More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4009 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_4009  ABC transporter-related protein  100 
 
 
274 aa  559  1e-158  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2607  ABC transporter related  94.14 
 
 
274 aa  531  1e-150  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3600  ABC transporter related protein  78.71 
 
 
289 aa  431  1e-120  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1360  ABC transporter related protein  81.03 
 
 
269 aa  425  1e-118  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2770  ABC transporter related protein  66.54 
 
 
271 aa  353  2e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4052  ABC transporter related  65.74 
 
 
282 aa  342  4e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.146234  normal  0.303462 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4535  ABC transporter related  66.8 
 
 
274 aa  338  4e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0654  ABC transporter related protein  65.48 
 
 
267 aa  336  2.9999999999999997e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2473  ABC transporter related protein  64.14 
 
 
258 aa  323  2e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.200808  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0832  ABC transporter related  65.61 
 
 
305 aa  323  2e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0378548  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0115  ABC transporter related  63.53 
 
 
315 aa  316  2e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1713  ABC transporter-like protein  60.47 
 
 
260 aa  314  9e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2316  ABC transporter related  61.26 
 
 
267 aa  314  9.999999999999999e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.573379  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6849  ABC transporter related  60.16 
 
 
255 aa  303  2.0000000000000002e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.603639  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4037  ABC transporter related protein  59.76 
 
 
301 aa  300  1e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108203  normal  0.0177889 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1808  ABC transporter related  63.49 
 
 
294 aa  300  2e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.976965 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1693  ABC transporter-like protein  58.73 
 
 
280 aa  297  1e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.564915 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4494  ABC transporter related  58.17 
 
 
316 aa  286  2.9999999999999996e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00159832  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1719  ABC transporter related  54.76 
 
 
262 aa  275  6e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0707224  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4851  ABC transporter related  53.54 
 
 
262 aa  275  8e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782543  normal  0.109166 
 
 
-
 
NC_004310  BR1339  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  53.57 
 
 
259 aa  271  1e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2646  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  54.9 
 
 
266 aa  270  1e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112475  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2410  ABC transporter related  53.57 
 
 
282 aa  271  1e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1327  ABC sugar transporter, ATPase subunit  52.01 
 
 
278 aa  270  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0914  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  54.51 
 
 
266 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144366  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1832  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  54.51 
 
 
266 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.405866  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2808  ABC transporter related  53.73 
 
 
288 aa  267  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.163546  normal  0.337543 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1445  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  54.51 
 
 
266 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.59093  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0435  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  54.51 
 
 
266 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125236  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1656  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  54.51 
 
 
266 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1678  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  54.51 
 
 
266 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0727  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  54.51 
 
 
266 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455869  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2692  ABC transporter related protein  51.17 
 
 
264 aa  266  2e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1833  ABC transporter related  53.17 
 
 
259 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1599  ABC transporter related  53.12 
 
 
267 aa  263  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.664694  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5293  ABC transporter related  50.57 
 
 
266 aa  261  6.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0740635  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1592  ABC transporter related  51.39 
 
 
265 aa  258  9e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2408  ABC transporter-related protein  51.19 
 
 
267 aa  253  2.0000000000000002e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0058  ABC transporter related  49.21 
 
 
266 aa  246  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3341  ABC transporter related  50.4 
 
 
262 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00439567  normal  0.282749 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1427  ABC transporter related  47.71 
 
 
266 aa  241  9e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000710187  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1276  ABC transporter related  47.64 
 
 
264 aa  237  2e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.233639  normal  0.257082 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4592  ABC transporter related  45.33 
 
 
273 aa  201  8e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117213  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0047  ABC transporter related  46.25 
 
 
247 aa  201  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6322  ABC transporter related  42.21 
 
 
273 aa  199  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.645186  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (xylose)  44.68 
 
 
277 aa  197  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0548  ABC transporter related  40.76 
 
 
266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3702  ABC sugar transporter, ATPase subunit  45.25 
 
 
265 aa  196  3e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3437  ABC transporter related  45.25 
 
 
265 aa  196  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.196667  normal  0.174425 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5342  ABC transporter  41.77 
 
 
249 aa  194  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1364  ABC transporter related  44.02 
 
 
278 aa  194  1e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.113543  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0260  ABC transporter related  39.44 
 
 
260 aa  193  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.469491  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2043  ABC transporter related  41.57 
 
 
255 aa  193  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.332554  normal  0.307392 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5243  ABC transporter related  43.1 
 
 
245 aa  192  6e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7504  normal  0.303485 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1210  ABC transporter related  41.22 
 
 
259 aa  192  7e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286528  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6092  ABC transporter related  41.8 
 
 
253 aa  190  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2703  ABC transporter-related protein  41.6 
 
 
258 aa  189  2.9999999999999997e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.787131  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2813  ABC transporter related  40.96 
 
 
276 aa  189  4e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1972  ABC transporter related  41.49 
 
 
269 aa  188  1e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1921  ABC-type sugar transport system ATPase component  40 
 
 
261 aa  186  4e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0241  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.48 
 
 
288 aa  186  4e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2600  ABC transporter related  42.06 
 
 
257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0493  ABC transporter related  41.74 
 
 
254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0504196  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2601  ABC transporter related  38.22 
 
 
258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1274  ABC transporter-like protein  40.91 
 
 
244 aa  184  1.0000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.292913  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5833  ABC transporter related  41.59 
 
 
243 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150147  normal  0.748971 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4211  ABC transporter related protein  38.13 
 
 
276 aa  184  2.0000000000000003e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6227  ABC transporter related  39.53 
 
 
256 aa  183  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6694  ABC transporter related  41.18 
 
 
262 aa  183  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.356782  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2852  ABC transporter related protein  40.25 
 
 
265 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.198198  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0071  ABC transporter related  43.56 
 
 
259 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2415  ABC transporter related  41.32 
 
 
273 aa  182  6e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.133775  normal  0.475676 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4993  ABC transporter related protein  40.5 
 
 
283 aa  181  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356987  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4187  ABC transporter related  39.68 
 
 
265 aa  181  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3352  ABC transporter related  37.65 
 
 
265 aa  179  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0183  ABC transporter related protein  38.87 
 
 
285 aa  179  4e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3269  ABC transporter related  41.1 
 
 
247 aa  179  4e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.704412 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4579  ABC transporter related  38.13 
 
 
265 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00500559  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5757  ABC transporter related  39.37 
 
 
257 aa  179  5.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1461  ABC transporter related protein  43.95 
 
 
250 aa  179  5.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0266  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  40.08 
 
 
286 aa  178  8e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.079938  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1600  ABC transporter related  39.44 
 
 
260 aa  178  8e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1148  ABC transporter related  42.13 
 
 
264 aa  178  9e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4284  ABC transporter related protein  39.68 
 
 
260 aa  178  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1504  ABC transporter related  41.91 
 
 
257 aa  178  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0988  ABC sugar transporter, ATPase subunit  41.81 
 
 
258 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0892  ABC sugar transporter, ATPase subunit  37.74 
 
 
265 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.68216 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0992  ABC transporter related  40.32 
 
 
257 aa  177  2e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1753  ABC transporter-like protein  38.89 
 
 
257 aa  176  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0987723  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2648  ABC transporter related  41.81 
 
 
258 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0503  ABC transporter related  39.18 
 
 
264 aa  176  3e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3594  ABC transporter related  38.37 
 
 
266 aa  176  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258671  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2583  ABC transporter-like protein  41.6 
 
 
254 aa  176  4e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2617  ABC transporter related  40 
 
 
260 aa  176  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2607  ABC transporter related  41.95 
 
 
260 aa  175  6e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.143234  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5969  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  39.44 
 
 
268 aa  175  7e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.354097  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5339  ABC transporter related protein  39.34 
 
 
278 aa  175  9e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6740  ABC transporter related protein  38.43 
 
 
254 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0236  ABC transporter related  42.24 
 
 
258 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.762191 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0127  ABC transporter related  42.22 
 
 
265 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.926966 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>