
 
 		 519 aa  370  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2595  ABC transporter related  43 
 
 		 537 aa  370  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.870253  normal  0.943264 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6711  ABC transporter related  41.58 
 
 		 511 aa  371  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  40.4 
 
 		 524 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3961  L-arabinose transporter ATP-binding protein  43.2 
 
 		 515 aa  371  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4920  L-arabinose transporter ATP-binding protein  44.51 
 
 		 519 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.671617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  40.4 
 
 		 524 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5597  ABC transporter related  41.57 
 
 		 503 aa  372  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.609428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4850  ABC transporter related  44.77 
 
 		 503 aa  371  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2787  ABC transporter for sugar (aldose) ATP-binding protein  40.17 
 
 		 495 aa  370  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0149064  normal  0.48477 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  41.63 
 
 		 516 aa  369  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4608  ABC transporter related  42.3 
 
 		 519 aa  370  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0989  ABC transporter related  38.21 
 
 		 499 aa  369  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86187  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5475  L-arabinose transporter ATP-binding protein  45.2 
 
 		 520 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0511877 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2757  L-arabinose transporter ATP-binding protein  44.95 
 
 		 511 aa  367  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.68449  normal  0.593741 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1911  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.56 
 
 		 506 aa  367  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389706  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  40.73 
 
 		 524 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.6 
 
 		 507 aa  367  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2010  ABC transporter related  37.08 
 
 		 500 aa  367  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0613  ABC transporter related  38.87 
 
 		 497 aa  366  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09550  ABC transporter related  41.7 
 
 		 500 aa  366  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.58805  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1703  ABC transporter related protein  37.65 
 
 		 504 aa  369  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2823  ABC transporter related  39.79 
 
 		 511 aa  367  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  43.49 
 
 		 507 aa  365  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>