More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0775 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_0775  ABC transporter  100 
 
 		 258 aa  517  1e-146  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0591265 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1479  ABC transporter related  72.06 
 
 		 249 aa  343  2e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2583  ABC transporter-like protein  66.13 
 
 		 254 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7475  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  62.15 
 
 		 271 aa  277  2e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0837674  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6162  ABC transporter related  63.22 
 
 		 273 aa  276  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000823533 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3423  ABC transporter related  59.75 
 
 		 261 aa  263  3e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111863  normal  0.794902 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3688  ABC sugar transporter, ATPase subunit  59.75 
 
 		 261 aa  262  4e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200201  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1274  ABC transporter-like protein  50.21 
 
 		 244 aa  237  1e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.292913  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1854  ABC transporter related  49.59 
 
 		 259 aa  236  2e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0037  ABC transporter related protein  51.24 
 
 		 247 aa  235  4e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5342  ABC transporter  45.45 
 
 		 249 aa  222  4e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5304  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  45.53 
 
 		 255 aa  214  9e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.64898  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5339  ABC transporter related protein  43.53 
 
 		 278 aa  212  4.9999999999999996e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0147  ABC transporter related  44.31 
 
 		 294 aa  211  9e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1921  ABC-type sugar transport system ATPase component  46.89 
 
 		 261 aa  211  9e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0560  ABC transporter related protein  50.45 
 
 		 256 aa  208  9e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4339  ABC transporter related  42.34 
 
 		 263 aa  207  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1574  ABC transporter related  44.49 
 
 		 261 aa  206  4e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.266375  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3269  ABC transporter related  43.1 
 
 		 247 aa  205  5e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.704412 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4929  ABC transporter related  44.77 
 
 		 246 aa  205  6e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.663119 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4284  ABC transporter related protein  44.9 
 
 		 260 aa  205  6e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1998  ABC transporter ATP-binding protein  44.17 
 
 		 248 aa  202  5e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0341354  normal  0.212812 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2703  ABC transporter-related protein  44.9 
 
 		 258 aa  202  5e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.787131  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2852  ABC transporter related protein  45.27 
 
 		 265 aa  202  5e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.198198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1753  ABC transporter-like protein  45.64 
 
 		 257 aa  201  6e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0987723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1131  ABC transporter related  45.87 
 
 		 261 aa  201  7e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0806733 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0885  ABC transporter related  42.32 
 
 		 245 aa  201  9e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0800857 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1187  ABC transporter related  45.8 
 
 		 264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.401309  normal  0.155677 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1125  ABC transporter related protein  45.42 
 
 		 266 aa  199  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13168  normal  0.0632249 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1504  ABC transporter related  44.58 
 
 		 257 aa  199  3.9999999999999996e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0503  ABC transporter related  44.14 
 
 		 264 aa  199  3.9999999999999996e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2617  ABC transporter related  43.25 
 
 		 260 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6740  ABC transporter related protein  45 
 
 		 254 aa  199  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3425  ABC transporter related  42.74 
 
 		 246 aa  198  7e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1178  ABC sugar (xylose) transporter, ATPase subunit  43.53 
 
 		 260 aa  198  7e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1600  ABC transporter related  43.95 
 
 		 260 aa  198  7e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5833  ABC transporter related  42.92 
 
 		 243 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150147  normal  0.748971 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4237  ABC transporter related  44.17 
 
 		 271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.413873  normal  0.20024 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2601  ABC transporter related  44.21 
 
 		 258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2840  ABC transporter related  43.53 
 
 		 260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.3845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1364  ABC transporter related  43.2 
 
 		 278 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.113543  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0548  ABC transporter related  45.24 
 
 		 266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2715  sugar (ribose) ABC transporter ATP-binding protein  45.06 
 
 		 261 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0375081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5948  ABC transporter related  44.17 
 
 		 313 aa  196  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0370  ABC transporter related  44.94 
 
 		 259 aa  196  3e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5292  ABC transporter-related protein  42.5 
 
 		 260 aa  196  3e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.688621  normal  0.0485107 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2511  ABC transporter related protein  43.15 
 
 		 276 aa  196  3e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4851  ABC transporter related  43.27 
 
 		 262 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782543  normal  0.109166 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5293  ABC transporter related  42.8 
 
 		 266 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0740635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0241  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.19 
 
 		 288 aa  196  4.0000000000000005e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5757  ABC transporter related  45.34 
 
 		 257 aa  196  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24380  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  45 
 
 		 275 aa  195  5.000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.446861  normal  0.0741452 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2943  ABC transporter related  41.91 
 
 		 247 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4211  ABC transporter related protein  44.3 
 
 		 276 aa  195  6e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3847  ABC transporter related  44.17 
 
 		 271 aa  195  6e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0071  ABC transporter related  45.8 
 
 		 259 aa  195  8.000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1210  ABC transporter related  42.5 
 
 		 259 aa  194  8.000000000000001e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286528  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5969  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  42.74 
 
 		 268 aa  194  9e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.354097  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  40.49 
 
 		 497 aa  194  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1375  ABC transporter related  42.86 
 
 		 257 aa  194  1e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.143315  normal  0.0808581 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (xylose)  45.7 
 
 		 277 aa  194  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0260  ABC transporter related  43.11 
 
 		 260 aa  194  1e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.469491  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2855  ABC transporter-related protein  45.04 
 
 		 274 aa  193  2e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5347  ABC transporter related  42.04 
 
 		 261 aa  194  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1972  ABC transporter related  45.34 
 
 		 269 aa  193  2e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2415  ABC transporter related  43.15 
 
 		 273 aa  193  3e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.133775  normal  0.475676 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0388  ribose import ATP-binding protein rbsA  44.17 
 
 		 261 aa  192  4e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.956313 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2514  ABC transporter-like protein  43.82 
 
 		 284 aa  192  4e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.703565  normal  0.280675 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4187  ABC transporter related  45.25 
 
 		 265 aa  192  4e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0345  ABC transporter related  42.4 
 
 		 271 aa  192  5e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2813  ABC transporter related  44.74 
 
 		 276 aa  192  5e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4579  ABC transporter related  42.41 
 
 		 265 aa  192  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00500559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0892  ABC sugar transporter, ATPase subunit  42.8 
 
 		 265 aa  192  6e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.68216 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2516  ABC transporter related protein  43.95 
 
 		 260 aa  191  7e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3594  ABC transporter related  41.77 
 
 		 266 aa  191  7e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2673  ABC transporter related protein  44.17 
 
 		 261 aa  191  8e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00128124  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2377  ABC transporter related  41.41 
 
 		 252 aa  191  8e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0266  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.19 
 
 		 286 aa  191  1e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.079938  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3702  ABC sugar transporter, ATPase subunit  43.62 
 
 		 265 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2410  ABC transporter related  41.3 
 
 		 282 aa  191  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1339  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  41.91 
 
 		 259 aa  190  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1833  ABC transporter related  41.49 
 
 		 259 aa  190  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3437  ABC transporter related  43.62 
 
 		 265 aa  190  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.196667  normal  0.174425 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4592  ABC transporter related  44.34 
 
 		 273 aa  190  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6694  ABC transporter related  42.86 
 
 		 262 aa  189  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.356782  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0104  ABC transporter related  41.8 
 
 		 260 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394211  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5022  ABC transporter related  42.8 
 
 		 258 aa  189  4e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0822  ABC transporter related  37.45 
 
 		 502 aa  189  5e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.688061  hitchhiker  0.00171866 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0183  ABC transporter related protein  42.62 
 
 		 285 aa  189  5e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2273  ABC transporter-like protein  44.17 
 
 		 257 aa  188  8e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0986317 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3352  ABC transporter related  43.72 
 
 		 265 aa  188  9e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0127  ABC transporter related  42.74 
 
 		 265 aa  187  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3112  ABC transporter related  43.33 
 
 		 261 aa  187  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.856974  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1461  ABC transporter related protein  40.73 
 
 		 250 aa  187  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6322  ABC transporter related  43.56 
 
 		 273 aa  186  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.645186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3176  ABC transporter related  44.83 
 
 		 263 aa  186  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.430068  normal  0.827076 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3556  ABC transporter related protein  46.09 
 
 		 260 aa  187  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301945  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1033  ABC transporter related  43.29 
 
 		 265 aa  187  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0128  ABC transporter related  43.15 
 
 		 260 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1134  ABC transporter related  39.92 
 
 		 506 aa  186  3e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000497905  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>