More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2692 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2692  ABC transporter related protein  100 
 
 
264 aa  533  1e-150  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1719  ABC transporter related  67.45 
 
 
262 aa  373  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0707224  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1693  ABC transporter-like protein  66.27 
 
 
280 aa  360  9e-99  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.564915 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1833  ABC transporter related  63.78 
 
 
259 aa  348  5e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1339  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  63.78 
 
 
259 aa  348  6e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5293  ABC transporter related  61.18 
 
 
266 aa  340  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0740635  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1713  ABC transporter-like protein  64.57 
 
 
260 aa  340  1e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4851  ABC transporter related  60.55 
 
 
262 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782543  normal  0.109166 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2410  ABC transporter related  61.75 
 
 
282 aa  336  1.9999999999999998e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4037  ABC transporter related protein  64.03 
 
 
301 aa  333  2e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108203  normal  0.0177889 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1599  ABC transporter related  60.08 
 
 
267 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.664694  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1592  ABC transporter related  57.31 
 
 
265 aa  327  1.0000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4494  ABC transporter related  62.79 
 
 
316 aa  324  8.000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00159832  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2646  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  59.14 
 
 
266 aa  324  9e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112475  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0914  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  58.75 
 
 
266 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144366  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1832  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  58.75 
 
 
266 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.405866  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1445  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  58.75 
 
 
266 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.59093  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0435  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  58.75 
 
 
266 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125236  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1656  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  58.75 
 
 
266 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1678  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  58.75 
 
 
266 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0727  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  58.75 
 
 
266 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455869  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1327  ABC sugar transporter, ATPase subunit  57.71 
 
 
278 aa  317  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3341  ABC transporter related  56.97 
 
 
262 aa  316  2e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00439567  normal  0.282749 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0832  ABC transporter related  57.87 
 
 
305 aa  316  3e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0378548  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2808  ABC transporter related  57.71 
 
 
288 aa  316  3e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.163546  normal  0.337543 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0058  ABC transporter related  57.71 
 
 
266 aa  314  9.999999999999999e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2408  ABC transporter-related protein  56.69 
 
 
267 aa  312  2.9999999999999996e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6849  ABC transporter related  61.51 
 
 
255 aa  312  3.9999999999999997e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.603639  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0115  ABC transporter related  57.48 
 
 
315 aa  310  2e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1427  ABC transporter related  57.09 
 
 
266 aa  309  2.9999999999999997e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000710187  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1276  ABC transporter related  55.38 
 
 
264 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.233639  normal  0.257082 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1808  ABC transporter related  59.75 
 
 
294 aa  302  4.0000000000000003e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.976965 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2473  ABC transporter related protein  57.54 
 
 
258 aa  297  1e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.200808  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4052  ABC transporter related  55 
 
 
282 aa  291  8e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.146234  normal  0.303462 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2770  ABC transporter related protein  55.34 
 
 
271 aa  288  6e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4535  ABC transporter related  53.94 
 
 
274 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1360  ABC transporter related protein  54.94 
 
 
269 aa  280  1e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3600  ABC transporter related protein  54.98 
 
 
289 aa  279  3e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0654  ABC transporter related protein  51.76 
 
 
267 aa  267  1e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2607  ABC transporter related  52.19 
 
 
274 aa  267  1e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4009  ABC transporter-related protein  51.17 
 
 
274 aa  266  2e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2316  ABC transporter related  52.53 
 
 
267 aa  260  2e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.573379  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0047  ABC transporter related  51.65 
 
 
247 aa  244  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1210  ABC transporter related  46.53 
 
 
259 aa  225  7e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286528  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1600  ABC transporter related  46.12 
 
 
260 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2043  ABC transporter related  42.08 
 
 
255 aa  211  9e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.332554  normal  0.307392 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5342  ABC transporter  43.39 
 
 
249 aa  208  6e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1274  ABC transporter-like protein  46.31 
 
 
244 aa  208  8e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.292913  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5243  ABC transporter related  44.4 
 
 
245 aa  207  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7504  normal  0.303485 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4284  ABC transporter related protein  40.87 
 
 
260 aa  207  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3432  ABC transporter related  43.32 
 
 
256 aa  206  3e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.731931  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2703  ABC transporter-related protein  43.15 
 
 
258 aa  204  2e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.787131  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0892  ABC sugar transporter, ATPase subunit  44.4 
 
 
265 aa  201  8e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.68216 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0388  ribose import ATP-binding protein rbsA  43.03 
 
 
261 aa  201  9e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.956313 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0260  ABC transporter related  41.41 
 
 
260 aa  201  9e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.469491  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2514  ABC transporter-like protein  42.29 
 
 
284 aa  201  9.999999999999999e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.703565  normal  0.280675 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1574  ABC transporter related  43.27 
 
 
261 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.266375  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1375  ABC transporter related  42.34 
 
 
257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.143315  normal  0.0808581 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2415  ABC transporter related  43.53 
 
 
273 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.133775  normal  0.475676 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4579  ABC transporter related  44 
 
 
265 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00500559  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1461  ABC transporter related protein  47.6 
 
 
250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3594  ABC transporter related  44.53 
 
 
266 aa  199  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258671  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0071  ABC transporter related  45.15 
 
 
259 aa  199  3e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4187  ABC transporter related  42.34 
 
 
265 aa  199  5e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5969  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  42.86 
 
 
268 aa  197  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.354097  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2855  ABC transporter-related protein  41.86 
 
 
274 aa  197  1.0000000000000001e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5339  ABC transporter related protein  42.29 
 
 
278 aa  196  4.0000000000000005e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0503  ABC transporter related  42.23 
 
 
264 aa  196  4.0000000000000005e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0183  ABC transporter related protein  40.64 
 
 
285 aa  195  5.000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4592  ABC transporter related  43.42 
 
 
273 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117213  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0104  ABC transporter related  41.57 
 
 
260 aa  195  6e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394211  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0370  ABC transporter related  42.57 
 
 
259 aa  194  1e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5757  ABC transporter related  43.37 
 
 
257 aa  194  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0914  ABC transporter related  44.86 
 
 
240 aa  193  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0128  ABC transporter related  41.83 
 
 
260 aa  193  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0548  ABC transporter related  45.91 
 
 
266 aa  193  3e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3205  ABC transporter related  44.18 
 
 
272 aa  192  4e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00011421  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1125  ABC transporter related protein  41.3 
 
 
266 aa  192  4e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13168  normal  0.0632249 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0127  ABC transporter related  43.28 
 
 
265 aa  192  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2370  ABC sugar transporter, ATPase subunit  46.79 
 
 
518 aa  191  7e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4608  ABC transporter related  41.8 
 
 
519 aa  191  8e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2601  ABC transporter related  41.53 
 
 
258 aa  191  8e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3352  ABC transporter related  40.47 
 
 
265 aa  191  9e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2583  ABC transporter-like protein  48.58 
 
 
254 aa  191  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (xylose)  40.91 
 
 
277 aa  190  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0493  ABC transporter related  40.56 
 
 
254 aa  190  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0504196  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5833  ABC transporter related  43.05 
 
 
243 aa  190  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150147  normal  0.748971 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0692  ABC transporter related  42.8 
 
 
271 aa  189  2.9999999999999997e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1753  ABC transporter-like protein  41.49 
 
 
257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0987723  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1854  ABC transporter related  43.25 
 
 
259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  38.52 
 
 
504 aa  189  5.999999999999999e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0236  ABC transporter related  42.74 
 
 
258 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.762191 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3269  ABC transporter related  39.84 
 
 
247 aa  188  7e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.704412 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0988  ABC sugar transporter, ATPase subunit  42.68 
 
 
258 aa  188  8e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3969  ABC transporter related  40.64 
 
 
254 aa  188  8e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0349444  normal  0.0435922 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2648  ABC transporter related  42.68 
 
 
258 aa  188  8e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1921  ABC-type sugar transport system ATPase component  41.46 
 
 
261 aa  188  9e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6322  ABC transporter related  42.73 
 
 
273 aa  188  9e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.645186  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2607  ABC transporter related  44.07 
 
 
260 aa  188  9e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.143234  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1033  ABC transporter related  42.86 
 
 
265 aa  187  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>