More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1148 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_1148  ABC transporter related  100 
 
 
264 aa  531  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6227  ABC transporter related  91.06 
 
 
256 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0846  ABC transporter related  76 
 
 
261 aa  371  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.409124  normal  0.0400632 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2600  ABC transporter related  71.43 
 
 
257 aa  337  9.999999999999999e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0548  ABC transporter related  60 
 
 
266 aa  295  4e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3269  ABC transporter related  44.26 
 
 
247 aa  199  3e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.704412 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3600  ABC transporter related protein  44.59 
 
 
289 aa  198  7.999999999999999e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0885  ABC transporter related  43.62 
 
 
245 aa  197  2.0000000000000003e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0800857 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2855  ABC transporter-related protein  43.7 
 
 
274 aa  196  3e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2514  ABC transporter-like protein  43.78 
 
 
284 aa  195  6e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.703565  normal  0.280675 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0183  ABC transporter related protein  43.32 
 
 
285 aa  195  6e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0493  ABC transporter related  41.6 
 
 
254 aa  191  8e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0504196  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4052  ABC transporter related  41.56 
 
 
282 aa  189  2.9999999999999997e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.146234  normal  0.303462 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4339  ABC transporter related  44 
 
 
263 aa  189  4e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3352  ABC transporter related  41.81 
 
 
265 aa  189  4e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4929  ABC transporter related  43.16 
 
 
246 aa  189  5e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.663119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3128  ABC transporter related protein  45.61 
 
 
275 aa  188  8e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404447  hitchhiker  0.00266425 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0037  ABC transporter related protein  42.02 
 
 
247 aa  188  8e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3623  ABC transporter related protein  47.3 
 
 
266 aa  186  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1854  ABC transporter related  43.75 
 
 
259 aa  186  4e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3425  ABC transporter related  41.18 
 
 
246 aa  185  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0892  ABC sugar transporter, ATPase subunit  42.55 
 
 
265 aa  185  6e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.68216 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0260  ABC transporter related  42.86 
 
 
260 aa  185  6e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.469491  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1461  ABC transporter related protein  44.05 
 
 
250 aa  185  6e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3594  ABC transporter related  41.77 
 
 
266 aa  185  7e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258671  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4592  ABC transporter related  44.3 
 
 
273 aa  185  7e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117213  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6322  ABC transporter related  44.44 
 
 
273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.645186  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6092  ABC transporter related  40.08 
 
 
253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2943  ABC transporter related  41.03 
 
 
247 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5339  ABC transporter related protein  39.57 
 
 
278 aa  184  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1753  ABC transporter-like protein  44 
 
 
257 aa  183  2.0000000000000003e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0987723  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5342  ABC transporter  41.3 
 
 
249 aa  182  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7024  ABC transporter related  44.64 
 
 
275 aa  183  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0071  ABC transporter related  41.63 
 
 
259 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1901  ABC transporter related  44.4 
 
 
265 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0159617  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2415  ABC transporter related  45.29 
 
 
273 aa  182  5.0000000000000004e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.133775  normal  0.475676 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1360  ABC transporter related protein  40.85 
 
 
269 aa  182  5.0000000000000004e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1719  ABC transporter related  40.93 
 
 
262 aa  182  6e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0707224  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0538  ABC transporter related  42.91 
 
 
274 aa  182  6e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.517887  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2692  ABC transporter related protein  42.62 
 
 
264 aa  182  7e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1274  ABC transporter-like protein  42.21 
 
 
244 aa  181  9.000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.292913  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1210  ABC transporter related  41.22 
 
 
259 aa  181  9.000000000000001e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286528  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6694  ABC transporter related  38.64 
 
 
262 aa  181  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.356782  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2605  ABC transporter related  41.87 
 
 
263 aa  181  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.120025  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4187  ABC transporter related  41.25 
 
 
265 aa  181  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2601  ABC transporter related  41.78 
 
 
258 aa  180  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4579  ABC transporter related  40.85 
 
 
265 aa  180  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00500559  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0127  ABC transporter related  44.54 
 
 
265 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0988  ABC sugar transporter, ATPase subunit  44.58 
 
 
258 aa  179  4e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0104  ABC transporter related  44.84 
 
 
260 aa  179  4e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394211  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2813  ABC transporter related  42.29 
 
 
276 aa  179  4e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2648  ABC transporter related  44.58 
 
 
258 aa  179  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0128  ABC transporter related  44.84 
 
 
260 aa  179  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0241  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.24 
 
 
288 aa  179  4e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0915  ABC transporter related  38.4 
 
 
251 aa  179  4.999999999999999e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2607  ABC transporter related  43.8 
 
 
260 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.143234  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4284  ABC transporter related protein  43.89 
 
 
260 aa  179  4.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0503  ABC transporter related  44.39 
 
 
264 aa  179  5.999999999999999e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0236  ABC transporter related  44.17 
 
 
258 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.762191 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4009  ABC transporter-related protein  41.52 
 
 
274 aa  178  8e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (xylose)  43.24 
 
 
277 aa  178  8e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2607  ABC transporter related  38.89 
 
 
274 aa  178  8e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1375  ABC transporter related  43.5 
 
 
257 aa  177  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.143315  normal  0.0808581 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2583  ABC transporter-like protein  42.42 
 
 
254 aa  178  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0266  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  41.81 
 
 
286 aa  177  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.079938  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3556  ABC transporter related protein  42.15 
 
 
260 aa  176  3e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301945  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6849  ABC transporter related  40.43 
 
 
255 aa  176  4e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.603639  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0832  ABC transporter related  38.59 
 
 
305 aa  176  4e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0378548  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5757  ABC transporter related  43.42 
 
 
257 aa  176  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3702  ABC sugar transporter, ATPase subunit  43.38 
 
 
265 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0388  ribose import ATP-binding protein rbsA  42.86 
 
 
261 aa  174  9.999999999999999e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.956313 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0345  ABC transporter related  40.17 
 
 
271 aa  174  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5969  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  43.95 
 
 
268 aa  174  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.354097  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3437  ABC transporter related  43.38 
 
 
265 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.196667  normal  0.174425 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3205  ABC transporter related  42.34 
 
 
272 aa  173  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00011421  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2715  sugar (ribose) ABC transporter ATP-binding protein  43.37 
 
 
261 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0375081  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1364  ABC transporter related  40.42 
 
 
278 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.113543  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1131  ABC transporter related  40.82 
 
 
261 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0806733 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2377  ABC transporter related  41.18 
 
 
252 aa  172  5e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0115  ABC transporter related  38.7 
 
 
315 aa  172  5e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2703  ABC transporter-related protein  40 
 
 
258 aa  172  5.999999999999999e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.787131  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1921  ABC-type sugar transport system ATPase component  41.05 
 
 
261 aa  171  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2852  ABC transporter related protein  40.08 
 
 
265 aa  171  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.198198  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0692  ABC transporter related  39.66 
 
 
271 aa  171  1e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4211  ABC transporter related protein  39.63 
 
 
276 aa  171  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24380  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  40.16 
 
 
275 aa  170  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.446861  normal  0.0741452 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1504  ABC transporter related  40.98 
 
 
257 aa  169  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5304  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  37.35 
 
 
255 aa  168  6e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.64898  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2646  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.62 
 
 
266 aa  168  7e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112475  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1327  ABC sugar transporter, ATPase subunit  38 
 
 
278 aa  168  7e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1808  ABC transporter related  41.71 
 
 
294 aa  168  9e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.976965 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2808  ABC transporter related  39 
 
 
288 aa  168  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.163546  normal  0.337543 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5022  ABC transporter related  38.56 
 
 
258 aa  168  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2316  ABC transporter related  37.96 
 
 
267 aa  168  1e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.573379  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2410  ABC transporter related  39.38 
 
 
282 aa  167  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1998  ABC transporter ATP-binding protein  42.59 
 
 
248 aa  167  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0341354  normal  0.212812 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5243  ABC transporter related  37.4 
 
 
245 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7504  normal  0.303485 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1033  ABC transporter related  37.66 
 
 
265 aa  167  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2770  ABC transporter related protein  38.36 
 
 
271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4037  ABC transporter related protein  42.18 
 
 
301 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108203  normal  0.0177889 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>