More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3269 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3269  ABC transporter related  100 
 
 		 247 aa  496  1e-140  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.704412 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0885  ABC transporter related  78.66 
 
 		 245 aa  390  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0800857 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5342  ABC transporter  48.58 
 
 		 249 aa  240  2e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1274  ABC transporter-like protein  50.42 
 
 		 244 aa  231  6e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.292913  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0345  ABC transporter related  46.28 
 
 		 271 aa  224  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2601  ABC transporter related  45.93 
 
 		 258 aa  219  3e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4284  ABC transporter related protein  46.37 
 
 		 260 aa  219  3e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4592  ABC transporter related  48.57 
 
 		 273 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4339  ABC transporter related  45.04 
 
 		 263 aa  216  4e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0692  ABC transporter related  46.22 
 
 		 271 aa  215  5e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0493  ABC transporter related  43.15 
 
 		 254 aa  215  7e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0504196  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (xylose)  49.16 
 
 		 277 aa  214  8e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1364  ABC transporter related  45.45 
 
 		 278 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.113543  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1600  ABC transporter related  46.34 
 
 		 260 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3112  ABC transporter related  44.21 
 
 		 261 aa  212  3.9999999999999995e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.856974  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6322  ABC transporter related  47.76 
 
 		 273 aa  210  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.645186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1504  ABC transporter related  46.69 
 
 		 257 aa  210  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3702  ABC sugar transporter, ATPase subunit  48.32 
 
 		 265 aa  210  2e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3437  ABC transporter related  48.32 
 
 		 265 aa  210  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.196667  normal  0.174425 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1854  ABC transporter related  44.9 
 
 		 259 aa  209  4e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0548  ABC transporter related  44.81 
 
 		 266 aa  208  6e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1125  ABC transporter related protein  46.72 
 
 		 266 aa  208  8e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13168  normal  0.0632249 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2813  ABC transporter related  46.94 
 
 		 276 aa  206  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0037  ABC transporter related protein  45.49 
 
 		 247 aa  206  3e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4993  ABC transporter related protein  45.9 
 
 		 283 aa  206  4e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0147  ABC transporter related  41.43 
 
 		 294 aa  205  4e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6694  ABC transporter related  47.33 
 
 		 262 aa  206  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.356782  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2377  ABC transporter related  45.08 
 
 		 252 aa  205  6e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3128  ABC transporter related protein  45.75 
 
 		 275 aa  205  7e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404447  hitchhiker  0.00266425 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3688  ABC sugar transporter, ATPase subunit  45.64 
 
 		 261 aa  204  1e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200201  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0260  ABC transporter related  44.21 
 
 		 260 aa  204  1e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.469491  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3423  ABC transporter related  45.64 
 
 		 261 aa  204  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111863  normal  0.794902 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24380  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  46.69 
 
 		 275 aa  204  1e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.446861  normal  0.0741452 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0241  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.91 
 
 		 288 aa  204  1e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6092  ABC transporter related  43.8 
 
 		 253 aa  203  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1375  ABC transporter related  43.15 
 
 		 257 aa  202  3e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.143315  normal  0.0808581 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4211  ABC transporter related protein  45.68 
 
 		 276 aa  203  3e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5292  ABC transporter-related protein  42.21 
 
 		 260 aa  203  3e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.688621  normal  0.0485107 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2840  ABC transporter related  44.07 
 
 		 260 aa  202  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.3845  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2852  ABC transporter related protein  48.55 
 
 		 265 aa  202  4e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.198198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1921  ABC-type sugar transport system ATPase component  47.08 
 
 		 261 aa  202  4e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2855  ABC transporter-related protein  43.67 
 
 		 274 aa  202  4e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5339  ABC transporter related protein  43.39 
 
 		 278 aa  202  6e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0183  ABC transporter related protein  42.51 
 
 		 285 aa  201  7e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1178  ABC sugar (xylose) transporter, ATPase subunit  43.64 
 
 		 260 aa  201  8e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4237  ABC transporter related  46.31 
 
 		 271 aa  201  8e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.413873  normal  0.20024 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3623  ABC transporter related protein  45.34 
 
 		 266 aa  201  8e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1187  ABC transporter related  45.68 
 
 		 264 aa  201  9e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.401309  normal  0.155677 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4929  ABC transporter related  42.74 
 
 		 246 aa  200  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.663119 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2703  ABC transporter-related protein  43.88 
 
 		 258 aa  200  9.999999999999999e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.787131  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7475  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.5 
 
 		 271 aa  200  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0837674  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6227  ABC transporter related  44.67 
 
 		 256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1033  ABC transporter related  43.8 
 
 		 265 aa  200  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2600  ABC transporter related  44.09 
 
 		 257 aa  199  3e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3352  ABC transporter related  41.77 
 
 		 265 aa  199  5e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5969  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  42.8 
 
 		 268 aa  198  6e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.354097  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2583  ABC transporter-like protein  42.74 
 
 		 254 aa  198  6e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1461  ABC transporter related protein  43.44 
 
 		 250 aa  198  7e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3969  ABC transporter related  45.08 
 
 		 254 aa  198  7e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0349444  normal  0.0435922 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0266  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.5 
 
 		 286 aa  198  7.999999999999999e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.079938  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2617  ABC transporter related  43.64 
 
 		 260 aa  197  9e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1148  ABC transporter related  44.3 
 
 		 264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0104  ABC transporter related  42.8 
 
 		 260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394211  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2516  ABC transporter related protein  45.38 
 
 		 260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2514  ABC transporter-like protein  42.8 
 
 		 284 aa  197  1.0000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.703565  normal  0.280675 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0071  ABC transporter related  42.97 
 
 		 259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3847  ABC transporter related  45.9 
 
 		 271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5186  ABC transporter related  50.21 
 
 		 272 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1131  ABC transporter related  42.21 
 
 		 261 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0806733 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1210  ABC transporter related  46.22 
 
 		 259 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286528  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1998  ABC transporter ATP-binding protein  43.22 
 
 		 248 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0341354  normal  0.212812 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1753  ABC transporter-like protein  42.44 
 
 		 257 aa  196  3e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0987723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4187  ABC transporter related  43.44 
 
 		 265 aa  195  5.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3594  ABC transporter related  41.39 
 
 		 266 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258671  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2511  ABC transporter related protein  44.96 
 
 		 276 aa  195  5.000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3176  ABC transporter related  42.37 
 
 		 263 aa  195  6e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.430068  normal  0.827076 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0892  ABC sugar transporter, ATPase subunit  41.98 
 
 		 265 aa  194  7e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.68216 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4465  ABC transporter related  43.22 
 
 		 261 aa  194  8.000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0236  ABC transporter related  42.91 
 
 		 258 aa  194  8.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.762191 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0128  ABC transporter related  42 
 
 		 260 aa  194  9e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2943  ABC transporter related  41.49 
 
 		 247 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0915  ABC transporter related  42.67 
 
 		 251 aa  194  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0370  ABC transporter related  42.11 
 
 		 259 aa  193  2e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2273  ABC transporter-like protein  44.67 
 
 		 257 aa  193  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0986317 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0127  ABC transporter related  41.34 
 
 		 265 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7024  ABC transporter related  43.62 
 
 		 275 aa  193  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3425  ABC transporter related  41.08 
 
 		 246 aa  193  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1210  ABC transporter  43.75 
 
 		 261 aa  193  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.986169  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4579  ABC transporter related  41.98 
 
 		 265 aa  193  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00500559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1972  ABC transporter related  41.42 
 
 		 269 aa  193  2e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1479  ABC transporter related  44.3 
 
 		 249 aa  192  4e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3600  ABC transporter related protein  41.28 
 
 		 289 aa  191  6e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  40.25 
 
 		 501 aa  191  8e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3556  ABC transporter related protein  40.74 
 
 		 260 aa  191  9e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301945  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0988  ABC sugar transporter, ATPase subunit  42.91 
 
 		 258 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5757  ABC transporter related  42.62 
 
 		 257 aa  191  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6740  ABC transporter related protein  43.93 
 
 		 254 aa  191  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2648  ABC transporter related  42.91 
 
 		 258 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1574  ABC transporter related  43.33 
 
 		 261 aa  191  1e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.266375  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5948  ABC transporter related  43.62 
 
 		 313 aa  190  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>