More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7024 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_7024  ABC transporter related  100 
 
 
275 aa  551  1e-156  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2855  ABC transporter-related protein  74.59 
 
 
274 aa  369  1e-101  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3352  ABC transporter related  70.82 
 
 
265 aa  362  4e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0183  ABC transporter related protein  69.14 
 
 
285 aa  358  4e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2514  ABC transporter-like protein  69.57 
 
 
284 aa  354  1e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.703565  normal  0.280675 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3128  ABC transporter related protein  74.9 
 
 
275 aa  354  1e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404447  hitchhiker  0.00266425 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3556  ABC transporter related protein  72.13 
 
 
260 aa  350  1e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301945  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3205  ABC transporter related  69.85 
 
 
272 aa  347  9e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00011421  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3594  ABC transporter related  68.42 
 
 
266 aa  347  9e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258671  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0892  ABC sugar transporter, ATPase subunit  70.9 
 
 
265 aa  345  3e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.68216 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3623  ABC transporter related protein  74.38 
 
 
266 aa  345  4e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4579  ABC transporter related  68.85 
 
 
265 aa  341  8e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00500559  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2605  ABC transporter related  70.04 
 
 
263 aa  337  9.999999999999999e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.120025  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5757  ABC transporter related  69.8 
 
 
257 aa  331  7.000000000000001e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0071  ABC transporter related  66.12 
 
 
259 aa  331  8e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4187  ABC transporter related  64.52 
 
 
265 aa  330  2e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2223  ABC transporter-related protein  68.83 
 
 
263 aa  329  2e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0935635 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0503  ABC transporter related  65.31 
 
 
264 aa  329  2e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1901  ABC transporter related  69.35 
 
 
265 aa  326  2.0000000000000001e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0159617  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2415  ABC transporter related  63.49 
 
 
273 aa  324  8.000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.133775  normal  0.475676 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5969  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  62.11 
 
 
268 aa  321  8e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.354097  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0988  ABC sugar transporter, ATPase subunit  63.56 
 
 
258 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0127  ABC transporter related  64.37 
 
 
265 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2648  ABC transporter related  63.56 
 
 
258 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0128  ABC transporter related  63.6 
 
 
260 aa  319  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1375  ABC transporter related  61.13 
 
 
257 aa  319  3e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.143315  normal  0.0808581 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0538  ABC transporter related  66.79 
 
 
274 aa  318  6e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.517887  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0104  ABC transporter related  62.86 
 
 
260 aa  318  6e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394211  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0370  ABC transporter related  62.04 
 
 
259 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0236  ABC transporter related  61.94 
 
 
258 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.762191 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0388  ribose import ATP-binding protein rbsA  61.22 
 
 
261 aa  310  2e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.956313 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2607  ABC transporter related  63.16 
 
 
260 aa  309  2.9999999999999997e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.143234  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0717  ABC transporter related  63.56 
 
 
257 aa  291  9e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.393334  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2601  ABC transporter related  54.44 
 
 
258 aa  275  7e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6092  ABC transporter related  56.56 
 
 
253 aa  267  2e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3969  ABC transporter related  55.33 
 
 
254 aa  263  2e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0349444  normal  0.0435922 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0345  ABC transporter related  52.19 
 
 
271 aa  257  1e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1600  ABC transporter related  52.26 
 
 
260 aa  256  2e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4339  ABC transporter related  48.16 
 
 
263 aa  235  6e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0260  ABC transporter related  50 
 
 
260 aa  235  7e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.469491  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1187  ABC transporter related  50.97 
 
 
264 aa  234  2.0000000000000002e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.401309  normal  0.155677 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0493  ABC transporter related  49.59 
 
 
254 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0504196  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5339  ABC transporter related protein  45.16 
 
 
278 aa  226  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1461  ABC transporter related protein  49.79 
 
 
250 aa  225  5.0000000000000005e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4284  ABC transporter related protein  48.19 
 
 
260 aa  225  7e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6694  ABC transporter related  48.98 
 
 
262 aa  224  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.356782  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5948  ABC transporter related  47.19 
 
 
313 aa  224  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5292  ABC transporter-related protein  46.69 
 
 
260 aa  223  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.688621  normal  0.0485107 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1131  ABC transporter related  47.08 
 
 
261 aa  223  3e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0806733 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1274  ABC transporter-like protein  48.98 
 
 
244 aa  222  4e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.292913  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1504  ABC transporter related  49.39 
 
 
257 aa  222  6e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6740  ABC transporter related protein  48.18 
 
 
254 aa  221  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4237  ABC transporter related  48.18 
 
 
271 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.413873  normal  0.20024 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4211  ABC transporter related protein  44.98 
 
 
276 aa  219  3.9999999999999997e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5342  ABC transporter  45.93 
 
 
249 aa  218  6e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3847  ABC transporter related  48.19 
 
 
271 aa  216  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1972  ABC transporter related  47.41 
 
 
269 aa  217  2e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1574  ABC transporter related  49.61 
 
 
261 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.266375  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2673  ABC transporter related protein  48.24 
 
 
261 aa  216  4e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00128124  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1921  ABC-type sugar transport system ATPase component  47.95 
 
 
261 aa  215  5.9999999999999996e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0037  ABC transporter related protein  47.39 
 
 
247 aa  215  5.9999999999999996e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1125  ABC transporter related protein  46.96 
 
 
266 aa  213  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13168  normal  0.0632249 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4592  ABC transporter related  45.24 
 
 
273 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117213  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6322  ABC transporter related  45.75 
 
 
273 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.645186  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1210  ABC transporter related  48.44 
 
 
259 aa  212  5.999999999999999e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286528  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2703  ABC transporter-related protein  45.04 
 
 
258 aa  211  7e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.787131  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2852  ABC transporter related protein  48.16 
 
 
265 aa  210  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.198198  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24380  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  47.77 
 
 
275 aa  210  3e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.446861  normal  0.0741452 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1364  ABC transporter related  47.54 
 
 
278 aa  210  3e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.113543  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2671  ABC transporter related protein  47.74 
 
 
269 aa  209  5e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000816223  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2943  ABC transporter related  44.84 
 
 
247 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3269  ABC transporter related  43.62 
 
 
247 aa  208  1e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.704412 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4929  ABC transporter related  46.03 
 
 
246 aa  207  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.663119 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2377  ABC transporter related  45.63 
 
 
252 aa  207  1e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2273  ABC transporter-like protein  48.18 
 
 
257 aa  207  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0986317 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3425  ABC transporter related  44.58 
 
 
246 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4993  ABC transporter related protein  45.23 
 
 
283 aa  206  4e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356987  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3112  ABC transporter related  42.35 
 
 
261 aa  204  1e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.856974  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1719  ABC transporter related  43.44 
 
 
262 aa  203  2e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0707224  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2410  ABC transporter related  40.96 
 
 
282 aa  202  4e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5186  ABC transporter related  49.8 
 
 
272 aa  202  4e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111705  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0241  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.15 
 
 
288 aa  202  4e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5347  ABC transporter related  44.79 
 
 
261 aa  202  5e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2813  ABC transporter related  45.75 
 
 
276 aa  201  8e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3702  ABC sugar transporter, ATPase subunit  44.94 
 
 
265 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2583  ABC transporter-like protein  47.23 
 
 
254 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3437  ABC transporter related  44.94 
 
 
265 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.196667  normal  0.174425 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (xylose)  44.9 
 
 
277 aa  199  3e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1693  ABC transporter-like protein  44.67 
 
 
280 aa  199  3.9999999999999996e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.564915 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1327  ABC sugar transporter, ATPase subunit  39.22 
 
 
278 aa  199  5e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2473  ABC transporter related protein  45.93 
 
 
258 aa  199  5e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.200808  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0992  ABC transporter related  45.68 
 
 
257 aa  199  6e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2808  ABC transporter related  40.08 
 
 
288 aa  198  7e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.163546  normal  0.337543 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0266  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  45.75 
 
 
286 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.079938  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0692  ABC transporter related  40.56 
 
 
271 aa  197  2.0000000000000003e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1210  ABC transporter  44.31 
 
 
261 aa  197  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.986169  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1339  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.44 
 
 
259 aa  196  3e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0885  ABC transporter related  42.39 
 
 
245 aa  196  3e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0800857 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2617  ABC transporter related  47.87 
 
 
260 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2511  ABC transporter related protein  43.72 
 
 
276 aa  195  6e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>