More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2648 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0988  ABC sugar transporter, ATPase subunit  100 
 
 		 258 aa  521  1e-147  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2648  ABC transporter related  100 
 
 		 258 aa  521  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0236  ABC transporter related  94.57 
 
 		 258 aa  497  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.762191 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0104  ABC transporter related  84.8 
 
 		 260 aa  436  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2607  ABC transporter related  82.28 
 
 		 260 aa  434  1e-121  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.143234  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0503  ABC transporter related  82.87 
 
 		 264 aa  429  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0128  ABC transporter related  84.34 
 
 		 260 aa  427  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5969  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  83.4 
 
 		 268 aa  426  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.354097  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0388  ribose import ATP-binding protein rbsA  81.75 
 
 		 261 aa  426  1e-118  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.956313 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0127  ABC transporter related  84.27 
 
 		 265 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0071  ABC transporter related  84.4 
 
 		 259 aa  427  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0370  ABC transporter related  80.24 
 
 		 259 aa  423  1e-117  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1375  ABC transporter related  79.45 
 
 		 257 aa  417  1e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.143315  normal  0.0808581 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2415  ABC transporter related  76.98 
 
 		 273 aa  404  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.133775  normal  0.475676 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4187  ABC transporter related  74.09 
 
 		 265 aa  388  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3352  ABC transporter related  68.13 
 
 		 265 aa  337  9.999999999999999e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2855  ABC transporter-related protein  64.68 
 
 		 274 aa  331  6e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3556  ABC transporter related protein  66.27 
 
 		 260 aa  329  3e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301945  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0892  ABC sugar transporter, ATPase subunit  66.67 
 
 		 265 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.68216 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0183  ABC transporter related protein  63.1 
 
 		 285 aa  324  7e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3594  ABC transporter related  64.49 
 
 		 266 aa  322  3e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4579  ABC transporter related  64.63 
 
 		 265 aa  319  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00500559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5757  ABC transporter related  62.95 
 
 		 257 aa  318  6e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2514  ABC transporter-like protein  62.89 
 
 		 284 aa  316  2e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.703565  normal  0.280675 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2223  ABC transporter-related protein  65.74 
 
 		 263 aa  315  4e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0935635 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2605  ABC transporter related  64.31 
 
 		 263 aa  309  2.9999999999999997e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.120025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0538  ABC transporter related  66.27 
 
 		 274 aa  308  5.9999999999999995e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.517887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3205  ABC transporter related  65.88 
 
 		 272 aa  308  8e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00011421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7024  ABC transporter related  63.56 
 
 		 275 aa  301  6.000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3623  ABC transporter related protein  64.23 
 
 		 266 aa  299  3e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3128  ABC transporter related protein  64.08 
 
 		 275 aa  295  5e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404447  hitchhiker  0.00266425 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1901  ABC transporter related  63.35 
 
 		 265 aa  288  8e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0159617  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0717  ABC transporter related  60.48 
 
 		 257 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.393334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2601  ABC transporter related  52.59 
 
 		 258 aa  254  7e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3969  ABC transporter related  51.81 
 
 		 254 aa  251  6e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0349444  normal  0.0435922 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1600  ABC transporter related  50.39 
 
 		 260 aa  248  8e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6092  ABC transporter related  49.6 
 
 		 253 aa  237  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0345  ABC transporter related  49.2 
 
 		 271 aa  231  1e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4339  ABC transporter related  46.03 
 
 		 263 aa  229  4e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5292  ABC transporter-related protein  47.13 
 
 		 260 aa  223  3e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.688621  normal  0.0485107 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0260  ABC transporter related  47.24 
 
 		 260 aa  221  9.999999999999999e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.469491  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1131  ABC transporter related  46.72 
 
 		 261 aa  216  2e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0806733 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2673  ABC transporter related protein  50.89 
 
 		 261 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00128124  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6740  ABC transporter related protein  47.56 
 
 		 254 aa  216  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1574  ABC transporter related  47.95 
 
 		 261 aa  215  5.9999999999999996e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.266375  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1364  ABC transporter related  46.12 
 
 		 278 aa  215  7e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.113543  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2703  ABC transporter-related protein  43.31 
 
 		 258 aa  213  1.9999999999999998e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.787131  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1504  ABC transporter related  47.35 
 
 		 257 aa  213  3.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0493  ABC transporter related  45.56 
 
 		 254 aa  211  7e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0504196  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4237  ABC transporter related  45.9 
 
 		 271 aa  209  3e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.413873  normal  0.20024 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1125  ABC transporter related protein  45.9 
 
 		 266 aa  208  7e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13168  normal  0.0632249 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2377  ABC transporter related  44.62 
 
 		 252 aa  207  9e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1187  ABC transporter related  44.86 
 
 		 264 aa  207  1e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.401309  normal  0.155677 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3847  ABC transporter related  45.9 
 
 		 271 aa  207  1e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1274  ABC transporter-like protein  47.56 
 
 		 244 aa  206  3e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.292913  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24380  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  45.71 
 
 		 275 aa  204  1e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.446861  normal  0.0741452 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1461  ABC transporter related protein  46.34 
 
 		 250 aa  204  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5293  ABC transporter related  43.95 
 
 		 266 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0740635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1210  ABC transporter related  44 
 
 		 259 aa  203  2e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286528  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5948  ABC transporter related  45.31 
 
 		 313 aa  202  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5347  ABC transporter related  45.49 
 
 		 261 aa  202  4e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2671  ABC transporter related protein  45.93 
 
 		 269 aa  202  4e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000816223  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4993  ABC transporter related protein  45.6 
 
 		 283 aa  202  6e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5342  ABC transporter  44.08 
 
 		 249 aa  201  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2273  ABC transporter-like protein  46.4 
 
 		 257 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0986317 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1033  ABC transporter related  44.49 
 
 		 265 aa  195  5.000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6694  ABC transporter related  43.32 
 
 		 262 aa  194  8.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.356782  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3702  ABC sugar transporter, ATPase subunit  44.94 
 
 		 265 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1693  ABC transporter-like protein  42.91 
 
 		 280 aa  194  1e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.564915 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0885  ABC transporter related  43.5 
 
 		 245 aa  194  1e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0800857 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3437  ABC transporter related  44.94 
 
 		 265 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.196667  normal  0.174425 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1972  ABC transporter related  46.15 
 
 		 269 aa  194  2e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4284  ABC transporter related protein  44.13 
 
 		 260 aa  192  3e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (xylose)  45.53 
 
 		 277 aa  192  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4465  ABC transporter related  47.77 
 
 		 261 aa  192  4e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0992  ABC transporter related  48 
 
 		 257 aa  191  7e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2770  ABC transporter related protein  44.96 
 
 		 271 aa  191  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3269  ABC transporter related  42.91 
 
 		 247 aa  191  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.704412 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4851  ABC transporter related  39.76 
 
 		 262 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782543  normal  0.109166 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0037  ABC transporter related protein  43.37 
 
 		 247 aa  191  1e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2646  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  41.46 
 
 		 266 aa  190  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112475  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1592  ABC transporter related  40 
 
 		 265 aa  189  2.9999999999999997e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2808  ABC transporter related  41.39 
 
 		 288 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.163546  normal  0.337543 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1327  ABC sugar transporter, ATPase subunit  41.39 
 
 		 278 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1833  ABC transporter related  42.68 
 
 		 259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2583  ABC transporter-like protein  47.03 
 
 		 254 aa  189  4e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1921  ABC-type sugar transport system ATPase component  44.94 
 
 		 261 aa  189  5e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1808  ABC transporter related  41.46 
 
 		 294 aa  189  5e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.976965 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6322  ABC transporter related  44.13 
 
 		 273 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.645186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2692  ABC transporter related protein  42.68 
 
 		 264 aa  188  8e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2813  ABC transporter related  44.13 
 
 		 276 aa  188  8e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1667  ABC transporter related  39.76 
 
 		 502 aa  187  1e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.338027  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0241  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.37 
 
 		 288 aa  187  1e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1753  ABC transporter-like protein  42.29 
 
 		 257 aa  187  1e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0987723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1276  ABC transporter related  42.73 
 
 		 264 aa  186  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.233639  normal  0.257082 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3432  ABC transporter related  44.14 
 
 		 256 aa  187  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.731931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1210  ABC transporter  46.43 
 
 		 261 aa  186  4e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.986169  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1719  ABC transporter related  40.71 
 
 		 262 aa  186  4e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0707224  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2410  ABC transporter related  40.55 
 
 		 282 aa  186  4e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1998  ABC transporter ATP-binding protein  44.05 
 
 		 248 aa  185  6e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0341354  normal  0.212812 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>