More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3450 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3450  ABC transporter related protein  100 
 
 
496 aa  977    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  42.66 
 
 
497 aa  422  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  44.42 
 
 
501 aa  412  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  43.84 
 
 
501 aa  409  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  40.94 
 
 
503 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  43.47 
 
 
494 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5597  ABC transporter related  40.32 
 
 
503 aa  403  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.609428  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  44.49 
 
 
495 aa  404  1e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2010  ABC transporter related  44.6 
 
 
500 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  39.31 
 
 
504 aa  398  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2458  ABC transporter-related protein  38.57 
 
 
498 aa  396  1e-109  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1915  ABC transporter related  40.53 
 
 
502 aa  395  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.483253  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  42.05 
 
 
496 aa  395  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3699  ABC transporter related protein  38.8 
 
 
510 aa  390  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92688  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  44.27 
 
 
504 aa  392  1e-107  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1338  ABC transporter related  39.84 
 
 
515 aa  385  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.224173  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1667  ABC transporter related  43.89 
 
 
502 aa  386  1e-106  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.338027  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  39.71 
 
 
508 aa  386  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  38.37 
 
 
512 aa  388  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3044  ABC transporter related  39.61 
 
 
515 aa  386  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  38.37 
 
 
512 aa  388  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  38.52 
 
 
514 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2787  ABC transporter for sugar (aldose) ATP-binding protein  43.48 
 
 
495 aa  386  1e-106  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0149064  normal  0.48477 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2972  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.61 
 
 
515 aa  386  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2492  ABC transporter related protein  41.43 
 
 
498 aa  385  1e-106  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  37.7 
 
 
513 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  39.34 
 
 
523 aa  384  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  35.9 
 
 
505 aa  385  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4608  ABC transporter related  38.08 
 
 
519 aa  383  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  37.7 
 
 
512 aa  383  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3766  ABC transporter related  41.16 
 
 
492 aa  384  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0098796  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1873  sugar transport ATP-binding protein  39.61 
 
 
515 aa  385  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0103225 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  39.96 
 
 
514 aa  385  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2999  ABC transporter related protein  39.44 
 
 
515 aa  384  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.776135  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  37.7 
 
 
513 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  39.96 
 
 
514 aa  385  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  37.7 
 
 
512 aa  385  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  42.01 
 
 
503 aa  382  1e-105  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3062  ABC transporter related  42.17 
 
 
525 aa  383  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.187248  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  40.04 
 
 
514 aa  382  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0613  ABC transporter related  42.8 
 
 
497 aa  381  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0813  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.33 
 
 
499 aa  381  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  39.4 
 
 
524 aa  381  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  38.97 
 
 
495 aa  381  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0813  ABC transporter related  40.33 
 
 
499 aa  381  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2808  ABC transporter ATP-binding protein  42.16 
 
 
510 aa  382  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  42.3 
 
 
494 aa  380  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000081797  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1986  ABC transporter related  41.05 
 
 
501 aa  377  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.437257  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0157  sugar ABC transporter ATP-binding protein  40.12 
 
 
499 aa  378  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000963677 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3129  ABC transporter related  40.04 
 
 
504 aa  376  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149382  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0580  ABC transporter related  41.61 
 
 
508 aa  379  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.677056  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3337  ABC transporter related  39.04 
 
 
521 aa  377  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0989  ABC transporter related  44.28 
 
 
499 aa  377  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86187  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2474  ABC transporter related  37.1 
 
 
513 aa  378  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0599981  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  38.16 
 
 
507 aa  376  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  37.94 
 
 
497 aa  375  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0881  ABC transporter related protein  36.42 
 
 
499 aa  376  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.873937  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  38.08 
 
 
507 aa  377  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  37.99 
 
 
507 aa  375  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.19 
 
 
507 aa  377  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  40 
 
 
499 aa  375  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  40 
 
 
499 aa  375  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0116  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.04 
 
 
492 aa  373  1e-102  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  37.73 
 
 
517 aa  373  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5684  ABC transporter related  40.21 
 
 
509 aa  374  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.878529 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0274  ABC transporter related protein  40.81 
 
 
498 aa  372  1e-102  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  39.75 
 
 
519 aa  372  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  39.6 
 
 
514 aa  375  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3279  ABC transporter related  43.55 
 
 
505 aa  372  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0289  ABC transporter related  38.16 
 
 
506 aa  372  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2863  ABC transporter related  41.6 
 
 
518 aa  373  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.18747  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1703  ABC transporter related protein  41.84 
 
 
504 aa  369  1e-101  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  38.1 
 
 
508 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  36.42 
 
 
508 aa  369  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4656  ABC transporter related  40.76 
 
 
516 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.489627  normal  0.659628 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  39.1 
 
 
520 aa  371  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  40.04 
 
 
516 aa  371  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0885  ABC sugar transporter, ATPase subunit  37.88 
 
 
506 aa  370  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533742  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  39.51 
 
 
513 aa  372  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  38.19 
 
 
506 aa  372  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1035  ABC sugar transporter, ATPase subunit  39.31 
 
 
516 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.474314  normal  0.672241 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  42.11 
 
 
495 aa  370  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3706  ABC transporter related  38.26 
 
 
506 aa  370  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.594267  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09550  ABC transporter related  42.83 
 
 
500 aa  370  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.58805  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  37.37 
 
 
506 aa  370  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1911  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.08 
 
 
506 aa  370  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389706  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3784  ABC transporter related  38.28 
 
 
506 aa  371  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.915652  hitchhiker  0.00808443 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2159  ABC transporter related  39.52 
 
 
500 aa  370  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.634503  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2475  L-arabinose transporter ATP-binding protein  39.92 
 
 
504 aa  372  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.74587  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01868  fused L-arabinose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  39.96 
 
 
504 aa  365  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.97097  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  40.52 
 
 
495 aa  366  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  39.55 
 
 
494 aa  368  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.55 
 
 
494 aa  368  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.55 
 
 
494 aa  368  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1998  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.66 
 
 
523 aa  366  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2131  L-arabinose transporter ATP-binding protein  39.96 
 
 
504 aa  366  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00340592  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2636  L-arabinose transporter ATP-binding protein  39.96 
 
 
504 aa  365  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000458478 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.35 
 
 
494 aa  366  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1735  L-arabinose transporter ATP-binding protein  39.96 
 
 
504 aa  365  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0197  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  39.42 
 
 
517 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>