More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2927 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2927  ABC transporter related  100 
 
 
260 aa  525  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.625994 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3187  ABC transporter related  98.46 
 
 
260 aa  518  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.144281  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4465  ABC transporter related  93.46 
 
 
261 aa  475  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1210  ABC transporter  90 
 
 
261 aa  453  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.986169  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3112  ABC transporter related  82.56 
 
 
261 aa  441  1e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.856974  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2617  ABC transporter related  74.8 
 
 
260 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1178  ABC sugar (xylose) transporter, ATPase subunit  73.17 
 
 
260 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2840  ABC transporter related  73.58 
 
 
260 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.3845  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1998  ABC transporter ATP-binding protein  70.85 
 
 
248 aa  363  2e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0341354  normal  0.212812 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3176  ABC transporter related  71.95 
 
 
263 aa  356  1.9999999999999998e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.430068  normal  0.827076 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5022  ABC transporter related  67.48 
 
 
258 aa  337  9e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2703  ABC transporter-related protein  65.57 
 
 
258 aa  331  8e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.787131  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1753  ABC transporter-like protein  64.92 
 
 
257 aa  325  4.0000000000000003e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0987723  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2673  ABC transporter related protein  45.75 
 
 
261 aa  231  7.000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00128124  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5342  ABC transporter  48.59 
 
 
249 aa  231  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4237  ABC transporter related  45.04 
 
 
271 aa  229  3e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.413873  normal  0.20024 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1504  ABC transporter related  42.75 
 
 
257 aa  228  6e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5292  ABC transporter-related protein  42.86 
 
 
260 aa  227  1e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.688621  normal  0.0485107 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3847  ABC transporter related  45.04 
 
 
271 aa  226  2e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4339  ABC transporter related  44.4 
 
 
263 aa  226  3e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2377  ABC transporter related  46.28 
 
 
252 aa  226  4e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6740  ABC transporter related protein  45.45 
 
 
254 aa  224  7e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24380  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  44.4 
 
 
275 aa  224  8e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.446861  normal  0.0741452 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1131  ABC transporter related  44.86 
 
 
261 aa  223  2e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0806733 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1274  ABC transporter-like protein  47.74 
 
 
244 aa  222  6e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.292913  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1921  ABC-type sugar transport system ATPase component  47.46 
 
 
261 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0842  ABC transporter-related protein  45.9 
 
 
271 aa  221  9.999999999999999e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5948  ABC transporter related  41.91 
 
 
313 aa  219  5e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1033  ABC transporter related  45.34 
 
 
265 aa  217  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1972  ABC transporter related  46.43 
 
 
269 aa  215  7e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2273  ABC transporter-like protein  45.23 
 
 
257 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0986317 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1187  ABC transporter related  44.17 
 
 
264 aa  214  9.999999999999999e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.401309  normal  0.155677 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6694  ABC transporter related  44.07 
 
 
262 aa  213  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.356782  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1574  ABC transporter related  45.7 
 
 
261 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.266375  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0037  ABC transporter related protein  45.87 
 
 
247 aa  213  2.9999999999999995e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2852  ABC transporter related protein  46.22 
 
 
265 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.198198  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5347  ABC transporter related  40.89 
 
 
261 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1125  ABC transporter related protein  42.97 
 
 
266 aa  210  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13168  normal  0.0632249 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1465  ABC transporter related  43.9 
 
 
517 aa  210  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.748698  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1667  ABC transporter related  45.04 
 
 
502 aa  210  2e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.338027  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1425  ABC transporter related  43.9 
 
 
517 aa  209  3e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2671  ABC transporter related protein  41.73 
 
 
269 aa  209  4e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000816223  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1711  ABC transporter related  44.4 
 
 
517 aa  208  6e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0318504 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0289  ABC transporter related  44.77 
 
 
506 aa  208  6e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0345  ABC transporter related  44.58 
 
 
271 aa  208  7e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5339  ABC transporter related protein  42.68 
 
 
278 aa  208  8e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4683  ABC sugar transporter, ATPase subunit  43.98 
 
 
517 aa  208  9e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.532161  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2808  ABC transporter ATP-binding protein  43.57 
 
 
510 aa  207  2e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0493  ABC transporter related  42.8 
 
 
254 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0504196  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (xylose)  44.49 
 
 
277 aa  206  3e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6322  ABC transporter related  43.35 
 
 
273 aa  205  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.645186  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6092  ABC transporter related  43.57 
 
 
253 aa  205  5e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1461  ABC transporter related protein  42.98 
 
 
250 aa  204  8e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1063  ABC transporter related  43.57 
 
 
517 aa  204  9e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627623  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1543  ABC transporter related  43.57 
 
 
517 aa  204  9e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0849155  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1519  ABC transporter related  43.57 
 
 
517 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0747025  normal  0.022294 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0211  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  43.5 
 
 
517 aa  204  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40873  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  44.12 
 
 
506 aa  204  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  42.68 
 
 
496 aa  204  1e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  43.98 
 
 
499 aa  203  2e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2415  ABC transporter related  41.43 
 
 
273 aa  203  2e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.133775  normal  0.475676 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2516  ABC transporter related protein  42.29 
 
 
260 aa  203  3e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2511  ABC transporter related protein  42.44 
 
 
276 aa  202  4e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4284  ABC transporter related protein  41.22 
 
 
260 aa  202  5e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4592  ABC transporter related  43.35 
 
 
273 aa  202  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117213  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3437  ABC transporter related  44.84 
 
 
265 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.196667  normal  0.174425 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0071  ABC transporter related  45.22 
 
 
259 aa  201  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  44.12 
 
 
506 aa  200  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1600  ABC transporter related  42.32 
 
 
260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4211  ABC transporter related protein  41.28 
 
 
276 aa  200  1.9999999999999998e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3702  ABC sugar transporter, ATPase subunit  44.39 
 
 
265 aa  199  3e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  43.93 
 
 
507 aa  199  3e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2601  ABC transporter related  40.42 
 
 
258 aa  199  3e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  43.93 
 
 
507 aa  199  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0503  ABC transporter related  41.67 
 
 
264 aa  199  3e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0885  ABC transporter related  43.04 
 
 
245 aa  199  3.9999999999999996e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0800857 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  41.6 
 
 
508 aa  199  3.9999999999999996e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  43.93 
 
 
507 aa  199  3.9999999999999996e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2813  ABC transporter related  44.29 
 
 
276 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2863  ABC transporter related  42.56 
 
 
518 aa  199  5e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.18747  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4187  ABC transporter related  44.69 
 
 
265 aa  198  7e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  43.7 
 
 
517 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3269  ABC transporter related  43.22 
 
 
247 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.704412 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0692  ABC transporter related  40.83 
 
 
271 aa  197  2.0000000000000003e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0260  ABC transporter related  41.08 
 
 
260 aa  196  2.0000000000000003e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.469491  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0241  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.44 
 
 
288 aa  196  3e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1854  ABC transporter related  41.6 
 
 
259 aa  195  5.000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0147  ABC transporter related  42.23 
 
 
294 aa  195  5.000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1655  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.68 
 
 
517 aa  195  6e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0286  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  42.68 
 
 
517 aa  195  6e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0197  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  42.68 
 
 
517 aa  195  6e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  39.76 
 
 
503 aa  195  7e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3425  ABC transporter related  44.12 
 
 
246 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0104  ABC transporter related  40.64 
 
 
260 aa  194  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394211  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0236  ABC transporter related  45.54 
 
 
258 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.762191 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5597  ABC transporter related  40.59 
 
 
503 aa  193  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.609428  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4929  ABC transporter related  43.98 
 
 
246 aa  194  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.663119 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2994  ABC transporter related  42.11 
 
 
263 aa  192  4e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4608  ABC transporter related  43.93 
 
 
519 aa  192  4e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1653  ABC transporter related  43.7 
 
 
519 aa  192  5e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0555167  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>