More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3851 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3851  ABC transporter related protein  100 
 
 		 521 aa  1012    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3726  ABC transporter related  70.34 
 
 		 522 aa  645    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136325  hitchhiker  0.00703863 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2401  ABC transporter related protein  68.74 
 
 		 505 aa  637    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8259  ABC transporter-related protein  68.47 
 
 		 509 aa  626  1e-178  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.332477  decreased coverage  0.00989255 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10500  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  66.73 
 
 		 499 aa  617  1e-175  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2884  ABC transporter-like protein  65.07 
 
 		 502 aa  607  9.999999999999999e-173  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.913699 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11040  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  63.93 
 
 		 500 aa  598  1e-170  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1351  ABC transporter related  63.37 
 
 		 508 aa  587  1e-166  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.387252 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  51.39 
 
 		 508 aa  458  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  47.4 
 
 		 514 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  47.09 
 
 		 512 aa  438  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  47.09 
 
 		 512 aa  438  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  46.8 
 
 		 512 aa  429  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  46.89 
 
 		 512 aa  426  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  48.69 
 
 		 499 aa  424  1e-117  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  46.39 
 
 		 513 aa  423  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  46.59 
 
 		 513 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  47.49 
 
 		 514 aa  421  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  45.75 
 
 		 497 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3129  ABC transporter related  46.93 
 
 		 504 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149382  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0613  ABC transporter related  41.92 
 
 		 497 aa  414  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  42.32 
 
 		 494 aa  413  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5597  ABC transporter related  45.04 
 
 		 503 aa  409  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.609428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  43.03 
 
 		 495 aa  409  1e-113  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  43.6 
 
 		 503 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  44.58 
 
 		 504 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3706  ABC transporter related  46.34 
 
 		 506 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.594267  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  46.53 
 
 		 516 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1338  ABC transporter, ATP-binding protein  43.72 
 
 		 497 aa  402  1e-111  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.375231 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09550  ABC transporter related  42.71 
 
 		 500 aa  404  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.58805  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01050  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  47.36 
 
 		 540 aa  402  1e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  44.93 
 
 		 507 aa  403  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  43.76 
 
 		 515 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1612  ABC transporter related  42.8 
 
 		 496 aa  400  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  44.94 
 
 		 520 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1508  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.8 
 
 		 496 aa  400  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.106354  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  40.48 
 
 		 499 aa  398  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5684  ABC transporter related  45.15 
 
 		 509 aa  396  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.878529 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.42 
 
 		 525 aa  398  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  40.48 
 
 		 499 aa  398  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  41.05 
 
 		 494 aa  397  1e-109  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1035  ABC sugar transporter, ATPase subunit  45.51 
 
 		 516 aa  397  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.474314  normal  0.672241 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0580  ABC transporter related  40.17 
 
 		 508 aa  396  1e-109  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.677056  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  47.49 
 
 		 495 aa  398  1e-109  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  43.58 
 
 		 517 aa  398  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1760  ribose ABC transporter ATP-binding protein  42.6 
 
 		 496 aa  398  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.185473  hitchhiker  0.0000761209 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3596  ABC transporter related  44.49 
 
 		 509 aa  397  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.979323  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7809  ABC transporter related  42.39 
 
 		 512 aa  398  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  45.66 
 
 		 504 aa  397  1e-109  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  44.26 
 
 		 525 aa  394  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4768  ABC transporter related  46.84 
 
 		 503 aa  393  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957059  normal  0.347139 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  41.32 
 
 		 501 aa  394  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  47.6 
 
 		 508 aa  394  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  44.84 
 
 		 514 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  46.72 
 
 		 519 aa  394  1e-108  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  43.54 
 
 		 508 aa  394  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  42.59 
 
 		 495 aa  392  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  44.84 
 
 		 514 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  44.84 
 
 		 514 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  45.95 
 
 		 505 aa  393  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4133  ABC transporter related  43.85 
 
 		 502 aa  389  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  44.05 
 
 		 517 aa  391  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  43.72 
 
 		 527 aa  392  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0813  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.35 
 
 		 499 aa  391  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0291  ABC transporter related  45.7 
 
 		 514 aa  391  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  43.72 
 
 		 524 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  43.93 
 
 		 524 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1049  ABC transporter related protein  44.84 
 
 		 496 aa  389  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  43.72 
 
 		 524 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0989  ABC transporter related  40.41 
 
 		 499 aa  391  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86187  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4608  ABC transporter related  43.48 
 
 		 519 aa  391  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3104  ABC transporter related protein  45.7 
 
 		 511 aa  391  1e-107  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  43.52 
 
 		 524 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3766  ABC transporter related  43.91 
 
 		 492 aa  392  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0098796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  44.54 
 
 		 516 aa  390  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2808  ABC transporter related  43.29 
 
 		 501 aa  390  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4267  ABC transporter related  43.28 
 
 		 513 aa  391  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0813  ABC transporter related  43.15 
 
 		 499 aa  390  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  43.93 
 
 		 524 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  44.49 
 
 		 524 aa  390  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  39.63 
 
 		 496 aa  387  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1242  sugar ATP-binding ABC transporter protein  44.75 
 
 		 518 aa  386  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0157  sugar ABC transporter ATP-binding protein  42.94 
 
 		 499 aa  387  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000963677 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  41.57 
 
 		 495 aa  387  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2595  ABC transporter related  42.59 
 
 		 537 aa  388  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.870253  normal  0.943264 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3235  ABC transporter related  43.15 
 
 		 506 aa  388  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.365394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3463  ABC transporter related  44.91 
 
 		 516 aa  387  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.309481 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  40.87 
 
 		 501 aa  387  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2122  ABC transporter related  42.57 
 
 		 511 aa  387  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1667  ABC transporter related  43.74 
 
 		 502 aa  388  1e-106  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.338027  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4850  ABC transporter related  46.64 
 
 		 503 aa  387  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2808  ABC transporter ATP-binding protein  41.94 
 
 		 510 aa  387  1e-106  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0501  ABC transporter related  43.63 
 
 		 511 aa  388  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548503 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2474  ABC transporter related  45.56 
 
 		 513 aa  386  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0599981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2021  xylose transporter ATP-binding subunit  41.68 
 
 		 504 aa  382  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0839  ABC transporter related  42.13 
 
 		 515 aa  384  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500489  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.46 
 
 		 501 aa  382  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  39.46 
 
 		 501 aa  383  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1212  ABC transporter related  44.51 
 
 		 511 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2929  ABC transporter related  43.55 
 
 		 521 aa  384  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180289 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>