More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2884 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2884  ABC transporter-like protein  100 
 
 		 502 aa  972    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.913699 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8259  ABC transporter-related protein  77 
 
 		 509 aa  704    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.332477  decreased coverage  0.00989255 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3851  ABC transporter related protein  65.07 
 
 		 521 aa  618  1e-176  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3726  ABC transporter related  65.53 
 
 		 522 aa  608  1e-173  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136325  hitchhiker  0.00703863 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2401  ABC transporter related protein  65.46 
 
 		 505 aa  602  1.0000000000000001e-171  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11040  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  64.46 
 
 		 500 aa  590  1e-167  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10500  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  63.13 
 
 		 499 aa  580  1e-164  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1351  ABC transporter related  61.68 
 
 		 508 aa  580  1e-164  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.387252 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  49.6 
 
 		 499 aa  427  1e-118  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  49.19 
 
 		 508 aa  424  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  42.86 
 
 		 495 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  46.48 
 
 		 497 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  48.33 
 
 		 515 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  48.12 
 
 		 517 aa  413  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  46.64 
 
 		 520 aa  414  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  46.87 
 
 		 514 aa  409  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2475  L-arabinose transporter ATP-binding protein  43.72 
 
 		 504 aa  409  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.74587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  42.48 
 
 		 494 aa  405  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0580  ABC transporter related  40.16 
 
 		 508 aa  402  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.677056  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6621  ABC transporter related protein  46 
 
 		 525 aa  403  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823555 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  47.24 
 
 		 504 aa  402  1e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0613  ABC transporter related  41.73 
 
 		 497 aa  401  9.999999999999999e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1049  ABC transporter related protein  45.27 
 
 		 496 aa  401  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2474  ABC transporter related  46.05 
 
 		 513 aa  401  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0599981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1612  ABC transporter related  42.94 
 
 		 496 aa  396  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  44.14 
 
 		 525 aa  398  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1760  ribose ABC transporter ATP-binding protein  42.94 
 
 		 496 aa  396  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.185473  hitchhiker  0.0000761209 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  47.15 
 
 		 508 aa  398  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1508  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.94 
 
 		 496 aa  396  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.106354  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09550  ABC transporter related  42.65 
 
 		 500 aa  396  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.58805  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  47.18 
 
 		 495 aa  397  1e-109  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4589  L-arabinose transporter ATP-binding protein  46.88 
 
 		 515 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173683 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01868  fused L-arabinose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  42.11 
 
 		 504 aa  392  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.97097  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2030  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.48 
 
 		 507 aa  394  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.288148  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1743  ABC transporter related protein  42.11 
 
 		 504 aa  392  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.50451  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.72 
 
 		 525 aa  394  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0046  L-arabinose transporter ATP-binding protein  46.67 
 
 		 522 aa  395  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.54995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1996  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.11 
 
 		 504 aa  392  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00548515  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5475  L-arabinose transporter ATP-binding protein  46.74 
 
 		 520 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0511877 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5219  L-arabinose transporter ATP-binding protein  46.67 
 
 		 515 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1601  ABC transporter related  41.21 
 
 		 525 aa  394  1e-108  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3207  L-arabinose transporter ATP-binding protein  46.96 
 
 		 515 aa  394  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0870889 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4920  L-arabinose transporter ATP-binding protein  46.67 
 
 		 519 aa  395  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.671617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2131  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.11 
 
 		 504 aa  392  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00340592  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  42.02 
 
 		 524 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5640  L-arabinose transporter ATP-binding protein  46.67 
 
 		 515 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.273168  normal  0.0496803 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2636  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.11 
 
 		 504 aa  392  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000458478 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1735  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.11 
 
 		 504 aa  392  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2246  L-arabinose transporter ATP-binding protein  43.64 
 
 		 511 aa  395  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000548441 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01857  hypothetical protein  42.11 
 
 		 504 aa  392  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.974378  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1286  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.11 
 
 		 504 aa  392  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00939133  hitchhiker  0.000000120675 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0832  ABC transporter related  42.22 
 
 		 520 aa  389  1e-107  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2148  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.45 
 
 		 507 aa  391  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  44.33 
 
 		 507 aa  390  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  46.95 
 
 		 514 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  42.48 
 
 		 506 aa  390  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  44.56 
 
 		 523 aa  389  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0809  ABC transporter related  42.22 
 
 		 509 aa  390  1e-107  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  46.85 
 
 		 514 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  45.05 
 
 		 512 aa  390  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  42.42 
 
 		 524 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  44.33 
 
 		 507 aa  390  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  46.85 
 
 		 514 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  43.29 
 
 		 506 aa  390  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0343  ABC transporter related  45.66 
 
 		 497 aa  390  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3596  ABC transporter related  42.36 
 
 		 509 aa  390  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.979323  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  43.9 
 
 		 507 aa  390  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  46.75 
 
 		 516 aa  390  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1024  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.9 
 
 		 504 aa  389  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  42.63 
 
 		 524 aa  391  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1884  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.17 
 
 		 523 aa  387  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.326668  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2330  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.88 
 
 		 507 aa  387  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0989  ABC transporter related  39.92 
 
 		 499 aa  388  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86187  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2996  L-arabinose transporter ATP-binding protein  44.69 
 
 		 511 aa  388  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.519724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  45.23 
 
 		 517 aa  385  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  44.04 
 
 		 514 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  42.02 
 
 		 524 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1911  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.28 
 
 		 506 aa  385  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389706  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4267  ABC transporter related  42.71 
 
 		 513 aa  385  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  42.02 
 
 		 527 aa  388  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  42.14 
 
 		 495 aa  388  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  43.17 
 
 		 524 aa  385  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  41.82 
 
 		 524 aa  388  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  43.47 
 
 		 510 aa  385  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  44.24 
 
 		 512 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  49.16 
 
 		 519 aa  388  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.71 
 
 		 501 aa  388  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1998  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.17 
 
 		 523 aa  387  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  44.54 
 
 		 513 aa  387  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  41.82 
 
 		 524 aa  388  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2262  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.97 
 
 		 523 aa  386  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  44.24 
 
 		 512 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1683  ABC transporter related  43.43 
 
 		 503 aa  387  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305806  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2586  L-arabinose transporter ATP-binding protein  44.49 
 
 		 511 aa  386  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  43.35 
 
 		 497 aa  386  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0289  ABC transporter related  43.5 
 
 		 506 aa  387  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.266417 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  40.64 
 
 		 499 aa  384  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3706  ABC transporter related  45.14 
 
 		 506 aa  384  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.594267  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  38.31 
 
 		 501 aa  384  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3410  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.66 
 
 		 512 aa  385  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0659281  normal  0.140224 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>