More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2516 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2516  ABC transporter related protein  100 
 
 
260 aa  509  1e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2994  ABC transporter related  80.08 
 
 
263 aa  383  1e-105  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2511  ABC transporter related protein  75.1 
 
 
276 aa  358  3e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27990  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  68.02 
 
 
252 aa  337  9.999999999999999e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.145252  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0750  ABC transporter related protein  70.93 
 
 
260 aa  335  5.999999999999999e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4211  ABC transporter related protein  60.82 
 
 
276 aa  294  8e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1921  ABC-type sugar transport system ATPase component  62.34 
 
 
261 aa  287  1e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3437  ABC transporter related  61.92 
 
 
265 aa  285  5e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.196667  normal  0.174425 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3702  ABC sugar transporter, ATPase subunit  61.92 
 
 
265 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0692  ABC transporter related  56.8 
 
 
271 aa  285  5.999999999999999e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6694  ABC transporter related  61.38 
 
 
262 aa  280  1e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.356782  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4592  ABC transporter related  59.76 
 
 
273 aa  278  5e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117213  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6322  ABC transporter related  59.76 
 
 
273 aa  277  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.645186  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2852  ABC transporter related protein  60.42 
 
 
265 aa  274  9e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.198198  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2813  ABC transporter related  59.5 
 
 
276 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0241  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  60.25 
 
 
288 aa  271  7e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (xylose)  59.83 
 
 
277 aa  269  2.9999999999999997e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0266  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  59.41 
 
 
286 aa  263  3e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.079938  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4339  ABC transporter related  54.07 
 
 
263 aa  254  1.0000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5339  ABC transporter related protein  54.66 
 
 
278 aa  253  2.0000000000000002e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5186  ABC transporter related  59.5 
 
 
272 aa  244  9e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111705  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4284  ABC transporter related protein  54.73 
 
 
260 aa  238  6.999999999999999e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0260  ABC transporter related  50.4 
 
 
260 aa  235  4e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.469491  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5292  ABC transporter-related protein  51.45 
 
 
260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.688621  normal  0.0485107 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1857  sugar ABC transporter ATPase  49.39 
 
 
288 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2377  ABC transporter related  52.03 
 
 
252 aa  229  2e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6092  ABC transporter related  51.22 
 
 
253 aa  230  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1187  ABC transporter related  54.29 
 
 
264 aa  226  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.401309  normal  0.155677 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1033  ABC transporter related  50.81 
 
 
265 aa  226  3e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2601  ABC transporter related  47.43 
 
 
258 aa  224  2e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1504  ABC transporter related  50.2 
 
 
257 aa  219  3e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3969  ABC transporter related  49.19 
 
 
254 aa  218  5e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0349444  normal  0.0435922 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5347  ABC transporter related  49.8 
 
 
261 aa  219  5e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6740  ABC transporter related protein  50 
 
 
254 aa  218  7e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0345  ABC transporter related  46.94 
 
 
271 aa  218  7.999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1131  ABC transporter related  50.42 
 
 
261 aa  216  2e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0806733 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1753  ABC transporter-like protein  46.43 
 
 
257 aa  216  2e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0987723  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0037  ABC transporter related protein  48.36 
 
 
247 aa  216  4e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4237  ABC transporter related  50.84 
 
 
271 aa  215  5e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.413873  normal  0.20024 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5022  ABC transporter related  45.9 
 
 
258 aa  213  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1972  ABC transporter related  50.21 
 
 
269 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2671  ABC transporter related protein  51.26 
 
 
269 aa  212  3.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000816223  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2673  ABC transporter related protein  50.41 
 
 
261 aa  212  5.999999999999999e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00128124  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4929  ABC transporter related  47.52 
 
 
246 aa  211  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.663119 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1574  ABC transporter related  47.89 
 
 
261 aa  210  2e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.266375  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3847  ABC transporter related  50 
 
 
271 aa  209  3e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0842  ABC transporter-related protein  47.11 
 
 
271 aa  209  4e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2273  ABC transporter-like protein  49.79 
 
 
257 aa  209  5e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0986317 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2583  ABC transporter-like protein  48.51 
 
 
254 aa  208  7e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24380  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  48.21 
 
 
275 aa  206  3e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.446861  normal  0.0741452 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1125  ABC transporter related protein  47.72 
 
 
266 aa  206  4e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13168  normal  0.0632249 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5948  ABC transporter related  47.35 
 
 
313 aa  202  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3425  ABC transporter related  46.34 
 
 
246 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3112  ABC transporter related  43.08 
 
 
261 aa  199  5e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.856974  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1210  ABC transporter related  48.78 
 
 
259 aa  198  6e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286528  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1364  ABC transporter related  48.15 
 
 
278 aa  198  6e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.113543  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3269  ABC transporter related  45.38 
 
 
247 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.704412 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3128  ABC transporter related protein  44.96 
 
 
275 aa  196  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404447  hitchhiker  0.00266425 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0147  ABC transporter related  46.41 
 
 
294 aa  196  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4993  ABC transporter related protein  45.31 
 
 
283 aa  197  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356987  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2943  ABC transporter related  45.08 
 
 
247 aa  196  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1998  ABC transporter ATP-binding protein  43.37 
 
 
248 aa  195  5.000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0341354  normal  0.212812 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2617  ABC transporter related  44.35 
 
 
260 aa  195  6e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2840  ABC transporter related  43.82 
 
 
260 aa  195  7e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.3845  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2703  ABC transporter-related protein  43.88 
 
 
258 aa  194  8.000000000000001e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.787131  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1178  ABC sugar (xylose) transporter, ATPase subunit  43.43 
 
 
260 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1274  ABC transporter-like protein  45.87 
 
 
244 aa  194  2e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.292913  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1600  ABC transporter related  43.39 
 
 
260 aa  193  3e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5342  ABC transporter  42.15 
 
 
249 aa  189  4e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1479  ABC transporter related  45.99 
 
 
249 aa  189  5e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0885  ABC transporter related  43.51 
 
 
245 aa  188  9e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0800857 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4465  ABC transporter related  42.91 
 
 
261 aa  188  9e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4187  ABC transporter related  40.71 
 
 
265 aa  187  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3623  ABC transporter related protein  44.9 
 
 
266 aa  187  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2927  ABC transporter related  42.13 
 
 
260 aa  186  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.625994 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1854  ABC transporter related  44.08 
 
 
259 aa  186  3e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5304  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.34 
 
 
255 aa  185  5e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.64898  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0892  ABC sugar transporter, ATPase subunit  43.37 
 
 
265 aa  185  6e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.68216 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0493  ABC transporter related  40.48 
 
 
254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0504196  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3688  ABC sugar transporter, ATPase subunit  44.35 
 
 
261 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200201  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3176  ABC transporter related  43.78 
 
 
263 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.430068  normal  0.827076 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0370  ABC transporter related  42.91 
 
 
259 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3423  ABC transporter related  44.35 
 
 
261 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111863  normal  0.794902 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3187  ABC transporter related  42.86 
 
 
260 aa  183  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.144281  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7024  ABC transporter related  44.67 
 
 
275 aa  182  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2415  ABC transporter related  42.57 
 
 
273 aa  182  4.0000000000000006e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.133775  normal  0.475676 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0104  ABC transporter related  40.54 
 
 
260 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394211  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5757  ABC transporter related  43.9 
 
 
257 aa  181  8.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4579  ABC transporter related  42.57 
 
 
265 aa  181  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00500559  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3594  ABC transporter related  42.91 
 
 
266 aa  180  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258671  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2855  ABC transporter-related protein  42.91 
 
 
274 aa  180  2e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2223  ABC transporter-related protein  40.61 
 
 
263 aa  180  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0935635 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1210  ABC transporter  43.25 
 
 
261 aa  179  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.986169  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1461  ABC transporter related protein  44.49 
 
 
250 aa  179  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2607  ABC transporter related  41.87 
 
 
260 aa  179  4e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.143234  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7475  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.03 
 
 
271 aa  179  4.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0837674  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0236  ABC transporter related  41.7 
 
 
258 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.762191 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6162  ABC transporter related  45.19 
 
 
273 aa  178  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000823533 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0071  ABC transporter related  41.37 
 
 
259 aa  178  8e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3104  ABC transporter related protein  45.23 
 
 
511 aa  178  9e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>