More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6849 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6849  ABC transporter related  100 
 
 		 255 aa  504  9.999999999999999e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.603639  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0115  ABC transporter related  68.92 
 
 		 315 aa  357  8e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1713  ABC transporter-like protein  70.92 
 
 		 260 aa  354  5.999999999999999e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0832  ABC transporter related  68.13 
 
 		 305 aa  352  2e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0378548  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2473  ABC transporter related protein  70.08 
 
 		 258 aa  346  2e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.200808  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4037  ABC transporter related protein  69.72 
 
 		 301 aa  343  2e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108203  normal  0.0177889 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2770  ABC transporter related protein  64.57 
 
 		 271 aa  332  3e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1808  ABC transporter related  67.93 
 
 		 294 aa  330  1e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.976965 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4494  ABC transporter related  68.11 
 
 		 316 aa  327  2.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00159832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4535  ABC transporter related  64.06 
 
 		 274 aa  326  2.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3600  ABC transporter related protein  65.06 
 
 		 289 aa  325  3e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4052  ABC transporter related  62.15 
 
 		 282 aa  313  9.999999999999999e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.146234  normal  0.303462 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1360  ABC transporter related protein  63.2 
 
 		 269 aa  313  1.9999999999999998e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2692  ABC transporter related protein  61.51 
 
 		 264 aa  312  3.9999999999999997e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1719  ABC transporter related  61.57 
 
 		 262 aa  310  1e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0707224  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2607  ABC transporter related  61.96 
 
 		 274 aa  310  2e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1339  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  61.18 
 
 		 259 aa  306  3e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0654  ABC transporter related protein  61.66 
 
 		 267 aa  303  1.0000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1833  ABC transporter related  60.39 
 
 		 259 aa  303  1.0000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4009  ABC transporter-related protein  60.16 
 
 		 274 aa  303  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5293  ABC transporter related  60.63 
 
 		 266 aa  299  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0740635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4851  ABC transporter related  58.27 
 
 		 262 aa  296  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782543  normal  0.109166 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1693  ABC transporter-like protein  57.87 
 
 		 280 aa  290  1e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.564915 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2646  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  55.91 
 
 		 266 aa  290  1e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112475  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1327  ABC sugar transporter, ATPase subunit  54.72 
 
 		 278 aa  289  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2808  ABC transporter related  54.72 
 
 		 288 aa  289  3e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.163546  normal  0.337543 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1599  ABC transporter related  55.12 
 
 		 267 aa  288  4e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.664694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1592  ABC transporter related  56.64 
 
 		 265 aa  288  8e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0914  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  55.91 
 
 		 266 aa  285  4e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144366  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1832  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  55.91 
 
 		 266 aa  285  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.405866  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1445  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  55.91 
 
 		 266 aa  285  4e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.59093  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0435  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  55.91 
 
 		 266 aa  285  4e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125236  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1656  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  55.91 
 
 		 266 aa  285  4e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1678  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  55.91 
 
 		 266 aa  285  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0727  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  55.91 
 
 		 266 aa  285  4e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455869  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2410  ABC transporter related  58.04 
 
 		 282 aa  283  2.0000000000000002e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2316  ABC transporter related  58.5 
 
 		 267 aa  281  1e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.573379  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0058  ABC transporter related  55.51 
 
 		 266 aa  269  2.9999999999999997e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1427  ABC transporter related  55.78 
 
 		 266 aa  268  8e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000710187  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2408  ABC transporter-related protein  55.51 
 
 		 267 aa  266  2.9999999999999995e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1276  ABC transporter related  53.54 
 
 		 264 aa  260  1e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.233639  normal  0.257082 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3341  ABC transporter related  54.33 
 
 		 262 aa  259  4e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00439567  normal  0.282749 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0047  ABC transporter related  51.48 
 
 		 247 aa  210  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1574  ABC transporter related  46.64 
 
 		 261 aa  204  1e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.266375  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2671  ABC transporter related protein  46.89 
 
 		 269 aa  204  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000816223  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6740  ABC transporter related protein  45.23 
 
 		 254 aa  202  6e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1125  ABC transporter related protein  45.23 
 
 		 266 aa  201  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13168  normal  0.0632249 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0183  ABC transporter related protein  43.6 
 
 		 285 aa  197  2.0000000000000003e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2673  ABC transporter related protein  45 
 
 		 261 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00128124  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3352  ABC transporter related  43.08 
 
 		 265 aa  196  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3594  ABC transporter related  44.35 
 
 		 266 aa  195  6e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1187  ABC transporter related  45.61 
 
 		 264 aa  195  7e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.401309  normal  0.155677 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4237  ABC transporter related  44.58 
 
 		 271 aa  193  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.413873  normal  0.20024 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5342  ABC transporter  41.74 
 
 		 249 aa  193  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1600  ABC transporter related  44.44 
 
 		 260 aa  193  3e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6227  ABC transporter related  44.83 
 
 		 256 aa  191  7e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4284  ABC transporter related protein  44.53 
 
 		 260 aa  191  9e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2601  ABC transporter related  44.73 
 
 		 258 aa  191  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2273  ABC transporter-like protein  43.7 
 
 		 257 aa  191  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0986317 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1274  ABC transporter-like protein  45.27 
 
 		 244 aa  191  1e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.292913  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5757  ABC transporter related  44.71 
 
 		 257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0548  ABC transporter related  43.2 
 
 		 266 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2043  ABC transporter related  45.93 
 
 		 255 aa  189  5e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.332554  normal  0.307392 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3847  ABC transporter related  44.17 
 
 		 271 aa  189  5e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1461  ABC transporter related protein  48.66 
 
 		 250 aa  188  7e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6092  ABC transporter related  44.63 
 
 		 253 aa  188  9e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5347  ABC transporter related  41.67 
 
 		 261 aa  188  9e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2855  ABC transporter-related protein  43.02 
 
 		 274 aa  187  1e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2703  ABC transporter-related protein  43.57 
 
 		 258 aa  186  2e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.787131  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1364  ABC transporter related  44.44 
 
 		 278 aa  187  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.113543  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4579  ABC transporter related  42.68 
 
 		 265 aa  186  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00500559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0892  ABC sugar transporter, ATPase subunit  44.72 
 
 		 265 aa  186  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.68216 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3969  ABC transporter related  42.23 
 
 		 254 aa  186  3e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0349444  normal  0.0435922 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3432  ABC transporter related  43.64 
 
 		 256 aa  186  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.731931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1921  ABC-type sugar transport system ATPase component  42.68 
 
 		 261 aa  185  5e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4592  ABC transporter related  47.03 
 
 		 273 aa  185  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5292  ABC transporter-related protein  42.44 
 
 		 260 aa  185  6e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.688621  normal  0.0485107 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0071  ABC transporter related  45.34 
 
 		 259 aa  185  7e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4211  ABC transporter related protein  42.29 
 
 		 276 aa  184  1.0000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5833  ABC transporter related  42.19 
 
 		 243 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150147  normal  0.748971 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6694  ABC transporter related  43.57 
 
 		 262 aa  183  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.356782  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2415  ABC transporter related  43.82 
 
 		 273 aa  183  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.133775  normal  0.475676 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6322  ABC transporter related  46.12 
 
 		 273 aa  183  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.645186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2605  ABC transporter related  42.69 
 
 		 263 aa  182  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.120025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0988  ABC sugar transporter, ATPase subunit  43.15 
 
 		 258 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3556  ABC transporter related protein  42.75 
 
 		 260 aa  182  4.0000000000000006e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301945  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0128  ABC transporter related  43.09 
 
 		 260 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2514  ABC transporter-like protein  42.29 
 
 		 284 aa  182  4.0000000000000006e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.703565  normal  0.280675 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2648  ABC transporter related  43.15 
 
 		 258 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1504  ABC transporter related  43.33 
 
 		 257 aa  182  5.0000000000000004e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0538  ABC transporter related  43.31 
 
 		 274 aa  182  5.0000000000000004e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.517887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0127  ABC transporter related  42.68 
 
 		 265 aa  182  6e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2852  ABC transporter related protein  43.62 
 
 		 265 aa  181  7e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.198198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3205  ABC transporter related  44.44 
 
 		 272 aa  181  9.000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00011421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3112  ABC transporter related  41.67 
 
 		 261 aa  181  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.856974  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5243  ABC transporter related  40.68 
 
 		 245 aa  180  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7504  normal  0.303485 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2377  ABC transporter related  46.4 
 
 		 252 aa  180  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2583  ABC transporter-like protein  46.55 
 
 		 254 aa  179  4e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2994  ABC transporter related  44.4 
 
 		 263 aa  179  4e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2813  ABC transporter related  45.37 
 
 		 276 aa  179  4.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>