More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5243 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5243  ABC transporter related  100 
 
 		 245 aa  501  1e-141  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7504  normal  0.303485 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1210  ABC transporter related  46.53 
 
 		 259 aa  236  3e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286528  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5833  ABC transporter related  42.8 
 
 		 243 aa  211  7e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150147  normal  0.748971 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2692  ABC transporter related protein  44.4 
 
 		 264 aa  207  9e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1854  ABC transporter related  43.44 
 
 		 259 aa  206  2e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4851  ABC transporter related  43.1 
 
 		 262 aa  201  8e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782543  normal  0.109166 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1427  ABC transporter related  42.26 
 
 		 266 aa  201  9.999999999999999e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000710187  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2607  ABC transporter related  45.19 
 
 		 274 aa  199  3e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0914  ABC transporter related  42.92 
 
 		 240 aa  198  5e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5293  ABC transporter related  41 
 
 		 266 aa  198  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0740635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3341  ABC transporter related  42.62 
 
 		 262 aa  198  7.999999999999999e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00439567  normal  0.282749 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0548  ABC transporter related  40.41 
 
 		 266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1592  ABC transporter related  38.49 
 
 		 265 aa  195  7e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4037  ABC transporter related protein  42.02 
 
 		 301 aa  194  8.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108203  normal  0.0177889 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4535  ABC transporter related  42.44 
 
 		 274 aa  194  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2600  ABC transporter related  41.98 
 
 		 257 aa  194  1e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2770  ABC transporter related protein  42.15 
 
 		 271 aa  193  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1833  ABC transporter related  42.08 
 
 		 259 aa  193  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1719  ABC transporter related  39.75 
 
 		 262 aa  192  4e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0707224  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4009  ABC transporter-related protein  43.1 
 
 		 274 aa  192  5e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1713  ABC transporter-like protein  40.25 
 
 		 260 aa  192  5e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1339  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  41.67 
 
 		 259 aa  191  9e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1276  ABC transporter related  41.32 
 
 		 264 aa  190  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.233639  normal  0.257082 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1599  ABC transporter related  43.36 
 
 		 267 aa  191  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.664694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4052  ABC transporter related  40 
 
 		 282 aa  189  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.146234  normal  0.303462 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2852  ABC transporter related protein  44.08 
 
 		 265 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.198198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5342  ABC transporter  41.22 
 
 		 249 aa  189  4e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1693  ABC transporter-like protein  40.42 
 
 		 280 aa  188  5.999999999999999e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.564915 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1274  ABC transporter-like protein  40.65 
 
 		 244 aa  187  2e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.292913  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5304  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  41.15 
 
 		 255 aa  186  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.64898  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0914  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  42.54 
 
 		 266 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144366  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1600  ABC transporter related  40 
 
 		 260 aa  186  3e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1832  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.54 
 
 		 266 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.405866  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1445  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  42.54 
 
 		 266 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.59093  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0435  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  42.54 
 
 		 266 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125236  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1656  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  42.54 
 
 		 266 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1678  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  42.54 
 
 		 266 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0727  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  42.54 
 
 		 266 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455869  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2646  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.11 
 
 		 266 aa  186  4e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112475  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3600  ABC transporter related protein  38.49 
 
 		 289 aa  185  5e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2808  ABC transporter related  43.18 
 
 		 288 aa  185  6e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.163546  normal  0.337543 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1327  ABC sugar transporter, ATPase subunit  43.18 
 
 		 278 aa  185  7e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2410  ABC transporter related  40.17 
 
 		 282 aa  184  1.0000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0058  ABC transporter related  40.85 
 
 		 266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0493  ABC transporter related  40.56 
 
 		 254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0504196  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2408  ABC transporter-related protein  42.53 
 
 		 267 aa  182  4.0000000000000006e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0832  ABC transporter related  38.43 
 
 		 305 aa  182  5.0000000000000004e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0378548  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1364  ABC transporter related  41.95 
 
 		 278 aa  181  9.000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.113543  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0885  ABC transporter related  38.27 
 
 		 245 aa  181  1e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0800857 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6227  ABC transporter related  40.93 
 
 		 256 aa  181  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0353  ABC transporter related  39.57 
 
 		 302 aa  180  1e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0562207 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4339  ABC transporter related  39.33 
 
 		 263 aa  180  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2316  ABC transporter related  40.5 
 
 		 267 aa  180  2e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.573379  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2583  ABC transporter-like protein  40.91 
 
 		 254 aa  180  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1461  ABC transporter related protein  42.61 
 
 		 250 aa  180  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6849  ABC transporter related  40.68 
 
 		 255 aa  180  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.603639  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1360  ABC transporter related protein  36.82 
 
 		 269 aa  179  2.9999999999999997e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2473  ABC transporter related protein  39.5 
 
 		 258 aa  177  1e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.200808  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0846  ABC transporter related  41.84 
 
 		 261 aa  177  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.409124  normal  0.0400632 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0115  ABC transporter related  38.4 
 
 		 315 aa  177  2e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5339  ABC transporter related protein  41.56 
 
 		 278 aa  176  4e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4494  ABC transporter related  40.43 
 
 		 316 aa  175  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00159832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2703  ABC transporter-related protein  39.59 
 
 		 258 aa  175  6e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.787131  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0319  ABC transporter related  34.98 
 
 		 282 aa  175  7e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1504  ABC transporter related  40.5 
 
 		 257 aa  174  9e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2601  ABC transporter related  38.46 
 
 		 258 aa  174  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1808  ABC transporter related  38.53 
 
 		 294 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.976965 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1972  ABC transporter related  38.14 
 
 		 269 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0345  ABC transporter related  40.52 
 
 		 271 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2043  ABC transporter related  40.5 
 
 		 255 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.332554  normal  0.307392 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6092  ABC transporter related  38.11 
 
 		 253 aa  173  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3269  ABC transporter related  36.25 
 
 		 247 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.704412 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24380  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  39.26 
 
 		 275 aa  172  2.9999999999999996e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.446861  normal  0.0741452 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1998  ABC transporter ATP-binding protein  39.84 
 
 		 248 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0341354  normal  0.212812 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0037  ABC transporter related protein  38.31 
 
 		 247 aa  172  5.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3423  ABC transporter related  44.03 
 
 		 261 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111863  normal  0.794902 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3688  ABC sugar transporter, ATPase subunit  44.03 
 
 		 261 aa  171  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200201  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0654  ABC transporter related protein  39.59 
 
 		 267 aa  171  6.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2943  ABC transporter related  37.55 
 
 		 247 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4993  ABC transporter related protein  38.84 
 
 		 283 aa  170  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1375  ABC transporter related  38.02 
 
 		 257 aa  171  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.143315  normal  0.0808581 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0147  ABC transporter related  40 
 
 		 294 aa  171  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0779  ABC transporter related protein  38.02 
 
 		 528 aa  170  1e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.63436  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1187  ABC transporter related  40.83 
 
 		 264 aa  170  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.401309  normal  0.155677 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2715  sugar (ribose) ABC transporter ATP-binding protein  39.17 
 
 		 261 aa  170  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0375081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1986  ABC transporter related  37.08 
 
 		 501 aa  170  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.437257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1131  ABC transporter related  41.15 
 
 		 261 aa  170  2e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0806733 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4929  ABC transporter related  39.56 
 
 		 246 aa  170  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.663119 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1033  ABC transporter related  39.83 
 
 		 265 aa  169  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0047  ABC transporter related  38.33 
 
 		 247 aa  169  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4237  ABC transporter related  41.39 
 
 		 271 aa  169  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.413873  normal  0.20024 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3432  ABC transporter related  38.65 
 
 		 256 aa  169  4e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.731931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6740  ABC transporter related protein  39.58 
 
 		 254 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5292  ABC transporter-related protein  38.17 
 
 		 260 aa  167  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.688621  normal  0.0485107 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1574  ABC transporter related  39.75 
 
 		 261 aa  167  1e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.266375  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3847  ABC transporter related  40.98 
 
 		 271 aa  167  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1148  ABC transporter related  37.5 
 
 		 264 aa  166  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3425  ABC transporter related  37.97 
 
 		 246 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2617  ABC transporter related  38.31 
 
 		 260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5684  ABC transporter related  41.89 
 
 		 509 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.878529 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>