More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2770 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2770  ABC transporter related protein  100 
 
 		 271 aa  548  1e-155  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4535  ABC transporter related  85.93 
 
 		 274 aa  474  1e-133  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4052  ABC transporter related  68.25 
 
 		 282 aa  363  2e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.146234  normal  0.303462 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3600  ABC transporter related protein  69.44 
 
 		 289 aa  362  5.0000000000000005e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1360  ABC transporter related protein  67.19 
 
 		 269 aa  355  3.9999999999999996e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4009  ABC transporter-related protein  66.54 
 
 		 274 aa  353  2e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2607  ABC transporter related  65.04 
 
 		 274 aa  351  8e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0654  ABC transporter related protein  64.62 
 
 		 267 aa  349  3e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0832  ABC transporter related  64.59 
 
 		 305 aa  347  2e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0378548  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0115  ABC transporter related  64.68 
 
 		 315 aa  346  2e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6849  ABC transporter related  64.57 
 
 		 255 aa  332  4e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.603639  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2316  ABC transporter related  63.53 
 
 		 267 aa  330  1e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.573379  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2473  ABC transporter related protein  63.64 
 
 		 258 aa  330  2e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.200808  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1713  ABC transporter-like protein  61.39 
 
 		 260 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1808  ABC transporter related  63.37 
 
 		 294 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.976965 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4037  ABC transporter related protein  59.29 
 
 		 301 aa  310  1e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108203  normal  0.0177889 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4494  ABC transporter related  60.78 
 
 		 316 aa  303  2.0000000000000002e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00159832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2410  ABC transporter related  57.09 
 
 		 282 aa  299  4e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4851  ABC transporter related  56.75 
 
 		 262 aa  294  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782543  normal  0.109166 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1719  ABC transporter related  56.52 
 
 		 262 aa  291  8e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0707224  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2692  ABC transporter related protein  55.34 
 
 		 264 aa  288  7e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1339  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  55.34 
 
 		 259 aa  287  1e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1833  ABC transporter related  55.34 
 
 		 259 aa  287  1e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5293  ABC transporter related  53.16 
 
 		 266 aa  283  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0740635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1693  ABC transporter-like protein  55.34 
 
 		 280 aa  281  7.000000000000001e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.564915 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0058  ABC transporter related  53.17 
 
 		 266 aa  272  3e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1592  ABC transporter related  53.17 
 
 		 265 aa  271  1e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2408  ABC transporter-related protein  53.17 
 
 		 267 aa  268  8.999999999999999e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2646  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  53.97 
 
 		 266 aa  268  1e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112475  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0914  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  53.97 
 
 		 266 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144366  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1832  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  53.97 
 
 		 266 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.405866  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1445  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  53.97 
 
 		 266 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.59093  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0435  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  53.97 
 
 		 266 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125236  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1656  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  53.97 
 
 		 266 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1678  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  53.97 
 
 		 266 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0727  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  53.97 
 
 		 266 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455869  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1427  ABC transporter related  51.98 
 
 		 266 aa  261  1e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000710187  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1599  ABC transporter related  51.78 
 
 		 267 aa  260  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.664694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1327  ABC sugar transporter, ATPase subunit  51.38 
 
 		 278 aa  258  9e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2808  ABC transporter related  51.38 
 
 		 288 aa  258  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.163546  normal  0.337543 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3341  ABC transporter related  49.6 
 
 		 262 aa  246  2e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00439567  normal  0.282749 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1276  ABC transporter related  50 
 
 		 264 aa  245  6e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.233639  normal  0.257082 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5757  ABC transporter related  44.92 
 
 		 257 aa  205  8e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2415  ABC transporter related  42.96 
 
 		 273 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.133775  normal  0.475676 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0047  ABC transporter related  47.03 
 
 		 247 aa  199  3e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4284  ABC transporter related protein  41.41 
 
 		 260 aa  198  6e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1600  ABC transporter related  42.39 
 
 		 260 aa  199  6e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6092  ABC transporter related  43.27 
 
 		 253 aa  196  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1125  ABC transporter related protein  42.98 
 
 		 266 aa  196  3e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13168  normal  0.0632249 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0128  ABC transporter related  44.66 
 
 		 260 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1274  ABC transporter-like protein  43.62 
 
 		 244 aa  194  1e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.292913  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5342  ABC transporter  41.56 
 
 		 249 aa  194  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0127  ABC transporter related  44.18 
 
 		 265 aa  193  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5243  ABC transporter related  42.15 
 
 		 245 aa  193  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7504  normal  0.303485 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1364  ABC transporter related  43.8 
 
 		 278 aa  194  2e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.113543  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0104  ABC transporter related  42.86 
 
 		 260 aa  192  5e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394211  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3352  ABC transporter related  41.11 
 
 		 265 aa  192  5e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1921  ABC-type sugar transport system ATPase component  40.57 
 
 		 261 aa  192  6e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2601  ABC transporter related  40.41 
 
 		 258 aa  192  6e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3702  ABC sugar transporter, ATPase subunit  44.14 
 
 		 265 aa  192  7e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1574  ABC transporter related  44.08 
 
 		 261 aa  192  7e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.266375  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3437  ABC transporter related  44.14 
 
 		 265 aa  192  7e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.196667  normal  0.174425 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0988  ABC sugar transporter, ATPase subunit  44.96 
 
 		 258 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2648  ABC transporter related  44.96 
 
 		 258 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1375  ABC transporter related  41.34 
 
 		 257 aa  190  2e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.143315  normal  0.0808581 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3205  ABC transporter related  44.12 
 
 		 272 aa  190  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00011421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2813  ABC transporter related  43.64 
 
 		 276 aa  190  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2514  ABC transporter-like protein  42.69 
 
 		 284 aa  190  2e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.703565  normal  0.280675 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4592  ABC transporter related  42.73 
 
 		 273 aa  190  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1210  ABC transporter related  40.78 
 
 		 259 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286528  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4579  ABC transporter related  41.2 
 
 		 265 aa  189  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00500559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1187  ABC transporter related  43.82 
 
 		 264 aa  189  4e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.401309  normal  0.155677 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5969  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  41.9 
 
 		 268 aa  189  4e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.354097  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0183  ABC transporter related protein  40.71 
 
 		 285 aa  189  5e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2043  ABC transporter related  44.31 
 
 		 255 aa  189  5e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.332554  normal  0.307392 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0370  ABC transporter related  43.36 
 
 		 259 aa  189  5e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3969  ABC transporter related  40.4 
 
 		 254 aa  189  5.999999999999999e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0349444  normal  0.0435922 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3556  ABC transporter related protein  43.53 
 
 		 260 aa  187  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301945  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6740  ABC transporter related protein  41.22 
 
 		 254 aa  188  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6322  ABC transporter related  43.64 
 
 		 273 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.645186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (xylose)  41.63 
 
 		 277 aa  186  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0071  ABC transporter related  43.53 
 
 		 259 aa  186  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2671  ABC transporter related protein  42.04 
 
 		 269 aa  186  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000816223  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0538  ABC transporter related  43.56 
 
 		 274 aa  186  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.517887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0842  ABC transporter-related protein  38.18 
 
 		 271 aa  186  4e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0992  ABC transporter related  44.44 
 
 		 257 aa  186  4e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5339  ABC transporter related protein  41.06 
 
 		 278 aa  186  4e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0892  ABC sugar transporter, ATPase subunit  42.11 
 
 		 265 aa  186  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.68216 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1854  ABC transporter related  44.26 
 
 		 259 aa  186  4e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3594  ABC transporter related  41.53 
 
 		 266 aa  186  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0241  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  41.74 
 
 		 288 aa  186  5e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2852  ABC transporter related protein  41.46 
 
 		 265 aa  185  6e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.198198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0503  ABC transporter related  41.04 
 
 		 264 aa  185  6e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2673  ABC transporter related protein  41.7 
 
 		 261 aa  185  7e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00128124  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0236  ABC transporter related  43.7 
 
 		 258 aa  185  7e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.762191 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2377  ABC transporter related  45.18 
 
 		 252 aa  185  9e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2855  ABC transporter-related protein  40.62 
 
 		 274 aa  184  1.0000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0260  ABC transporter related  37.85 
 
 		 260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.469491  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0388  ribose import ATP-binding protein rbsA  42.16 
 
 		 261 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.956313 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24380  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  40.96 
 
 		 275 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.446861  normal  0.0741452 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>