More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1276 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1276  ABC transporter related  100 
 
 		 264 aa  539  9.999999999999999e-153  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.233639  normal  0.257082 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3341  ABC transporter related  86.15 
 
 		 262 aa  471  1e-132  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00439567  normal  0.282749 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1427  ABC transporter related  78.24 
 
 		 266 aa  422  1e-117  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000710187  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2408  ABC transporter-related protein  75.78 
 
 		 267 aa  400  9.999999999999999e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0058  ABC transporter related  72.27 
 
 		 266 aa  375  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1833  ABC transporter related  67.58 
 
 		 259 aa  355  2.9999999999999997e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1339  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  67.58 
 
 		 259 aa  354  8.999999999999999e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5293  ABC transporter related  64.77 
 
 		 266 aa  352  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0740635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4851  ABC transporter related  65 
 
 		 262 aa  352  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782543  normal  0.109166 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2410  ABC transporter related  65.62 
 
 		 282 aa  342  4e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1693  ABC transporter-like protein  59.68 
 
 		 280 aa  325  6e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.564915 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1719  ABC transporter related  61.02 
 
 		 262 aa  321  7e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0707224  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1599  ABC transporter related  53.05 
 
 		 267 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.664694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2692  ABC transporter related protein  55.38 
 
 		 264 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1327  ABC sugar transporter, ATPase subunit  54.72 
 
 		 278 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2808  ABC transporter related  54.72 
 
 		 288 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.163546  normal  0.337543 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0914  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  52.47 
 
 		 266 aa  299  3e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144366  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1832  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  52.47 
 
 		 266 aa  299  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.405866  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1445  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  52.47 
 
 		 266 aa  299  3e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.59093  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0435  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  52.47 
 
 		 266 aa  299  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125236  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1656  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  52.47 
 
 		 266 aa  299  3e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1678  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  52.47 
 
 		 266 aa  299  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0727  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  52.47 
 
 		 266 aa  299  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455869  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2646  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  52.09 
 
 		 266 aa  299  4e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112475  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1592  ABC transporter related  54.58 
 
 		 265 aa  298  6e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1713  ABC transporter-like protein  58.17 
 
 		 260 aa  291  7e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4037  ABC transporter related protein  57.49 
 
 		 301 aa  278  5e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108203  normal  0.0177889 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4494  ABC transporter related  55.47 
 
 		 316 aa  266  2.9999999999999995e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00159832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1808  ABC transporter related  53.91 
 
 		 294 aa  263  1e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.976965 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6849  ABC transporter related  53.54 
 
 		 255 aa  260  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.603639  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3600  ABC transporter related protein  51.55 
 
 		 289 aa  258  6e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2473  ABC transporter related protein  50.4 
 
 		 258 aa  253  3e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.200808  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1360  ABC transporter related protein  50 
 
 		 269 aa  250  2e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0832  ABC transporter related  49 
 
 		 305 aa  247  2e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0378548  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2770  ABC transporter related protein  50 
 
 		 271 aa  245  6e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4535  ABC transporter related  49.04 
 
 		 274 aa  244  9.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0115  ABC transporter related  49.06 
 
 		 315 aa  243  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2607  ABC transporter related  49.21 
 
 		 274 aa  241  7e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4052  ABC transporter related  47.69 
 
 		 282 aa  241  9e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.146234  normal  0.303462 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4009  ABC transporter-related protein  47.64 
 
 		 274 aa  237  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1210  ABC transporter related  45.68 
 
 		 259 aa  224  9e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286528  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2316  ABC transporter related  47.24 
 
 		 267 aa  223  2e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.573379  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0654  ABC transporter related protein  46.48 
 
 		 267 aa  224  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1274  ABC transporter-like protein  44.86 
 
 		 244 aa  218  7.999999999999999e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.292913  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5342  ABC transporter  43.72 
 
 		 249 aa  215  5e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5833  ABC transporter related  40.83 
 
 		 243 aa  207  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150147  normal  0.748971 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1600  ABC transporter related  43.09 
 
 		 260 aa  205  5e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0047  ABC transporter related  43.85 
 
 		 247 aa  204  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2601  ABC transporter related  42.86 
 
 		 258 aa  202  7e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0914  ABC transporter related  42.68 
 
 		 240 aa  201  8e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0071  ABC transporter related  39.84 
 
 		 259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2415  ABC transporter related  41.57 
 
 		 273 aa  199  5e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.133775  normal  0.475676 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1375  ABC transporter related  41.46 
 
 		 257 aa  196  3e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.143315  normal  0.0808581 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5339  ABC transporter related protein  41.11 
 
 		 278 aa  196  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4187  ABC transporter related  38.31 
 
 		 265 aa  194  8.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5969  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  41.94 
 
 		 268 aa  194  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.354097  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0260  ABC transporter related  39.29 
 
 		 260 aa  194  1e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.469491  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3702  ABC sugar transporter, ATPase subunit  43.67 
 
 		 265 aa  193  2e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4339  ABC transporter related  39.24 
 
 		 263 aa  194  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0370  ABC transporter related  42.4 
 
 		 259 aa  193  2e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3437  ABC transporter related  43.67 
 
 		 265 aa  193  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.196667  normal  0.174425 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  40.91 
 
 		 495 aa  192  4e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0388  ribose import ATP-binding protein rbsA  40.08 
 
 		 261 aa  192  5e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.956313 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6322  ABC transporter related  42.79 
 
 		 273 aa  191  8e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.645186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5304  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.04 
 
 		 255 aa  191  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.64898  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2703  ABC transporter-related protein  39.34 
 
 		 258 aa  191  1e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.787131  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0345  ABC transporter related  40.65 
 
 		 271 aa  191  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (xylose)  40.84 
 
 		 277 aa  191  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0104  ABC transporter related  41.53 
 
 		 260 aa  190  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0503  ABC transporter related  42.74 
 
 		 264 aa  190  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5243  ABC transporter related  41.32 
 
 		 245 aa  190  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7504  normal  0.303485 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0128  ABC transporter related  39.92 
 
 		 260 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  38.68 
 
 		 497 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0992  ABC transporter related  38.46 
 
 		 257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6740  ABC transporter related protein  37.5 
 
 		 254 aa  189  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3969  ABC transporter related  42.21 
 
 		 254 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0349444  normal  0.0435922 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0127  ABC transporter related  40.08 
 
 		 265 aa  189  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1574  ABC transporter related  38.62 
 
 		 261 aa  189  4e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.266375  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4237  ABC transporter related  39.29 
 
 		 271 aa  189  4e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.413873  normal  0.20024 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4579  ABC transporter related  39.37 
 
 		 265 aa  189  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00500559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1655  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.08 
 
 		 517 aa  189  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4592  ABC transporter related  42.24 
 
 		 273 aa  189  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0286  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  40.08 
 
 		 517 aa  189  5e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0197  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  40.08 
 
 		 517 aa  189  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0147  ABC transporter related  38.93 
 
 		 294 aa  188  7e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3847  ABC transporter related  40.23 
 
 		 271 aa  188  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  38.59 
 
 		 517 aa  186  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0988  ABC sugar transporter, ATPase subunit  42.73 
 
 		 258 aa  186  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0211  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.84 
 
 		 517 aa  186  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40873  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0892  ABC sugar transporter, ATPase subunit  40 
 
 		 265 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.68216 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0236  ABC transporter related  43.81 
 
 		 258 aa  186  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.762191 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1461  ABC transporter related protein  39.43 
 
 		 250 aa  187  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1033  ABC transporter related  39.42 
 
 		 265 aa  186  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2648  ABC transporter related  42.73 
 
 		 258 aa  186  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2813  ABC transporter related  43.67 
 
 		 276 aa  186  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2725  ABC transporter related  38.84 
 
 		 501 aa  186  3e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4284  ABC transporter related protein  39.52 
 
 		 260 aa  186  5e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0613  ABC transporter related  38.02 
 
 		 497 aa  185  6e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  36.07 
 
 		 506 aa  185  6e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2673  ABC transporter related protein  38.78 
 
 		 261 aa  185  7e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00128124  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>