More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3425 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3425  ABC transporter related  100 
 
 		 246 aa  495  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2943  ABC transporter related  91.06 
 
 		 247 aa  457  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4929  ABC transporter related  87.4 
 
 		 246 aa  434  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.663119 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2715  sugar (ribose) ABC transporter ATP-binding protein  66.94 
 
 		 261 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0375081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4339  ABC transporter related  47.97 
 
 		 263 aa  234  7e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4211  ABC transporter related protein  48.37 
 
 		 276 aa  226  3e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1921  ABC-type sugar transport system ATPase component  49.59 
 
 		 261 aa  225  6e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6092  ABC transporter related  47.18 
 
 		 253 aa  222  4e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4592  ABC transporter related  50.21 
 
 		 273 aa  219  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117213  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0037  ABC transporter related protein  46.77 
 
 		 247 aa  219  3e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5339  ABC transporter related protein  47.35 
 
 		 278 aa  219  3e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0260  ABC transporter related  47.98 
 
 		 260 aa  218  8.999999999999998e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.469491  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0692  ABC transporter related  45.71 
 
 		 271 aa  214  8e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5342  ABC transporter  44.4 
 
 		 249 aa  214  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (xylose)  47.54 
 
 		 277 aa  214  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3702  ABC sugar transporter, ATPase subunit  48.36 
 
 		 265 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2813  ABC transporter related  48.96 
 
 		 276 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3437  ABC transporter related  48.36 
 
 		 265 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.196667  normal  0.174425 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0241  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.97 
 
 		 288 aa  211  5.999999999999999e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1274  ABC transporter-like protein  43.33 
 
 		 244 aa  211  7.999999999999999e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.292913  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6322  ABC transporter related  48.13 
 
 		 273 aa  210  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.645186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6740  ABC transporter related protein  46.67 
 
 		 254 aa  209  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4237  ABC transporter related  46.25 
 
 		 271 aa  208  8e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.413873  normal  0.20024 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0266  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  48.97 
 
 		 286 aa  207  1e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.079938  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2852  ABC transporter related protein  47.35 
 
 		 265 aa  207  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.198198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1125  ABC transporter related protein  45.42 
 
 		 266 aa  207  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13168  normal  0.0632249 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3847  ABC transporter related  45.83 
 
 		 271 aa  207  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1131  ABC transporter related  46.67 
 
 		 261 aa  206  3e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0806733 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5948  ABC transporter related  46.25 
 
 		 313 aa  205  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6694  ABC transporter related  46.5 
 
 		 262 aa  205  6e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.356782  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2671  ABC transporter related protein  47.74 
 
 		 269 aa  205  7e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000816223  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3969  ABC transporter related  45.93 
 
 		 254 aa  204  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0349444  normal  0.0435922 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0345  ABC transporter related  43.95 
 
 		 271 aa  203  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0493  ABC transporter related  44.67 
 
 		 254 aa  203  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0504196  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1600  ABC transporter related  45.45 
 
 		 260 aa  203  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3556  ABC transporter related protein  47.39 
 
 		 260 aa  201  6e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301945  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3112  ABC transporter related  44.54 
 
 		 261 aa  201  7e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.856974  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1364  ABC transporter related  48.15 
 
 		 278 aa  201  7e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.113543  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2601  ABC transporter related  45.31 
 
 		 258 aa  201  9.999999999999999e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2516  ABC transporter related protein  46.34 
 
 		 260 aa  201  9.999999999999999e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1033  ABC transporter related  46.25 
 
 		 265 aa  200  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2994  ABC transporter related  45.68 
 
 		 263 aa  200  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7024  ABC transporter related  44.58 
 
 		 275 aa  200  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5292  ABC transporter-related protein  46.47 
 
 		 260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.688621  normal  0.0485107 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1210  ABC transporter related  44.03 
 
 		 259 aa  199  3e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286528  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24380  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  46.67 
 
 		 275 aa  198  7e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.446861  normal  0.0741452 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2273  ABC transporter-like protein  46.25 
 
 		 257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0986317 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5186  ABC transporter related  49.17 
 
 		 272 aa  197  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1854  ABC transporter related  43.85 
 
 		 259 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1187  ABC transporter related  45.23 
 
 		 264 aa  196  3e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.401309  normal  0.155677 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2673  ABC transporter related protein  45 
 
 		 261 aa  196  3e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00128124  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27990  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  45.87 
 
 		 252 aa  195  7e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.145252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4187  ABC transporter related  42.11 
 
 		 265 aa  194  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0885  ABC transporter related  40 
 
 		 245 aa  193  2e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0800857 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1753  ABC transporter-like protein  44.21 
 
 		 257 aa  193  2e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0987723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3269  ABC transporter related  41.08 
 
 		 247 aa  193  2e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.704412 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0147  ABC transporter related  41.25 
 
 		 294 aa  193  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2511  ABC transporter related protein  44.44 
 
 		 276 aa  192  3e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5757  ABC transporter related  43.09 
 
 		 257 aa  192  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5304  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.92 
 
 		 255 aa  192  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.64898  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1972  ABC transporter related  44.96 
 
 		 269 aa  192  4e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5347  ABC transporter related  44.17 
 
 		 261 aa  191  8e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0071  ABC transporter related  44.13 
 
 		 259 aa  191  9e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1479  ABC transporter related  44.73 
 
 		 249 aa  191  9e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1574  ABC transporter related  45.04 
 
 		 261 aa  191  1e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.266375  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1504  ABC transporter related  44.58 
 
 		 257 aa  191  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3128  ABC transporter related protein  45.23 
 
 		 275 aa  189  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404447  hitchhiker  0.00266425 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4284  ABC transporter related protein  45.45 
 
 		 260 aa  190  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2583  ABC transporter-like protein  43.46 
 
 		 254 aa  190  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2840  ABC transporter related  42.86 
 
 		 260 aa  190  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.3845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2377  ABC transporter related  44.58 
 
 		 252 aa  189  4e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6227  ABC transporter related  42.55 
 
 		 256 aa  189  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1178  ABC sugar (xylose) transporter, ATPase subunit  42.44 
 
 		 260 aa  189  5e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2514  ABC transporter-like protein  41.8 
 
 		 284 aa  188  7e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.703565  normal  0.280675 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0183  ABC transporter related protein  41.7 
 
 		 285 aa  188  8e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3623  ABC transporter related protein  46.64 
 
 		 266 aa  188  8e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1210  ABC transporter  44.96 
 
 		 261 aa  187  9e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.986169  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1792  ABC transporter related  39.01 
 
 		 494 aa  187  9e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0113555  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5022  ABC transporter related  43.7 
 
 		 258 aa  187  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3688  ABC sugar transporter, ATPase subunit  45.42 
 
 		 261 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200201  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1857  sugar ABC transporter ATPase  40.59 
 
 		 288 aa  187  1e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3423  ABC transporter related  45.42 
 
 		 261 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111863  normal  0.794902 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1461  ABC transporter related protein  44.21 
 
 		 250 aa  187  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3352  ABC transporter related  43.15 
 
 		 265 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  37.92 
 
 		 503 aa  186  4e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1148  ABC transporter related  41.18 
 
 		 264 aa  186  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3176  ABC transporter related  44.59 
 
 		 263 aa  185  6e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.430068  normal  0.827076 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0548  ABC transporter related  43.1 
 
 		 266 aa  185  6e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0104  ABC transporter related  41.94 
 
 		 260 aa  184  9e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0560  ABC transporter related protein  45.78 
 
 		 256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4465  ABC transporter related  44.54 
 
 		 261 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0988  ABC sugar transporter, ATPase subunit  42.51 
 
 		 258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2648  ABC transporter related  42.51 
 
 		 258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0236  ABC transporter related  42.51 
 
 		 258 aa  182  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.762191 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2787  ABC transporter for sugar (aldose) ATP-binding protein  37.04 
 
 		 495 aa  182  5.0000000000000004e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0149064  normal  0.48477 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2617  ABC transporter related  42.02 
 
 		 260 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1667  ABC transporter related  38.49 
 
 		 502 aa  182  6e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.338027  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1375  ABC transporter related  40.24 
 
 		 257 aa  182  6e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.143315  normal  0.0808581 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2703  ABC transporter-related protein  42.08 
 
 		 258 aa  182  6e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.787131  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2863  ABC transporter related  37.34 
 
 		 518 aa  182  6e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.18747  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>