More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5304 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5304  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  100 
 
 		 255 aa  513  1.0000000000000001e-145  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.64898  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0260  ABC transporter related  48.59 
 
 		 260 aa  239  4e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.469491  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4284  ABC transporter related protein  50.6 
 
 		 260 aa  232  5e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1504  ABC transporter related  48.16 
 
 		 257 aa  217  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4339  ABC transporter related  44.08 
 
 		 263 aa  216  2.9999999999999998e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1210  ABC transporter related  45.45 
 
 		 259 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286528  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5292  ABC transporter-related protein  46.47 
 
 		 260 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.688621  normal  0.0485107 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5342  ABC transporter  43.98 
 
 		 249 aa  214  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6740  ABC transporter related protein  47.72 
 
 		 254 aa  213  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2673  ABC transporter related protein  47.3 
 
 		 261 aa  211  9e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00128124  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1921  ABC-type sugar transport system ATPase component  46.67 
 
 		 261 aa  210  1e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5948  ABC transporter related  45.04 
 
 		 313 aa  211  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2601  ABC transporter related  45.27 
 
 		 258 aa  209  3e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1972  ABC transporter related  45.68 
 
 		 269 aa  209  4e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1274  ABC transporter-like protein  44.26 
 
 		 244 aa  208  6e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.292913  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1600  ABC transporter related  43.95 
 
 		 260 aa  207  1e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0345  ABC transporter related  43.09 
 
 		 271 aa  206  3e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2852  ABC transporter related protein  46.48 
 
 		 265 aa  206  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.198198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1187  ABC transporter related  45.83 
 
 		 264 aa  206  4e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.401309  normal  0.155677 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4237  ABC transporter related  45.83 
 
 		 271 aa  205  5e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.413873  normal  0.20024 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0037  ABC transporter related protein  44.67 
 
 		 247 aa  205  5e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6694  ABC transporter related  47.35 
 
 		 262 aa  204  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.356782  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5339  ABC transporter related protein  47.11 
 
 		 278 aa  204  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6322  ABC transporter related  47.74 
 
 		 273 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.645186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2377  ABC transporter related  46.28 
 
 		 252 aa  203  2e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0241  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.15 
 
 		 288 aa  202  3e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2583  ABC transporter-like protein  42.08 
 
 		 254 aa  202  5e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0885  ABC transporter related  44.26 
 
 		 245 aa  202  6e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0800857 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1131  ABC transporter related  45.53 
 
 		 261 aa  201  8e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0806733 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24380  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  45.71 
 
 		 275 aa  201  9e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.446861  normal  0.0741452 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1574  ABC transporter related  44.58 
 
 		 261 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.266375  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3847  ABC transporter related  45.42 
 
 		 271 aa  200  9.999999999999999e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4592  ABC transporter related  50.68 
 
 		 273 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2813  ABC transporter related  47.33 
 
 		 276 aa  199  3e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (xylose)  47.33 
 
 		 277 aa  198  6e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3702  ABC sugar transporter, ATPase subunit  46.91 
 
 		 265 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1479  ABC transporter related  42.32 
 
 		 249 aa  197  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3437  ABC transporter related  46.91 
 
 		 265 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.196667  normal  0.174425 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4929  ABC transporter related  43.33 
 
 		 246 aa  196  3e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.663119 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5347  ABC transporter related  45 
 
 		 261 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2671  ABC transporter related protein  45.15 
 
 		 269 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000816223  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0266  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.75 
 
 		 286 aa  194  8.000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.079938  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1854  ABC transporter related  43.72 
 
 		 259 aa  194  9e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0548  ABC transporter related  39.67 
 
 		 266 aa  194  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2273  ABC transporter-like protein  47.3 
 
 		 257 aa  194  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0986317 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0775  ABC transporter  45.53 
 
 		 258 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0591265 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6092  ABC transporter related  43.39 
 
 		 253 aa  193  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1364  ABC transporter related  45.19 
 
 		 278 aa  193  2e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.113543  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1125  ABC transporter related protein  42.74 
 
 		 266 aa  193  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13168  normal  0.0632249 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3425  ABC transporter related  42.92 
 
 		 246 aa  192  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1753  ABC transporter-like protein  40.83 
 
 		 257 aa  192  6e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0987723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1276  ABC transporter related  42.04 
 
 		 264 aa  191  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.233639  normal  0.257082 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4211  ABC transporter related protein  44.21 
 
 		 276 aa  191  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3269  ABC transporter related  42.5 
 
 		 247 aa  190  2e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.704412 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2943  ABC transporter related  42.08 
 
 		 247 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3423  ABC transporter related  43.57 
 
 		 261 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111863  normal  0.794902 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3688  ABC sugar transporter, ATPase subunit  43.57 
 
 		 261 aa  188  8e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200201  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2511  ABC transporter related protein  40.91 
 
 		 276 aa  187  1e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0692  ABC transporter related  42.26 
 
 		 271 aa  187  1e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5243  ABC transporter related  41.15 
 
 		 245 aa  186  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7504  normal  0.303485 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3112  ABC transporter related  39.76 
 
 		 261 aa  185  5e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.856974  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1033  ABC transporter related  42.92 
 
 		 265 aa  185  5e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2516  ABC transporter related protein  42.34 
 
 		 260 aa  185  5e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0493  ABC transporter related  42.11 
 
 		 254 aa  185  7e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0504196  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1592  ABC transporter related  38.93 
 
 		 265 aa  184  9e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1339  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.56 
 
 		 259 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3341  ABC transporter related  40 
 
 		 262 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00439567  normal  0.282749 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6162  ABC transporter related  44.26 
 
 		 273 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000823533 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3556  ABC transporter related protein  40.49 
 
 		 260 aa  182  5.0000000000000004e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301945  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1833  ABC transporter related  39.76 
 
 		 259 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0147  ABC transporter related  39.92 
 
 		 294 aa  181  7e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6227  ABC transporter related  40.08 
 
 		 256 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1998  ABC transporter ATP-binding protein  37.39 
 
 		 248 aa  181  9.000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0341354  normal  0.212812 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5022  ABC transporter related  38.25 
 
 		 258 aa  180  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4052  ABC transporter related  40 
 
 		 282 aa  179  4e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.146234  normal  0.303462 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3969  ABC transporter related  42.49 
 
 		 254 aa  179  4e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0349444  normal  0.0435922 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5293  ABC transporter related  37.45 
 
 		 266 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0740635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2415  ABC transporter related  41.7 
 
 		 273 aa  179  4.999999999999999e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.133775  normal  0.475676 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0071  ABC transporter related  41.88 
 
 		 259 aa  179  4.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0503  ABC transporter related  40.96 
 
 		 264 aa  179  4.999999999999999e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2408  ABC transporter-related protein  40.89 
 
 		 267 aa  178  5.999999999999999e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1375  ABC transporter related  39.52 
 
 		 257 aa  178  7e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.143315  normal  0.0808581 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2703  ABC transporter-related protein  39.33 
 
 		 258 aa  178  7e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.787131  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2808  ABC transporter related  38.17 
 
 		 288 aa  178  8e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.163546  normal  0.337543 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1327  ABC sugar transporter, ATPase subunit  37.76 
 
 		 278 aa  178  8e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2994  ABC transporter related  42.32 
 
 		 263 aa  178  9e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2692  ABC transporter related protein  37.45 
 
 		 264 aa  178  9e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3623  ABC transporter related protein  43.16 
 
 		 266 aa  177  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2410  ABC transporter related  40 
 
 		 282 aa  177  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3128  ABC transporter related protein  42.19 
 
 		 275 aa  176  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404447  hitchhiker  0.00266425 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4851  ABC transporter related  39.17 
 
 		 262 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782543  normal  0.109166 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1461  ABC transporter related protein  39.43 
 
 		 250 aa  177  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7475  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.56 
 
 		 271 aa  176  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0837674  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2646  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  36.89 
 
 		 266 aa  176  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112475  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1427  ABC transporter related  40.85 
 
 		 266 aa  176  3e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000710187  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27990  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  42.68 
 
 		 252 aa  176  3e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.145252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0915  ABC transporter related  39.5 
 
 		 251 aa  176  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2617  ABC transporter related  37.39 
 
 		 260 aa  176  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5186  ABC transporter related  43.67 
 
 		 272 aa  176  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111705  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3352  ABC transporter related  40.66 
 
 		 265 aa  176  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>