More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0183 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_0183  ABC transporter related protein  100 
 
 
285 aa  573  1.0000000000000001e-162  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2855  ABC transporter-related protein  85.21 
 
 
274 aa  442  1e-123  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2514  ABC transporter-like protein  80.43 
 
 
284 aa  432  1e-120  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.703565  normal  0.280675 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3352  ABC transporter related  79.23 
 
 
265 aa  424  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3594  ABC transporter related  75.39 
 
 
266 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258671  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0892  ABC sugar transporter, ATPase subunit  75.39 
 
 
265 aa  402  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.68216 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2605  ABC transporter related  77.69 
 
 
263 aa  402  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.120025  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4579  ABC transporter related  74.61 
 
 
265 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00500559  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2223  ABC transporter-related protein  78.21 
 
 
263 aa  392  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0935635 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3205  ABC transporter related  75.75 
 
 
272 aa  389  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00011421  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1901  ABC transporter related  75.29 
 
 
265 aa  373  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0159617  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0538  ABC transporter related  75.49 
 
 
274 aa  373  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.517887  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3556  ABC transporter related protein  68 
 
 
260 aa  351  8.999999999999999e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301945  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4187  ABC transporter related  69.76 
 
 
265 aa  349  3e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3128  ABC transporter related protein  70.97 
 
 
275 aa  340  1e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404447  hitchhiker  0.00266425 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7024  ABC transporter related  71.31 
 
 
275 aa  338  4e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0071  ABC transporter related  67.97 
 
 
259 aa  336  1.9999999999999998e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0104  ABC transporter related  64.34 
 
 
260 aa  335  3.9999999999999995e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394211  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3623  ABC transporter related protein  71.02 
 
 
266 aa  335  7e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1375  ABC transporter related  63.49 
 
 
257 aa  333  1e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.143315  normal  0.0808581 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2415  ABC transporter related  64.82 
 
 
273 aa  331  1e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.133775  normal  0.475676 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5969  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  63.18 
 
 
268 aa  330  1e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.354097  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0127  ABC transporter related  62.87 
 
 
265 aa  325  5e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0988  ABC sugar transporter, ATPase subunit  63.1 
 
 
258 aa  324  9e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2648  ABC transporter related  63.1 
 
 
258 aa  324  9e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0236  ABC transporter related  63.49 
 
 
258 aa  324  1e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.762191 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0503  ABC transporter related  61.87 
 
 
264 aa  322  3e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0128  ABC transporter related  63.85 
 
 
260 aa  322  4e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0388  ribose import ATP-binding protein rbsA  62.02 
 
 
261 aa  319  3.9999999999999996e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.956313 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0370  ABC transporter related  61.85 
 
 
259 aa  318  7.999999999999999e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2607  ABC transporter related  62.7 
 
 
260 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.143234  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5757  ABC transporter related  62.2 
 
 
257 aa  305  8.000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2601  ABC transporter related  55.69 
 
 
258 aa  282  5.000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0717  ABC transporter related  60.48 
 
 
257 aa  278  1e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.393334  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1600  ABC transporter related  53.28 
 
 
260 aa  263  2e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6092  ABC transporter related  53.25 
 
 
253 aa  255  5e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0345  ABC transporter related  47.51 
 
 
271 aa  251  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3969  ABC transporter related  48.8 
 
 
254 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0349444  normal  0.0435922 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0260  ABC transporter related  46.69 
 
 
260 aa  226  4e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.469491  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4339  ABC transporter related  44.71 
 
 
263 aa  225  5.0000000000000005e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0493  ABC transporter related  47.35 
 
 
254 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0504196  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1364  ABC transporter related  45.9 
 
 
278 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.113543  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1461  ABC transporter related protein  46.53 
 
 
250 aa  217  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5293  ABC transporter related  45.2 
 
 
266 aa  216  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0740635  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0992  ABC transporter related  44.8 
 
 
257 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5342  ABC transporter  43.72 
 
 
249 aa  211  7.999999999999999e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4284  ABC transporter related protein  45.16 
 
 
260 aa  210  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1339  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.49 
 
 
259 aa  209  4e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1719  ABC transporter related  44.53 
 
 
262 aa  207  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0707224  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1972  ABC transporter related  46.91 
 
 
269 aa  208  1e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6740  ABC transporter related protein  45.9 
 
 
254 aa  207  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5292  ABC transporter-related protein  45.49 
 
 
260 aa  206  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.688621  normal  0.0485107 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2410  ABC transporter related  44.13 
 
 
282 aa  206  4e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1833  ABC transporter related  43.31 
 
 
259 aa  206  5e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2671  ABC transporter related protein  44.84 
 
 
269 aa  205  5e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000816223  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6694  ABC transporter related  43.92 
 
 
262 aa  205  6e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.356782  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2583  ABC transporter-like protein  46.81 
 
 
254 aa  205  6e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1187  ABC transporter related  43.25 
 
 
264 aa  204  9e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.401309  normal  0.155677 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1274  ABC transporter-like protein  45.31 
 
 
244 aa  204  1e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.292913  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1504  ABC transporter related  44.26 
 
 
257 aa  203  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2852  ABC transporter related protein  46.37 
 
 
265 aa  203  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.198198  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24380  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  45.9 
 
 
275 aa  202  4e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.446861  normal  0.0741452 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5339  ABC transporter related protein  42.21 
 
 
278 aa  202  4e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4211  ABC transporter related protein  43.56 
 
 
276 aa  201  8e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3269  ABC transporter related  42.51 
 
 
247 aa  201  9e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.704412 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4993  ABC transporter related protein  47.79 
 
 
283 aa  201  9e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356987  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0037  ABC transporter related protein  43.72 
 
 
247 aa  201  9.999999999999999e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4851  ABC transporter related  41.7 
 
 
262 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782543  normal  0.109166 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1713  ABC transporter-like protein  44 
 
 
260 aa  199  3e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4037  ABC transporter related protein  44.94 
 
 
301 aa  199  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108203  normal  0.0177889 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4237  ABC transporter related  43.55 
 
 
271 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.413873  normal  0.20024 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1921  ABC-type sugar transport system ATPase component  44.76 
 
 
261 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2473  ABC transporter related protein  43.65 
 
 
258 aa  199  3.9999999999999996e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.200808  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1592  ABC transporter related  40.94 
 
 
265 aa  199  3.9999999999999996e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1033  ABC transporter related  43.32 
 
 
265 aa  199  3.9999999999999996e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5833  ABC transporter related  46.3 
 
 
243 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150147  normal  0.748971 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1998  ABC transporter ATP-binding protein  40.8 
 
 
248 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0341354  normal  0.212812 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6322  ABC transporter related  44.53 
 
 
273 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.645186  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1131  ABC transporter related  41.77 
 
 
261 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0806733 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (xylose)  46.15 
 
 
277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6849  ABC transporter related  43.6 
 
 
255 aa  197  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.603639  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5948  ABC transporter related  42.29 
 
 
313 aa  196  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3688  ABC sugar transporter, ATPase subunit  44.62 
 
 
261 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200201  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2273  ABC transporter-like protein  44.67 
 
 
257 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0986317 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2703  ABC transporter-related protein  40 
 
 
258 aa  196  5.000000000000001e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.787131  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2673  ABC transporter related protein  44.67 
 
 
261 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00128124  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2692  ABC transporter related protein  40.64 
 
 
264 aa  195  6e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0692  ABC transporter related  40.87 
 
 
271 aa  195  6e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1808  ABC transporter related  43.67 
 
 
294 aa  195  7e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.976965 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4494  ABC transporter related  44.31 
 
 
316 aa  195  7e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00159832  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1327  ABC sugar transporter, ATPase subunit  41.06 
 
 
278 aa  194  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2808  ABC transporter related  41.06 
 
 
288 aa  194  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.163546  normal  0.337543 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1210  ABC transporter related  44.4 
 
 
259 aa  194  1e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286528  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3423  ABC transporter related  45.16 
 
 
261 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111863  normal  0.794902 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1693  ABC transporter-like protein  41.02 
 
 
280 aa  194  1e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.564915 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3847  ABC transporter related  42.74 
 
 
271 aa  194  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0885  ABC transporter related  42.04 
 
 
245 aa  194  2e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0800857 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4592  ABC transporter related  44.72 
 
 
273 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117213  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1574  ABC transporter related  45.9 
 
 
261 aa  193  3e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.266375  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5186  ABC transporter related  47.95 
 
 
272 aa  193  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111705  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>