More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1360 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1360  ABC transporter related protein  100 
 
 		 269 aa  551  1e-156  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3600  ABC transporter related protein  87.65 
 
 		 289 aa  456  1e-127  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2607  ABC transporter related  78.15 
 
 		 274 aa  430  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4009  ABC transporter-related protein  81.03 
 
 		 274 aa  425  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2770  ABC transporter related protein  67.19 
 
 		 271 aa  355  3.9999999999999996e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4052  ABC transporter related  64.62 
 
 		 282 aa  353  2e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.146234  normal  0.303462 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4535  ABC transporter related  67.45 
 
 		 274 aa  346  3e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0832  ABC transporter related  65.88 
 
 		 305 aa  334  9e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0378548  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2473  ABC transporter related protein  65.74 
 
 		 258 aa  332  3e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.200808  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0654  ABC transporter related protein  65.08 
 
 		 267 aa  332  3e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1713  ABC transporter-like protein  63.35 
 
 		 260 aa  330  2e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0115  ABC transporter related  61.34 
 
 		 315 aa  325  5e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2316  ABC transporter related  60.78 
 
 		 267 aa  316  2e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.573379  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4037  ABC transporter related protein  61.26 
 
 		 301 aa  315  7e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108203  normal  0.0177889 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6849  ABC transporter related  63.2 
 
 		 255 aa  313  1.9999999999999998e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.603639  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1808  ABC transporter related  65 
 
 		 294 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.976965 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4494  ABC transporter related  62.06 
 
 		 316 aa  301  9e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00159832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1719  ABC transporter related  57.94 
 
 		 262 aa  296  3e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0707224  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2410  ABC transporter related  56.25 
 
 		 282 aa  292  3e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1693  ABC transporter-like protein  55.95 
 
 		 280 aa  291  8e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.564915 
 
 
-
 
NC_004310  BR1339  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  55.95 
 
 		 259 aa  289  3e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4851  ABC transporter related  54.76 
 
 		 262 aa  289  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782543  normal  0.109166 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1833  ABC transporter related  55.16 
 
 		 259 aa  285  5e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2808  ABC transporter related  55.56 
 
 		 288 aa  281  5.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.163546  normal  0.337543 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1327  ABC sugar transporter, ATPase subunit  55.56 
 
 		 278 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2646  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  55.95 
 
 		 266 aa  280  2e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112475  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2692  ABC transporter related protein  54.94 
 
 		 264 aa  280  2e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5293  ABC transporter related  53.57 
 
 		 266 aa  278  9e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0740635  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0914  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  55.56 
 
 		 266 aa  276  2e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144366  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1832  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  55.56 
 
 		 266 aa  276  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.405866  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1445  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  55.56 
 
 		 266 aa  276  2e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.59093  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0435  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  55.56 
 
 		 266 aa  276  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125236  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1656  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  55.56 
 
 		 266 aa  276  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1678  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  55.56 
 
 		 266 aa  276  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0727  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  55.56 
 
 		 266 aa  276  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455869  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1599  ABC transporter related  54.37 
 
 		 267 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.664694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2408  ABC transporter-related protein  54.15 
 
 		 267 aa  267  1e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1592  ABC transporter related  50.59 
 
 		 265 aa  264  1e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0058  ABC transporter related  50.97 
 
 		 266 aa  262  4e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1276  ABC transporter related  50 
 
 		 264 aa  250  2e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.233639  normal  0.257082 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1427  ABC transporter related  50 
 
 		 266 aa  248  5e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000710187  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3341  ABC transporter related  49.6 
 
 		 262 aa  242  5e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00439567  normal  0.282749 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0047  ABC transporter related  46.84 
 
 		 247 aa  207  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5342  ABC transporter  44.07 
 
 		 249 aa  202  6e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4284  ABC transporter related protein  44.4 
 
 		 260 aa  199  5e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1461  ABC transporter related protein  48.23 
 
 		 250 aa  197  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3437  ABC transporter related  42.53 
 
 		 265 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.196667  normal  0.174425 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3702  ABC sugar transporter, ATPase subunit  42.53 
 
 		 265 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2601  ABC transporter related  42.39 
 
 		 258 aa  194  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1921  ABC-type sugar transport system ATPase component  42.08 
 
 		 261 aa  193  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6322  ABC transporter related  44.89 
 
 		 273 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.645186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0260  ABC transporter related  39.38 
 
 		 260 aa  193  3e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.469491  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (xylose)  44.26 
 
 		 277 aa  192  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4592  ABC transporter related  46.36 
 
 		 273 aa  192  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117213  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0183  ABC transporter related protein  42.11 
 
 		 285 aa  190  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3352  ABC transporter related  41.18 
 
 		 265 aa  190  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6092  ABC transporter related  42.04 
 
 		 253 aa  189  2.9999999999999997e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2703  ABC transporter-related protein  42.31 
 
 		 258 aa  190  2.9999999999999997e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.787131  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6694  ABC transporter related  42.56 
 
 		 262 aa  189  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.356782  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2043  ABC transporter related  43.09 
 
 		 255 aa  189  4e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.332554  normal  0.307392 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0345  ABC transporter related  40.73 
 
 		 271 aa  189  4e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5833  ABC transporter related  42.8 
 
 		 243 aa  189  5e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150147  normal  0.748971 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1972  ABC transporter related  40.91 
 
 		 269 aa  188  7e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0493  ABC transporter related  44.89 
 
 		 254 aa  188  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0504196  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1364  ABC transporter related  46.67 
 
 		 278 aa  188  9e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.113543  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0548  ABC transporter related  39.26 
 
 		 266 aa  187  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5757  ABC transporter related  40.16 
 
 		 257 aa  187  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1274  ABC transporter-like protein  42.56 
 
 		 244 aa  187  1e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.292913  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6227  ABC transporter related  44.39 
 
 		 256 aa  186  5e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2813  ABC transporter related  43.33 
 
 		 276 aa  185  6e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2852  ABC transporter related protein  42.08 
 
 		 265 aa  185  6e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.198198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0892  ABC sugar transporter, ATPase subunit  40.16 
 
 		 265 aa  185  7e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.68216 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5339  ABC transporter related protein  41.8 
 
 		 278 aa  184  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2583  ABC transporter-like protein  43.09 
 
 		 254 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0842  ABC transporter-related protein  38.1 
 
 		 271 aa  183  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2671  ABC transporter related protein  41.91 
 
 		 269 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000816223  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6740  ABC transporter related protein  41.08 
 
 		 254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2855  ABC transporter-related protein  41.41 
 
 		 274 aa  184  2.0000000000000003e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1504  ABC transporter related  41.49 
 
 		 257 aa  184  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2415  ABC transporter related  41.73 
 
 		 273 aa  183  3e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.133775  normal  0.475676 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4211  ABC transporter related protein  39.83 
 
 		 276 aa  182  4.0000000000000006e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1600  ABC transporter related  44.64 
 
 		 260 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0538  ABC transporter related  41.73 
 
 		 274 aa  182  6e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.517887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5347  ABC transporter related  38.93 
 
 		 261 aa  182  6e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4579  ABC transporter related  39.36 
 
 		 265 aa  182  7e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00500559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3112  ABC transporter related  38.72 
 
 		 261 aa  181  8.000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.856974  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2377  ABC transporter related  44.8 
 
 		 252 aa  181  9.000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1998  ABC transporter ATP-binding protein  41.28 
 
 		 248 aa  181  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0341354  normal  0.212812 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1187  ABC transporter related  40.89 
 
 		 264 aa  180  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.401309  normal  0.155677 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3556  ABC transporter related protein  41.06 
 
 		 260 aa  180  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301945  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1210  ABC transporter related  41.03 
 
 		 259 aa  180  2e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286528  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1148  ABC transporter related  41.15 
 
 		 264 aa  180  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2617  ABC transporter related  41.28 
 
 		 260 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2994  ABC transporter related  44.69 
 
 		 263 aa  180  2.9999999999999997e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4339  ABC transporter related  40.44 
 
 		 263 aa  180  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2600  ABC transporter related  40.43 
 
 		 257 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1125  ABC transporter related protein  40.66 
 
 		 266 aa  179  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13168  normal  0.0632249 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5243  ABC transporter related  36.82 
 
 		 245 aa  179  4e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7504  normal  0.303485 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7024  ABC transporter related  43.88 
 
 		 275 aa  179  5.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0241  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.24 
 
 		 288 aa  179  5.999999999999999e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>