More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0992 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0992  ABC transporter related  100 
 
 		 257 aa  508  1e-143  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2601  ABC transporter related  48.16 
 
 		 258 aa  247  2e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3969  ABC transporter related  50.61 
 
 		 254 aa  242  5e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0349444  normal  0.0435922 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0345  ABC transporter related  46.43 
 
 		 271 aa  236  3e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0183  ABC transporter related protein  47.2 
 
 		 285 aa  235  6e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2855  ABC transporter-related protein  49.6 
 
 		 274 aa  233  2.0000000000000002e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4187  ABC transporter related  46.15 
 
 		 265 aa  232  4.0000000000000004e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0071  ABC transporter related  47.64 
 
 		 259 aa  232  5e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3352  ABC transporter related  48.56 
 
 		 265 aa  231  6e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6092  ABC transporter related  47.74 
 
 		 253 aa  231  1e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0892  ABC sugar transporter, ATPase subunit  47.81 
 
 		 265 aa  229  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.68216 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0128  ABC transporter related  47.98 
 
 		 260 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0104  ABC transporter related  46.37 
 
 		 260 aa  230  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1364  ABC transporter related  49.17 
 
 		 278 aa  230  2e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.113543  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2514  ABC transporter-like protein  46.4 
 
 		 284 aa  229  3e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.703565  normal  0.280675 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0127  ABC transporter related  48.16 
 
 		 265 aa  229  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3594  ABC transporter related  47.01 
 
 		 266 aa  226  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4579  ABC transporter related  46.61 
 
 		 265 aa  226  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00500559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5969  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  45.56 
 
 		 268 aa  226  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.354097  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2415  ABC transporter related  46.43 
 
 		 273 aa  225  5.0000000000000005e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.133775  normal  0.475676 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4339  ABC transporter related  46.83 
 
 		 263 aa  225  5.0000000000000005e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1375  ABC transporter related  43.09 
 
 		 257 aa  223  3e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.143315  normal  0.0808581 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5757  ABC transporter related  47.76 
 
 		 257 aa  221  9e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0388  ribose import ATP-binding protein rbsA  44.62 
 
 		 261 aa  218  5e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.956313 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1854  ABC transporter related  48.37 
 
 		 259 aa  219  5e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0260  ABC transporter related  46 
 
 		 260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.469491  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0988  ABC sugar transporter, ATPase subunit  45.12 
 
 		 258 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2648  ABC transporter related  45.12 
 
 		 258 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5833  ABC transporter related  42.68 
 
 		 243 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150147  normal  0.748971 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0236  ABC transporter related  47.56 
 
 		 258 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.762191 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2605  ABC transporter related  44.18 
 
 		 263 aa  211  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.120025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7024  ABC transporter related  48.15 
 
 		 275 aa  211  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0503  ABC transporter related  42.06 
 
 		 264 aa  210  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2223  ABC transporter-related protein  45.16 
 
 		 263 aa  209  3e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0935635 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2607  ABC transporter related  47.79 
 
 		 260 aa  208  6e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.143234  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1901  ABC transporter related  45.42 
 
 		 265 aa  208  6e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0159617  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3205  ABC transporter related  44.4 
 
 		 272 aa  208  8e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00011421  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3556  ABC transporter related protein  45.85 
 
 		 260 aa  207  2e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301945  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1600  ABC transporter related  43.67 
 
 		 260 aa  204  8e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3623  ABC transporter related protein  47.56 
 
 		 266 aa  204  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0538  ABC transporter related  45.49 
 
 		 274 aa  203  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.517887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3128  ABC transporter related protein  45.61 
 
 		 275 aa  203  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404447  hitchhiker  0.00266425 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0370  ABC transporter related  43.5 
 
 		 259 aa  203  3e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3432  ABC transporter related  45.02 
 
 		 256 aa  203  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.731931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1131  ABC transporter related  43.72 
 
 		 261 aa  202  4e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0806733 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1274  ABC transporter-like protein  47.75 
 
 		 244 aa  201  8e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.292913  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1693  ABC transporter-like protein  44.03 
 
 		 280 aa  201  9.999999999999999e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.564915 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4211  ABC transporter related protein  44.53 
 
 		 276 aa  200  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6740  ABC transporter related protein  44.86 
 
 		 254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5342  ABC transporter  44.39 
 
 		 249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2673  ABC transporter related protein  45.49 
 
 		 261 aa  199  3e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00128124  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2813  ABC transporter related  46.09 
 
 		 276 aa  199  3e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1276  ABC transporter related  39.27 
 
 		 264 aa  199  3e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.233639  normal  0.257082 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3341  ABC transporter related  40.74 
 
 		 262 aa  199  3e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00439567  normal  0.282749 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6694  ABC transporter related  46.03 
 
 		 262 aa  199  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.356782  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0717  ABC transporter related  46.03 
 
 		 257 aa  198  7.999999999999999e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.393334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2043  ABC transporter related  46.96 
 
 		 255 aa  198  9e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.332554  normal  0.307392 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2770  ABC transporter related protein  44.9 
 
 		 271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4284  ABC transporter related protein  44.4 
 
 		 260 aa  196  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1461  ABC transporter related protein  45.49 
 
 		 250 aa  196  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1033  ABC transporter related  44.58 
 
 		 265 aa  196  2.0000000000000003e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1998  ABC transporter ATP-binding protein  41.49 
 
 		 248 aa  195  6e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0341354  normal  0.212812 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0692  ABC transporter related  43.95 
 
 		 271 aa  195  6e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4851  ABC transporter related  40.32 
 
 		 262 aa  195  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782543  normal  0.109166 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0037  ABC transporter related protein  42.62 
 
 		 247 aa  195  6e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5339  ABC transporter related protein  42.46 
 
 		 278 aa  195  6e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1719  ABC transporter related  45.33 
 
 		 262 aa  195  7e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0707224  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4237  ABC transporter related  42.8 
 
 		 271 aa  194  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.413873  normal  0.20024 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1574  ABC transporter related  44 
 
 		 261 aa  194  1e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.266375  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2583  ABC transporter-like protein  46.12 
 
 		 254 aa  194  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1753  ABC transporter-like protein  41.15 
 
 		 257 aa  194  2e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0987723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0548  ABC transporter related  43.46 
 
 		 266 aa  193  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1125  ABC transporter related protein  44.44 
 
 		 266 aa  193  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13168  normal  0.0632249 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2607  ABC transporter related  41.37 
 
 		 274 aa  193  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0914  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  44.1 
 
 		 266 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144366  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1921  ABC-type sugar transport system ATPase component  44.76 
 
 		 261 aa  193  3e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1832  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.1 
 
 		 266 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.405866  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1445  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  44.1 
 
 		 266 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.59093  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0435  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  44.1 
 
 		 266 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125236  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1656  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  44.1 
 
 		 266 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1678  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  44.1 
 
 		 266 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0727  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  44.1 
 
 		 266 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455869  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2273  ABC transporter-like protein  43.09 
 
 		 257 aa  192  4e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0986317 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5292  ABC transporter-related protein  41.87 
 
 		 260 aa  191  7e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.688621  normal  0.0485107 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2377  ABC transporter related  43.32 
 
 		 252 aa  191  8e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4009  ABC transporter-related protein  40.73 
 
 		 274 aa  191  9e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2692  ABC transporter related protein  42.28 
 
 		 264 aa  191  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6322  ABC transporter related  43.53 
 
 		 273 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.645186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1210  ABC transporter related  43.62 
 
 		 259 aa  191  1e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286528  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2646  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.79 
 
 		 266 aa  190  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112475  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2852  ABC transporter related protein  44.98 
 
 		 265 aa  190  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.198198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4592  ABC transporter related  43.92 
 
 		 273 aa  190  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117213  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5293  ABC transporter related  40.8 
 
 		 266 aa  190  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0740635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3847  ABC transporter related  42.39 
 
 		 271 aa  190  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4929  ABC transporter related  44.72 
 
 		 246 aa  190  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.663119 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3600  ABC transporter related protein  40.32 
 
 		 289 aa  190  2.9999999999999997e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0241  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.31 
 
 		 288 aa  189  2.9999999999999997e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0914  ABC transporter related  42.48 
 
 		 240 aa  188  7e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4535  ABC transporter related  42.62 
 
 		 274 aa  188  8e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0885  ABC transporter related  40.82 
 
 		 245 aa  187  1e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0800857 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>